UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1T08G5.2T08G5.26e-78chrV 14,025,155contains similarity to Homo sapiens Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1; ENSEMBL:ENSP00000312021
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3F14D7.5F14D7.5n/achrV 14,299,389contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Hypothetical protein.; TR:Q8ABS0
4F54B8.4F54B8.4n/achrV 15,816,808The F54B8.4 gene encodes a homolog of Death Associated Protein 1 (DAP-1) protein that may be involved in apoptosis.
5glb-15F35B12.8n/achrV 11,617,517glb-15 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
6srv-10F53F1.9n/achrV 13,424,568C. elegans SRV-10 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
7B0546.3B0546.3n/achrIV 3,380,351contains similarity to Pfam domain PF03226 Yippee putative zinc-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004910 (Yippee-like protein)
8T28A11.3T28A11.3n/achrV 3,275,745contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
9srg-40T19C4.4n/achrV 11,163,867C. elegans SRG-40 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
10srh-19F19G12.5n/achrX 1,414,840C. elegans SRH-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11fbxa-195R09B5.1n/achrV 1,435,696This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
12C49F5.5C49F5.5n/achrX 11,986,477contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
13B0207.10B0207.10n/achrI 5,959,278
14R160.5R160.5n/achrX 4,370,650
15flp-6F07D3.2n/achrV 9,472,810C. elegans FLP-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
16gst-11R11G1.3n/achrX 3,633,139C. elegans GST-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003080 (Glutathione S-transferase, alpha class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
17T22B2.2T22B2.2n/achrX 3,922,438
18T20D4.16T20D4.16n/achrV 3,394,536
19sre-20ZC455.7n/achrV 12,783,819C. elegans SRE-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
20Y5F2A.3Y5F2A.3n/achrIV 11,069,794contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
21K09H11.6K09H11.6n/achrV 5,735,411
22ZC412.1ZC412.1n/achrV 14,855,683contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23D1086.5D1086.5n/achrV 14,089,587contains similarity to Bison bonasus MHC class II DR-beta chain (Fragment).; TR:O19256
24T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
25C17B7.8C17B7.8n/achrV 3,322,428C17B7.8 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.8 has no clear orthologs in other organisms.
26K12H6.10K12H6.10n/achrII 2,822,965
27T27F2.4T27F2.4n/achrV 11,650,405contains similarity to Interpro domain IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
28acl-12C01C10.3n/achrX 7,440,941C. elegans ACL-12 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
29twk-7F22B7.7n/achrIII 8,638,816C. elegans TWK-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
30E02H4.4E02H4.4n/achrX 14,259,690contains similarity to Arabidopsis thaliana Uncharacterized protein At1g15830.1.; TR:Q3EDB7
31ceh-17D1007.1n/achrI 4,569,495ceh-17 encodes a phox-2-like homeodomain protein that is a member of the Q50 paired-like class of homeobox proteins and the vertebrate orthologue of Phox2a and Phox2b; that affects ALA and SIA axonal development; ceh-17 affects ALA and SIA antero-posterior axonal growth and navigation, and is expressed in five neurons of the ring ganglia (ALA and the 4 SIAs) with strongest expression in embryos and in L1 stage larvae.
32K03D3.2K03D3.2n/achrIV 16,328,334contains similarity to Sulfolobus tokodaii Hypothetical protein ST0074.; TR:Q976W5
33C03C10.7C03C10.7n/achrIII 4,096,446contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Profilin synthetic lethal protein, has region of coiled-coil structure; subunit of the Exocyst complex--the Exocyst complex contains the gene products encoded by SEC3, SEC5, SEC6, SEC8, SEC10, SEC15 and EXO70 and is required for exocytosis; SGD:YER008C
34C17B7.3C17B7.3n/achrV 3,343,332contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
35F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
36F46F5.15F46F5.15n/achrII 788,813
37C50A2.3C50A2.3n/achrIV 1,148,209
38F40G9.8F40G9.8n/achrIII 164,235
39C03A7.13C03A7.13n/achrV 5,191,814contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
40nhr-281F16B12.8n/achrX 14,112,277C. elegans NHR-281 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
41B0546.5B0546.5n/achrIV 3,389,078contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domain IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
42C12D5.4C12D5.4n/achrV 7,672,548
43C50F4.9C50F4.9n/achrV 9,523,727contains similarity to Streptococcus agalactiae Hypothetical protein.; TR:Q8E2N5
44E04F6.12E04F6.12n/achrII 7,217,217
45grl-8ZC487.5n/achrV 6,732,495grl-8 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
46R03H10.5R03H10.5n/achrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
47F53F4.1F53F4.1n/achrV 13,585,118contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
48Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
49F40B5.1F40B5.1n/achrX 8,376,670F40B5.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F40B5.1 has no clear orthologs in other organisms.
50srsx-2F20E11.2n/achrV 17,437,669C. elegans SRSX-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)