UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1hcp-2T06E4.10chrV 9,648,041C. elegans HCP-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003914 (Rabaptin)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3R10E4.7R10E4.7n/achrIII 4,295,916contains similarity to Interpro domain IPR015813 (Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core)
4col-174F46C8.2n/achrX 7,547,524C. elegans COL-174 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
5W06H3.1W06H3.1n/achrV 16,791,022contains similarity to Mus musculus 16 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library,sclone:I920192H21 product:inner membrane protein, mitochondrial, fullsinsert sequence.; TR:Q3TEY5
6F33H2.8F33H2.8n/achrI 15,032,079contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBJ6
7F35C11.2F35C11.2n/achrII 8,245,233contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
8ucr-2.3T24C4.1n/achrIII 880,647T24C4.1 encodes an ubiquinol-cytochrome C reductase complex core protein 2 ortholog, predicted by Eisenberg and coworkers to be mitochondrial, and required for germline maintenance in mass RNAi assays.
9F46F5.7F46F5.7n/achrII 819,594contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
10F29C4.6F29C4.6n/achrIV 120,551contains similarity to Pfam domain PF01171 PP-loop family contains similarity to Interpro domains IPR011063 (PP-loop), IPR012089 (PP-loop ATPase, YdaO-related), IPR000541 (Protein of unknown function UPF0021), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold)
11F55A12.1F55A12.1n/achrI 5,370,477contains similarity to Pfam domains PF02170 (PAZ domain) , PF02171 (Piwi domain) contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ), IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
12pod-1Y76A2B.1n/achrIII 13,519,397The pod-1 gene encodes a coronin-like protein required for asymmetry along the anterior-posterior axis at the beginning of embryonic development.
13F36A4.3F36A4.3n/achrIV 4,269,952contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
14C10C5.4C10C5.4n/achrIV 9,379,502contains similarity to Pfam domains PF01546 (Peptidase family M20/M25/M40) , PF07687 (Peptidase dimerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR010159 (N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase), IPR011650 (Peptidase M20, dimerisation), IPR002933 (Peptidase M20), IPR001261 (ArgE/DapE/ACY1/CPG2/YscS, conserved site)
15F30A10.4F30A10.4n/achrI 9,485,166contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
16srg-6T12A2.13n/achrIII 6,265,179C. elegans SRG-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003919 (Cellulose synthase, subunit A), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
17W09C3.2W09C3.2n/achrI 4,712,438contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Putative uncharacterized protein.; TR:A2E5Y7
18C06E7.4C06E7.4n/achrIV 5,855,392contains similarity to Human cytomegalovirus Protein UL53 (Protein HFRF2).; SW:P16794
19F54C1.8F54C1.8n/achrI 5,005,486
20F01G4.4F01G4.4n/achrIV 11,144,606contains similarity to Myxococcus xanthus Pseudouridine synthase (EC 5.4.99.-).; TR:Q1D5Q2
21T25B9.5T25B9.5n/achrIV 10,753,481contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
22C45G9.4C45G9.4n/achrIII 5,063,224contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
23F44E7.2F44E7.2n/achrV 5,771,094contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA), IPR006349 (2-phosphoglycolate phosphatase, eukaryotic), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
24C18G1.9C18G1.9n/achrV 4,768,777contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
25C48B4.3C48B4.3n/achrIII 9,581,690contains similarity to Streptococcus pyogenes M protein, serotype 2.1 precursor.; SW:M21_STRPY
26C05B5.2C05B5.2n/achrIII 9,999,425contains similarity to Agrobacterium tumefaciens Peptide synthetase.; TR:Q8UBE4
27gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
28C55C3.4C55C3.4n/achrIV 5,677,163contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
29ZC317.6ZC317.6n/achrV 5,467,199
30K06A5.2K06A5.2n/achrI 6,468,758contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
31F36D1.4F36D1.4n/achrI 11,272,019contains similarity to Homo sapiens Splice isoform C-alpha of O95644 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 1; SW:O95644
32Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
33scl-22T05A10.5n/achrX 10,790,085C. elegans SCL-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
34F26F4.2F26F4.2n/achrIII 4,911,567F26F4.2 encodes a novel protein with high similarity to C. elegans F37A8.1 and C. briggsae CBG18186.
35C28D4.4C28D4.4n/achrIV 9,744,359contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
36K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
37Y14H12B.2Y14H12B.2n/achrII 3,932,952contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
38F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
39Y65A5A.2Y65A5A.2n/achrIV 16,413,511contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for invasion and pseudohyphae formation in response to nitrogen starvation; SGD:YIR019C
40T16A9.5T16A9.5n/achrV 14,214,256contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
41ZK354.8ZK354.8n/achrIV 5,305,065contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
42W03A5.5W03A5.5n/achrIII 5,439,347
43ZK637.15ZK637.15n/achrIII 8,920,543contains similarity to Ureaplasma parvum Hypothetical membrane lipoprotein.; TR:Q9PQR8
44F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
45pat-2F54F2.1n/achrIII 8,821,993pat-2 encodes an alpha integrin subunit; during embryogenesis, pat-2 is essential for body wall muscle assembly and function and hence, proper elongation and hatching.
46T10H9.3T10H9.3n/achrV 6,654,528contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
47ZK550.1ZK550.1n/achrIV 17,240,852contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
48ZK84.1ZK84.1n/achrII 6,021,961contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003980 (Histamine H3 receptor)
49let-711F57B9.2n/achrIII 6,952,757let-711 encodes the C. elegans ortholog of NOT1, the conserved core component of the multisubunit CCR4/NOT complex that plays a role in regulation of gene expression via various processes including transcriptional control, mRNA deadenylation, and protein ubiquitination; in C. elegans, let-711 activity is essential for embryonic and larval development and in particular, for proper spindle positioning, microtubule length, and centrosome morphology in early embryos; in addition, let-711 is essential for normal germline development and levels of fertility; in embryos, let-711 mutations can suppress the short microtubule phenotype produced by mutations in zyg-9, which encodes the C. elegans XMAP125 homolog, and centrosomoal ZYG-9 levels are increased in let-711 mutants, suggesting that let-711 functions, in part, by negatively regulating ZYG-9 levels or localization; in situ hybridization studies indicate that let-711 mRNA is broadly expressed in the gonad and that its gonadal expression is negatively regulated by lin-35/Rb.
50F07A5.2F07A5.2n/achrI 7,353,071contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Serine/arginine repetitive matrix protein 2; ENSEMBL:ENSP00000371738