UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T08B2.12T08B2.122e-48chrI 6,231,810contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:Q6S6W0
2F36A4.3F36A4.3n/achrIV 4,269,952contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
3K06A5.2K06A5.2n/achrI 6,468,758contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
4F36A2.10F36A2.10n/achrI 8,819,797contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR005819 (Histone H5)
5F37A8.1F37A8.1n/achrIII 3,928,769contains similarity to Rattus norvegicus Myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase MRCK-beta.; TR:O54875
6C05C12.5C05C12.5n/achrIV 11,260,772contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ10106 fis, clone HEMBA1002569, highly similar to Homo sapiens protein associated with Myc mRNA (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000353197
7C14C11.1C14C11.1n/achrV 5,664,396
8snf-9C49C3.1n/achrIV 17,313,754C. elegans SNF-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
9F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
10ZC317.6ZC317.6n/achrV 5,467,199
11F36D1.4F36D1.4n/achrI 11,272,019contains similarity to Homo sapiens Splice isoform C-alpha of O95644 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 1; SW:O95644
12gst-9R05F9.5n/achrII 4,892,523gst-9 encodes a predicted glutathione S-transferase; by homology, GST-9 is predicted to play a role in the detoxification of environmental toxins and xenobiotics by transferring glutathione to reactive electrophilic compounds; however, as loss of gst-9 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of GST-9 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
13nspa-9C40H5.1n/achrX 11,739,026C. elegans NSPA-9 protein ;
14K01H12.4K01H12.4n/achrIV 9,714,029contains similarity to Simian T-lymphotropic virus 1 Rex p27 protein (Fragment).; TR:O12387
15C18G1.9C18G1.9n/achrV 4,768,777contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
16C24D10.2C24D10.2n/achrIV 5,163,991contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
17F26F4.2F26F4.2n/achrIII 4,911,567F26F4.2 encodes a novel protein with high similarity to C. elegans F37A8.1 and C. briggsae CBG18186.
18Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
19K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
20C45G9.4C45G9.4n/achrIII 5,063,224contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
21C02F5.5C02F5.5n/achrIII 8,236,454
22T27E7.1T27E7.1n/achrIV 14,520,345contains similarity to Bos taurus Annexin A7 (Annexin VII) (Synexin) (Fragment).; SW:ANX7_BOVIN
23ssq-4T28H11.1n/achrIV 5,017,101C. elegans SSQ-4 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR013286 (Annexin, type VII)
24nspd-4T23B7.1n/achrII 4,842,734C. elegans NSPD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domain IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
25Y43F8C.3Y43F8C.3n/achrV 19,618,472contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
26F08H9.2F08H9.2n/achrV 14,460,857contains similarity to Interpro domain IPR004064 (EDG-6 sphingosine 1-phosphate receptor)
27ZK938.1ZK938.1n/achrII 9,830,005contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
28C45G9.9C45G9.9n/achrIII 5,055,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
29F41G4.4F41G4.4n/achrX 16,830,293
30F36A4.4F36A4.4n/achrIV 4,267,908contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
31F26B1.1F26B1.14.0000000000000004e-39chrI 6,328,529contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
32F21H7.5F21H7.5n/achrV 16,238,153contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
33T22B3.3T22B3.3n/achrIV 11,703,476contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
34C25A8.1C25A8.1n/achrIV 7,011,175
35ZK1251.1ZK1251.1n/achrIV 9,683,245contains similarity to Pfam domains PF00808 (Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone) , PF00125 (Core histone H2A/H2B/H3/H4) contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core), IPR002119 (Histone H2A), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
36C43G2.3C43G2.3n/achrIV 6,578,783
37F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
38Y106G6H.13Y106G6H.13n/achrI 10,471,577contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q813N7
39gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
40C35E7.9C35E7.9n/achrI 10,807,562contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
41R10E4.7R10E4.7n/achrIII 4,295,916contains similarity to Interpro domain IPR015813 (Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core)
42C05B5.2C05B5.2n/achrIII 9,999,425contains similarity to Agrobacterium tumefaciens Peptide synthetase.; TR:Q8UBE4
43C09B9.2C09B9.2n/achrIV 5,030,143
44R02D5.7R02D5.7n/achrV 14,480,818contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
45C04F12.7C04F12.7n/achrI 9,696,226contains similarity to Legionella pneumophila CITA.; TR:O54543
46C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
47pph-2C29E6.3n/achrIV 11,876,957C. elegans PPH-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
48F35H8.4F35H8.4n/achrII 9,559,658contains similarity to Streptococcus pyogenes Hypothetical protein.; TR:Q8P0S2
49ssp-11T28H11.6n/achrIV 4,999,632C. elegans SSP-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
50Y106G6G.4Y106G6G.4n/achrI 10,322,489contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:P28968