UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srj-33T07C12.10chrV 9,936,513C. elegans SRJ-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2C44H4.6C44H4.6n/achrX 14,597,741contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
3F22D6.8F22D6.8n/achrI 7,099,204
4F37H8.2F37H8.2n/achrII 11,173,534contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Structural maintenance of chromosomes (SMC) protein; SGD:YOL034W
5srz-18F46B3.11n/achrV 20,622,846C. elegans SRZ-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001036 (Acriflavin resistance protein)
6str-141F47G9.27e-18chrV 11,323,048C. elegans STR-141 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7str-240K02H11.23e-22chrV 1,521,205C. elegans STR-240 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8sre-13C38C6.4n/achrII 14,635,649C. elegans SRE-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
9T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
10tba-5F16D3.1n/achrI 8,355,612tba-5 encodes one of nine C. elegans alpha tubulins; by homology, TBA-5 is predicted to be a component of microtubules; as loss of tba-5 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, TBA-5 likely functions redundantly with other alpha tubulins as a basic component of cellular architecture that may play additional roles in processes such as cell division, cell movement, and intracellular transport.
11T23D5.3T23D5.3n/achrV 15,733,239contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
12C02E7.8C02E7.8n/achrV 4,920,552
13srv-19H04M03.6n/achrIV 5,873,058C. elegans SRV-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14T27C5.8T27C5.8n/achrV 17,417,742contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domain IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164)
15srh-295ZK1037.8n/achrV 15,331,670C. elegans SRH-295 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16sri-9Y102A5C.29n/achrV 17,002,496C. elegans SRI-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B)
17F48C1.3F48C1.3n/achrI 5,314,472
18C24A8.5C24A8.5n/achrX 4,328,634
19srt-14ZC142.2n/achrV 4,255,024C. elegans SRT-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20F56C3.7F56C3.7n/achrX 1,370,660
21srh-281F11A5.10.0002chrV 16,191,496C. elegans SRH-281 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22T20B12.5T20B12.5n/achrIII 7,366,839
23twk-3M110.2n/achrII 8,211,638C. elegans TWK-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
24sru-25F31F4.14n/achrV 673,072C. elegans SRU-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
25C56E6.4C56E6.4n/achrII 6,527,652contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
26F44G3.10F44G3.10n/achrV 16,139,209F44G3.10 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; F44G3.10 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; F44G3.10 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
27F45F2.7F45F2.7n/achrV 8,523,135contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR004878 (Protein of unknown function DUF270), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
28srh-127F37B4.1n/achrV 2,894,429C. elegans SRH-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29nhr-268K06B4.6n/achrV 15,690,903C. elegans NHR-268 protein
30pop-1W10C8.2n/achrI 2,826,881pop-1 encodes an HMG box-containing protein that is the sole C. elegans member of the TCF/LEF family of transcription factors; in C. elegans, POP-1 functions as a component of the canonical and noncanonical Wnt signaling pathways that are required for cell migrations and binary cell fate decisions associated with asymmetric cell division, respectively; in yeast two-hybrid assays, the POP-1 N-terminal beta-catenin binding domain interacts with BAR-1/beta-catenin as well as with the more divergent beta-catenin, SYS-1; when coexpressed with SYS-1, POP-1 is able to activate transcription from a promoter with TCF binding sites; during development, maternally provided POP-1 is first detected in the nuclei of maturing oocytes and then in nearly all cells of the early embryo; in sister blastomeres in the early embryo, POP-1 is detected at lower levels in posterior blastomeres, such as E and P3, than in corresponding anterior blastomeres, MS and C; in later developmental stages, POP-1 is detected in a subset of tissues including hypodermal seam cells, gonadal precursors, and the developing vulva; in the vulva, POP-1 also exhibits an asymmetric staining pattern, with sister cells showing high or low levels of POP-1 depending upon their orientation along the anterior/posterior axis of the vulva.
31C49A9.7C49A9.7n/achrIV 6,203,875contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001681 (Neurokinin receptor), IPR005395 (Neuropeptide FF receptor), IPR005384 (Duffy antigen/chemokine receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32ZK353.5ZK353.5n/achrIII 8,394,543
33F23D12.1F23D12.1n/achrX 14,425,936contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE1252.; TR:Q8XKZ0
34T24D5.4T24D5.4n/achrX 12,597,224contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
35T02H6.10T02H6.10n/achrII 680,250
36str-198ZK285.10.000000000000003chrV 16,048,450C. elegans STR-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37K08D10.11K08D10.11n/achrIV 4,185,528
38sri-69Y102A5C.32n/achrV 17,007,786C. elegans SRI-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39sru-47F36D1.3n/achrI 11,290,448C. elegans SRU-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR015964 (Cytochrome C oxidase subunit II-like, transmembrane region), IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
40C29F9.9C29F9.9n/achrIII 98,659
41Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
42str-246W09D6.30.00000000000003chrIII 11,078,457C. elegans STR-246 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43srbc-66T24A6.5n/achrV 3,531,539C. elegans SRBC-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44C17E7.10C17E7.10n/achrV 3,899,486contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
45Y44A6D.1Y44A6D.1n/achrV 20,782,907contains similarity to Escherichia coli TraT.; TR:Q7WUD7
46Y56A3A.11Y56A3A.11n/achrIII 11,896,407contains similarity to Pfam domain PF01974 tRNA intron endonuclease, catalytic C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006677 (tRNA intron endonuclease, catalytic domain-like), IPR011856 (Endonuclease TnsA, N-terminal/resolvase Hjc/tRNA endonuclease, C-terminal)
47K02F3.7K02F3.7n/achrIII 836,776
48srt-59C18H7.8n/achrIV 601,062C. elegans SRT-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR006058 (2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
49C50H2.5C50H2.5n/achrV 9,919,252contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
50srv-8F53F1.7n/achrV 13,419,959C. elegans SRV-8 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002456 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)