UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T05A8.2T05A8.21e-121chrII 2,710,658
2B0507.7B0507.7n/achrV 8,757,284contains similarity to Pfam domains PF04960 (Glutaminase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR015868 (Glutaminase, core), IPR007043 (Glutaminase), IPR012338 (Beta-lactamase-type transpeptidase fold), IPR002110 (Ankyrin)
3T16H12.2T16H12.2n/achrIII 10,086,574contains similarity to Mus musculus 2310010I16Rik protein.; TR:Q9CWH8
4F54D12.4F54D12.4n/achrII 1,368,200
5D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
6C14B9.8C14B9.8n/achrIII 8,142,045C14B9.8 is orthologous to the human gene PHOSPHORYLASE KINASE, LIVER, ALPHA-2 SUBUNIT (PHKA2; OMIM:306000), which when mutated leads to liver glycogenosis.
7lgc-17T01H10.6n/achrX 12,123,239C. elegans LGC-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
8T26H5.4T26H5.4n/achrV 15,447,864contains similarity to Homo sapiens Basic helix-loop-helix protein 5; ENSEMBL:ENSP00000318799
9F49C12.4F49C12.4n/achrIV 9,303,356contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
10mut-7ZK1098.8n/achrIII 9,540,593mut-7 encodes a homolog of RnaseD that represses transposition of Tc1, Tc3, Tc4, and Tc5, perhaps by degrading transposon-specific messages; also affects sperm development, sensitivity to RNAi of mainly germline expressed genes, silencing of some germline transgenes, X chromosome loss, and is required for cosuppression (functional silencing of chromosomal loci induced by transgenes) and for silencing induced by antisense RNA oligomers; cellular fractionation experiments indicate that MUT-7 is expressed in adult worms, and resides in a complex in both the cytosol and nucleus; in the cytosolic complex, MUT-7 interacts with RDE-2, a novel protein also required for RNA interference.
11mlt-4ZC15.7n/achrV 20,280,792mlt-4 encodes a homolog of human INVS (inversin, OMIM:243305; mutated in nephronophthisis) that has no function in mass RNAi assays.
12F25B5.5F25B5.5n/achrIII 5,944,924contains similarity to Pfam domains PF00919 (Uncharacterized protein family UPF0004) , PF04055 (Radical SAM superfamily) , PF01938 (TRAM domain) contains similarity to Interpro domains IPR005839 (Protein of unknown function UPF0004), IPR013848 (Protein of unknown function UPF0004, N-terminal), IPR007197 (Radical SAM), IPR006638 (Elongator protein 3/MiaB/NifB), IPR002792 (Deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM)
13fbxa-185F47H4.4n/achrV 17,333,561C. elegans FBXA-185 protein; contains similarity to Pfam domains PF01485 (IBR domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
14srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15B0361.7B0361.7n/achrIII 7,284,829contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
16K09E3.1K09E3.1n/achrX 17,126,661
17srb-12F58A6.10n/achrII 5,153,860C. elegans SRB-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18T05A8.6T05A8.6n/achrII 2,739,156contains similarity to Xenopus laevis Integumentary mucin C.1 (FIM-C.1) (Fragment).; SW:Q05049
19ZK856.11ZK856.11n/achrV 10,204,273contains similarity to Pfam domain PF01176 Translation initiation factor 1A / IF-1 contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR006196 (S1, IF1 type), IPR001253 (Eukaryotic initiation factor 1A (eIF-1A))
20msp-38K08F4.8n/achrIV 10,143,514msp-38 encodes a member of the major sperm protein family; msp-38 has a C. briggsae homolog as predicted by the Wobble Bulk Aware Bulk Aligner (WABA).
21R09E12.6R09E12.6n/achrV 767,566contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
22F28F8.7F28F8.7n/achrV 15,579,943contains similarity to Pfam domain PF01448 ELM2 domain contains similarity to Interpro domain IPR000949 (ELM2)
23cdc-48.3K04G2.3n/achrI 8,034,273C. elegans CDC-48.3 protein; contains similarity to Pfam domains PF07726 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) , PF00004 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) , PF07728 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) contains similarity to Interpro domains IPR003959 (AAA ATPase, core), IPR011704 (ATPase associated with various cellular activities, AAA-5), IPR011703 (ATPase associated with various cellular activities, AAA-3), IPR003960 (AAA ATPase, conserved site), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
24gpa-11C16A11.1n/achrII 4,254,160gpa-11 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADL and ASH amphid neurons.
25B0432.6B0432.6n/achrII 267,814contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
26F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
27str-114F59B1.1n/achrV 3,650,602C. elegans STR-114 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28T05H4.4T05H4.4n/achrV 6,439,469The T05H4.4 gene encodes a homolog of the human gene B5R, which when mutated leads to methemoglobinemia (OMIM:250800).
29T10B11.6T10B11.6n/achrI 6,944,267contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
30F01F1.13F01F1.13n/achrIII 5,877,744contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I)
31T12A2.1T12A2.1n/achrIII 6,261,458contains similarity to Pfam domains PF01979 (Amidohydrolase family) , PF07969 (Amidohydrolase family) contains similarity to Interpro domains IPR011550 (Amidohydrolase-like), IPR013108 (Amidohydrolase 3), IPR006680 (Amidohydrolase 1), IPR005920 (Imidazolonepropionase)
32F57G8.7F57G8.7n/achrV 16,329,811contains similarity to Antarctic bacterium str 643 Metalloproteinase precursor.; TR:Q9KH34
33JC8.7JC8.7n/achrIV 13,248,845contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C4orf27; ENSEMBL:ENSP00000261511
34nhr-51K06B4.1n/achrV 15,677,024C. elegans NHR-51 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35F57B1.1F57B1.1n/achrV 13,194,570contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
36ZC373.4ZC373.4n/achrX 10,066,060contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
37T11F9.12T11F9.12n/achrV 11,494,950contains similarity to Interpro domain IPR011735 (Conserved hypothetical protein, HtrL)
38W03C9.5W03C9.5n/achrII 11,967,205contains similarity to Arabidopsis thaliana F25C20.11 protein.; TR:Q9SAA3
39C26B2.7C26B2.7n/achrIV 8,016,527
40srh-165C41G6.9n/achrV 15,220,637C. elegans SRH-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41ran-3C26D10.1n/achrII 8,323,764C. elegans RAN-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR009091 (Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II), IPR000408 (Regulator of chromosome condensation, RCC1)
42F13A2.2F13A2.2n/achrV 4,384,088
43sri-63F39E9.3n/achrII 3,288,198C. elegans SRI-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003544 (Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB)
44his-31F17E9.12n/achrIV 8,333,809his-31 encodes an H4 histone; his-31 is contained within the histone gene cluster HIS5.
45srx-3R03H4.3n/achrV 9,006,212C. elegans SRX-3 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46F38A5.11F38A5.11n/achrIV 6,593,581contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
47srw-133T05B4.6n/achrV 4,114,016C. elegans SRW-133 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
48C15C7.1C15C7.1n/achrX 3,165,079contains similarity to Pfam domain PF05739 SNARE domain contains similarity to Interpro domains IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region), IPR001388 (Synaptobrevin), IPR006012 (Syntaxin/epimorphin, conserved site)
49K03B4.1K03B4.1n/achrV 4,690,455
50F45F2.5F45F2.5n/achrV 8,531,457contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)