UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxa-196T05H4.20chrV 6,449,403This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
2Y51B9A.3Y51B9A.3n/achrII 9,406,276contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
3ZK930.4ZK930.4n/achrII 11,908,092contains similarity to Homo sapiens Similar to hypothetical protein FLJ20094; ENSEMBL:ENSP00000324274
4F36H12.4F36H12.4n/achrIV 5,269,346
5F59A6.2F59A6.2n/achrII 5,015,006contains similarity to Homo sapiens High mobility group protein 1-like 10; ENSEMBL:ENSP00000215935
6clec-134W10G11.11n/achrII 3,580,752C. elegans CLEC-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
7F23C8.7F23C8.7n/achrI 2,423,740contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
8C08F8.4C08F8.4n/achrIV 11,158,277contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
9B0207.9B0207.9n/achrI 5,957,923
10Y45F10B.3Y45F10B.3n/achrIV 13,593,732contains similarity to Saccharomyces cerevisiae N-terminal domain appears to be involved in cellular responsiveness to RAS.; SGD:YNL138W
11ZK930.7ZK930.7n/achrII 11,914,880contains similarity to Homo sapiens Mucin; TR:Q14851
12T20F5.5T20F5.5n/achrI 3,918,806contains similarity to Homo sapiens Isoform E of Proteoglycan-4 precursor; ENSEMBL:ENSP00000356454
13ZC581.2ZC581.2n/achrI 6,656,611contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14R03D7.5R03D7.5n/achrII 10,948,319contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15dct-9W03F11.3n/achrI 2,234,343C. elegans DCT-9 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
16F33D11.2F33D11.2n/achrI 5,848,329contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
17Y45F10B.8Y45F10B.8n/achrIV 13,577,771contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin)
18dlc-6Y106G6G.3n/achrI 10,323,861dlc-6 encodes a putative dynein light chain 1; DLC-6 is orthologous to human DYNLL1 (OMIM:601562) and DYNLL2 (OMIM:608942), but much more divergent from them than its paralog DLC-1; DLC-6's other paralogs are DLC-2/-5; DLC-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
19Y51A2B.6Y51A2B.6n/achrV 18,393,120contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
20M162.7M162.7n/achrV 19,789,204contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
21K06H7.8K06H7.8n/achrIII 8,097,370contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
22K07A12.5K07A12.5n/achrI 8,694,231contains similarity to Plasmodium falciparum Glutamic acid-rich protein precursor.; SW:GARP_PLAFF
23Y45F10B.2Y45F10B.2n/achrIV 13,595,366contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_6700.; TR:Q98PP9
24C33F10.12C33F10.12n/achrII 4,837,006contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
25B0252.5B0252.5n/achrII 6,917,923
26W02A2.8W02A2.8n/achrIV 13,356,775
27T08H10.4T08H10.4n/achrV 4,480,975contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
28C25A8.2C25A8.2n/achrIV 7,010,276contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
29Y57G11C.6Y57G11C.6n/achrIV 14,759,618contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
30F46F5.6F46F5.6n/achrII 814,673contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
31B0334.10B0334.10n/achrII 11,518,945contains similarity to Vaccinia virus TB17L.; TR:Q9JF36
32F42G8.8F42G8.8n/achrIV 8,120,646contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
33ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
34F02E9.3F02E9.3n/achrI 8,405,244contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein required for the decapping of mRNAs, functions to allow the production of active Dcp1p, contains a pyrophosphatase MutT motif and several alpha-helical leucine-rich motifs; SGD:YNL118C
35AH6.3AH6.3n/achrII 9,519,577contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
36F46F5.9F46F5.9n/achrII 822,679contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
37B0218.5B0218.5n/achrIV 8,155,831contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
38spe-8F53G12.6n/achrI 119,489C. elegans SPE-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
39Y18D10A.21Y18D10A.21n/achrI 12,930,221contains similarity to Watermelon silver mottle virus L protein.; TR:Q9DSQ1
40F13E9.5F13E9.5n/achrIV 10,883,638contains similarity to Helicobacter pylori;Helicobacter pylori J99 Hypothetical protein HP0031/JHP0027.; SW:Y031_HELPY
41K10H10.7K10H10.7n/achrII 14,507,311contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
42ZC513.3ZC513.3n/achrV 8,048,266
43T05D4.5T05D4.5n/achrIII 13,582,099contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR000533 (Tropomyosin)
44Y38F1A.7Y38F1A.7n/achrII 12,997,333contains similarity to Pseudomonas aeruginosa Probable periplasmic spermidine/putrescine-binding protein.; TR:Q9I3T4
45R102.7R102.7n/achrIV 10,703,834
46T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
47C50D2.3C50D2.3n/achrII 106,848contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
48K09C6.8K09C6.8n/achrV 841,718contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
49Y113G7C.1Y113G7C.1n/achrV 20,316,312contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000217 (Tubulin), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
50ZC412.9ZC412.9n/achrV 14,881,691contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631