UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T05E11.6T05E11.60chrIV 11,109,297contains similarity to Pfam domain PF01650 Peptidase C13 family contains similarity to Interpro domain IPR001096 (Peptidase C13, legumain)
2srt-17F48G7.6n/achrV 624,474C. elegans SRT-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
3C02F12.8C02F12.8n/achrX 3,691,690contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
4T05D4.3T05D4.3n/achrIII 13,568,545contains similarity to Interpro domain IPR005838 (Type III secretion system inner membrane P protein)
5acr-18F28F8.1n/achrV 15,555,125acr-18 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; ACR-18 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, apparently unique to nematodes, which includes DEG-3, DES-2, ACR-5, ACR-17, ACR-20, and ACR-23.
6C18B10.6C18B10.6n/achrV 7,480,150contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
7str-25F44G3.11n/achrV 16,116,262C. elegans STR-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8nph-1M28.7n/achrII 10,650,519nph-1 encodes a novel, SH3 domain-containing protein that is orthologous to mammalian nephrocystin-1.
9F58E1.4F58E1.4n/achrII 1,680,715contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
10K09F6.5K09F6.5n/achrII 2,272,724contains similarity to Interpro domain IPR000358 (Ribonucleotide reductase)
11T20G5.10T20G5.10n/achrIII 10,211,438contains similarity to Pfam domain PF06320 GCN5-like protein 1 (GCN5L1) contains similarity to Interpro domain IPR009395 (GCN5-like 1)
12F36D3.1F36D3.1n/achrV 16,501,082contains similarity to Interpro domain IPR008928 ()
13T24D1.2T24D1.2n/achrI 9,954,687contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
14lgc-45W10G11.16n/achrII 3,566,681C. elegans LGC-45 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
15hil-8T05E8.2n/achrI 5,467,787C. elegans HIL-8 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005818 (Histone H1/H5)
16C17B7.5C17B7.5n/achrV 3,336,321contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
17ZK1193.3ZK1193.3n/achrX 418,922contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
18nhr-231Y17D7B.1n/achrV 18,792,886C. elegans NHR-231 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
19Y54G11A.9Y54G11A.9n/achrII 14,345,333contains similarity to Pfam domain PF01521 Iron-sulphur cluster biosynthesis contains similarity to Interpro domains IPR016092 (HesB/YadR/YfhF), IPR000361 (HesB/YadR/YfhF-like)
20cyp-14A1K09A11.2n/achrX 13,266,131C. elegans CYP-14A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
21math-30F52C6.5n/achrII 1,908,950C. elegans MATH-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
22rhr-2B0240.1n/achrV 11,729,008rhr-2 encodes a predicted transmembrane protein with similarity to human Rh blood group antigens proposed to function in inorganic ion transport and metabolism; the role of RHR-2 in C. elegans development or behavior remains unclear, as loss of RHR-2 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities.
23T14C1.2T14C1.2n/achrX 14,400,452contains similarity to Homo sapiens MHC class I molecule; ENSEMBL:ENSP00000252229
24K02E7.10K02E7.10n/achrII 1,066,288contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
25F28C6.9F28C6.9n/achrII 8,609,707contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0562; ENSEMBL:ENSP00000263739
26ZC250.2ZC250.2n/achrV 5,793,898contains similarity to Pfam domain PF00535 Glycosyl transferase family 2 contains similarity to Interpro domain IPR001173 (Glycosyl transferase, family 2)
27mrp-2F57C12.4n/achrX 568,214mrp-2 encodes a predicted multidomain transmembrane protein that is a member of the ATP-binding cassette (ABC) superfamily of transport proteins and is homologous to the human multidrug resistance-associated protein 1 (MRP1, OMIM:158343); by homology, MRP-2 is predicted to function as a membrane pump that couples the energy of ATP hydrolysis to membrane transport; as loss of MRP-2 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of MRP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; mrp-2 expression is, however, upregulated early in the exit from the alternative dauer stage and then remains induced, suggesting that MRP-2 activity is required for the transition to, and maintenance of, a more active metabolic state.
28str-228C07G3.5n/achrV 3,511,106C. elegans STR-228 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29F38E1.6F38E1.6n/achrV 8,360,585contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
30ZK112.4ZK112.4n/achrIII 7,729,788
31K10D11.3K10D11.3n/achrIV 12,984,093contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
32B0285.6B0285.6n/achrIII 4,354,080B0285.6 encodes a predicted sodium-coupled carboxylate transporter that is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy and the mammalian NaDC1 and NaDC3 transporters; B0285.6::lacZ reporter fusions are expressed in the excretory cell, from early larval stages through adulthood, with some later expression occasionally seen in two large unidentified structures on the dorsal side of the pharyngeal terminal bulb.
33B0454.5B0454.5n/achrII 3,039,835contains similarity to Homo sapiens 21 kDa protein; VG:OTTHUMP00000165983
34srh-25C54D10.6n/achrV 12,433,068C. elegans SRH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35K09C4.10K09C4.10n/achrX 3,278,116contains similarity to Staphylococcus aureus Serine-rich adhesin for platelets precursor (Staphylococcus aureusssurface protein A).; SW:Q7A362
36T28F2.7T28F2.7n/achrI 3,658,340contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
37twk-36R12G8.2n/achrV 17,745,322C. elegans TWK-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
38T15B7.13T15B7.13n/achrV 6,827,999contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39F39G3.2F39G3.2n/achrV 4,739,477contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
40R13.3R13.3n/achrIV 10,830,875contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
41F26F2.5F26F2.5n/achrV 20,569,246contains similarity to Homo sapiens zinc finger protein 318; ENSEMBL:ENSP00000302698
42R11D1.7R11D1.7n/achrV 12,721,371contains similarity to Mycoplasma capricolum Hypothetical 37.9 kDa protein in ptsH 3'region (ORF1).; SW:YPH1_MYCCA
43srw-16T10H4.5n/achrV 15,274,096C. elegans SRW-16 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor)
44C04C3.7C04C3.7n/achrIV 3,433,232contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45C18E3.5C18E3.5n/achrI 4,198,275contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR001632 (G-protein, beta subunit), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
46F36F12.4F36F12.4n/achrV 2,089,002contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
47srh-104F21H7.7n/achrV 16,243,471C. elegans SRH-104 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48C09G9.2C09G9.2n/achrIV 8,868,853contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
49srw-127C33G8.1n/achrV 7,013,646C. elegans SRW-127 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50M02B7.5M02B7.5n/achrIV 3,813,489contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF01369 (Sec7 domain) contains similarity to Interpro domains IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000904 (SEC7-like)