UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ferl-1T05E8.10chrI 5,457,629C. elegans FERL-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00168 (C2 domain) , PF08165 (FerA (NUC095) domain) , PF08150 (FerB (NUC096) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012561 (FerB), IPR006614 (Dysferlin, C-terminal), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR012560 (FerA), IPR006613 (Dysferlin, N-terminal), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
2D2062.5D2062.5n/achrII 2,623,045
3ani-1Y49E10.19n/achrIII 12,449,658ani-1 encodes one of three C. elegans anillins; ANI-1 activity is required in the early embryo for cortical contractile events, including polar body extrusion, membrane ruffling, and pseudocleavage; at later stages of development, ANI-1 also plays a role in cuticle formation, coordinated locomotion, vulval development, and male tail formation; in regulating cortical events, ANI-1 appears to function by positively regulating septin (UNC-59 and UNC-61) localization to the contractile ring as well as formation of septin- and NMY-2-containing cortical patches; in telophase embryos, ANI-1 localizes to the cell cortex and cleavage furrow.
4T15H9.5T15H9.5n/achrII 9,610,953contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q55FI4
5T05C12.9T05C12.9n/achrII 8,192,426contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF02149 (Kinase associated domain 1) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001772 (Kinase-associated KA1), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
6F28A10.1F28A10.1n/achrII 826,849F28A10.1 encodes a putative small-molecule methyltransferase, belonging to a large nematode-specific expanded family; F28A10.1 inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51; F28A10.1 is expressed in neurons, and F28A10.1 transcripts are enriched in spermatogenesis; although F's obvious homologs are all Caenorhabditis proteins, it has distant similarity to 31-O-demethyl-FK506 methyltransferase (FkbM) from Streptomyces, to other bacterial FkbM homologs, and to other metazoan homologs such as human LOC728464.
7F41D3.7F41D3.7n/achrI 12,267,272contains similarity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus ORF 5 (Fragment).; TR:O71053
8F28A10.3F28A10.3n/achrII 840,846
9W01B6.8W01B6.8n/achrIV 10,083,904contains similarity to Xenopus laevis Nuclear/mitotic apparatus protein.; TR:P70012
10Y62H9A.8Y62H9A.8n/achrX 11,891,763contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IEC0
11F47C12.6F47C12.6n/achrIV 3,991,939contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
12F28A10.4F28A10.4n/achrII 844,685contains similarity to Interpro domain IPR009061 (Putative DNA binding)
13srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14F32B6.4F32B6.4n/achrIV 9,891,311contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Mus musculus (Mouse). 13 days embryo male testis cDNA,sRIKEN full-length enriched library, clone:6030407P11 product:NIMAs(Never in mitosis gene a)-related expressed kinase 1, full insertssequence.; TR:Q86I06
15clec-261ZC15.6n/achrV 20,287,601C. elegans CLEC-261 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000817 (Prion protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
16F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
17numr-1F08F8.5n/achrIII 7,362,966C. elegans NUMR-1 protein ;
18F25H5.2F25H5.2n/achrI 9,180,480
19W07G4.2W07G4.2n/achrV 13,035,710contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
20Y70G10A.2Y70G10A.2n/achrIII 10,229,611contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
21R02F2.6R02F2.6n/achrIII 5,478,761
22clec-99ZK39.8n/achrI 11,157,780C. elegans CLEC-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
23sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
25F35C5.4F35C5.4n/achrII 12,891,236contains similarity to Homo sapiens Mucin-2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000351956
26F14D7.1F14D7.1n/achrV 14,289,203contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domain IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
27srh-166Y38H6C.12n/achrV 20,520,671C. elegans SRH-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28F37A8.2F37A8.2n/achrIII 3,930,465contains similarity to Homo sapiens Protein transport protein Sec24B; ENSEMBL:ENSP00000265175
29str-162E03H12.1n/achrIV 4,993,123C. elegans STR-162 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30C46E10.1C46E10.1n/achrII 3,725,048contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
31D1037.5D1037.5n/achrI 3,692,099contains similarity to Pfam domains PF01734 (Patatin-like phospholipase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR002110 (Ankyrin)
32F14F9.5F14F9.5n/achrV 5,128,571contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domain IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
33C50H2.7C50H2.7n/achrV 9,923,573contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
34C18H7.7C18H7.7n/achrIV 596,081
35K05F1.1K05F1.1n/achrII 5,802,499contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
36W04E12.4W04E12.4n/achrV 19,740,082contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Kelch-repeat protein, similar to Kel1 and Kel2; SGD:YPL263C
37clec-124C17F4.1n/achrII 3,250,580C. elegans CLEC-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
38B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
39T21E3.2T21E3.2n/achrI 3,931,189contains similarity to Homo sapiens 55 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000273725
40M28.9M28.9n/achrII 10,641,581contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000024599
41Y54E5A.3Y54E5A.3n/achrI 14,698,399contains similarity to Escherichia coli Orf732.; TR:Q46767
42C05B5.1C05B5.1n/achrIII 9,987,900contains similarity to Clostridium acetobutylicum Membrane associated chemotaxis sensory transducer protein (MSPsdomain and HAMP domain).; TR:Q97JD4
43F35C5.1F35C5.1n/achrII 12,881,287contains similarity to Saccharomyces cerevisiae B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A); SGD:YOR014W
44H32C10.1H32C10.1n/achrIV 5,935,928contains similarity to Interpro domains IPR006353 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, CECR5), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA)
45C25G4.7C25G4.7n/achrIV 12,457,730contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
46F28A10.9F28A10.9n/achrII 834,544contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
47ZC132.2ZC132.2n/achrV 4,311,620
48W03D8.2W03D8.2n/achrI 2,799,577contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
49C32D5.4C32D5.4n/achrII 6,322,171
50K09C6.7K09C6.7n/achrV 837,078contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)