UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T05A7.3T05A7.39e-62chrII 4,676,002contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
4F27C8.5F27C8.5n/achrIV 9,591,134contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
5nhr-194F59E11.8n/achrV 8,969,321C. elegans NHR-194 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6C08A9.3C08A9.3n/achrX 17,089,713contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
7srd-8B0547.4n/achrIV 5,644,418C. elegans SRD-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8srh-125C18B10.8n/achrV 7,476,227C. elegans SRH-125 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9ins-32Y8A9A.6n/achrII 3,803,141ins-32 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-32 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and the precise role of INS-32 in C. elegans development is not yet clear as loss of INS-32 function does not result in a mutant phenotype.
10F47B7.1F47B7.1n/achrX 3,788,259contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
11F39B3.3F39B3.3n/achrX 17,578,815
12F55F1.2F55F1.2n/achrX 2,769,819
13T04C9.3T04C9.3n/achrIII 5,985,695
14agr-1F41G3.12n/achrII 6,767,868agr-1 encodes a large (1396-residue) putative agrin, orthologous to human AGRIN (OMIM:103320), EGFLAM, and Q9NQ15; AGR-1 is expressed in buccal epithelium and deposited in pharyngeal basal epithelium; AGR-1 is also expressed in IL1 neurons, distal tip cells, and intestine; an AGR-1 fragment can cluster vertebrate dystroglycan in cell culture; agr-1(eg1770) mutations show no obvious phenotype, including levimasole resistance, and do not enhance other mutations perturbing acetylcholine signalling, the dystrophin-glycoprotein-complex, muscle cell differentiation, or the extracellular matrix.
15srg-37K04C1.1n/achrX 14,234,536C. elegans SRG-37 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
16flnb-1C23F12.2n/achrX 9,402,619C. elegans FLNB-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00630 (Filamin/ABP280 repeat) (2), PF00307 (Calponin homology (CH) domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR001298 (Filamin/ABP280 repeat), IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016146 (Calponin-homology), IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site), IPR001715 (Calponin-like actin-binding)
17skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
18srd-31F07C4.8n/achrV 7,634,059C. elegans SRD-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19F37C4.1F37C4.1n/achrIV 3,890,907contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
20srd-71C13B7.4n/achrV 2,424,746C. elegans SRD-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001614 (Myelin proteolipid protein PLP), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
21tbb-4B0272.1n/achrX 9,435,612C. elegans TBB-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin)
22nhr-169C54C8.1n/achrI 12,443,002C. elegans NHR-169 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23F14H12.2F14H12.2n/achrX 4,351,596
24F59H6.2F59H6.2n/achrII 2,021,048
25srt-72C36C5.9n/achrV 3,148,851C. elegans SRT-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
26str-76C01B4.10n/achrV 2,514,913C. elegans STR-76 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27srbc-56F54B8.12n/achrV 15,831,110C. elegans SRBC-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28F13A7.7F13A7.7n/achrV 16,382,944contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein that binds nuclear localization sequences, required for pre-rRNA processing and ribosome biogenesis; SGD:YGR159C
29F35D11.1F35D11.1n/achrII 4,627,370
30ift-74C18H9.8n/achrII 6,681,205C. elegans IFT-74 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000694 (Proline-rich region)
31F48B9.1F48B9.1n/achrX 2,183,370contains similarity to Interpro domain IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
32F14H8.5F14H8.5n/achrV 15,021,516contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q812W2
33T28B4.2T28B4.2n/achrX 6,582,753
34C30F2.2C30F2.2n/achrX 16,080,929contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
35srh-192ZC132.7n/achrV 4,313,561C. elegans SRH-192 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36C04B4.5C04B4.5n/achrX 12,287,929contains similarity to Plasmodium falciparum Ring-infected erythrocyte surface antigen precursor.; TR:Q8I0U6
37Y37D8A.16Y37D8A.16n/achrIII 12,916,800contains similarity to Cyanidioschyzon merolae Cytochrome C-type biogenesis protein CCMF.; TR:Q9ZZP7
38C54E4.4C54E4.4n/achrIV 2,163,172
39sru-27C38C3.2n/achrV 1,500,054C. elegans SRU-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
40fbxb-85R17.1n/achrIII 10,848,088This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
41che-13F59C6.7n/achrI 10,511,288che-13 encodes a novel protein homologous to mammalian IFT57/Hippi (OMIM:606621, protein interactor of Huntingtin-interacting protein 1 that is implicated in neuronal apoptosis in the Huntington disease state); CHE-13 is a proposed component of the intraflagellar transport (IFT) complex B, and is required for the construction and maintenance of cilia on a subset of sensory neurons; in addition, CHE-13 is required for proper localization of OSM-5, a murine polaris homolog, to IFT complex B; CHE-13 is expressed in ciliated sensory neurons including the amphids, phasmids, inner and outer labial neurons, and sensory rays of the male tail, localizing to the cilia base (transition zone) as well as to the axoneme; che-13 expression, like that of ciliogenic genes osm-1, osm-5, osm-6, and che-2, is positively regulated by the DAF-19 RFX-type transcription factor.
42dpy-28Y39A1B.3n/achrIII 10,770,127dpy-28 encodes a non-SMC condensin subunit homolog, similar to XCAP-D2 in Xenopus, Cnd1 in S. pombe, and Ycs4p in S. cerevisiae, that is required for negative, chromosome-wide regulation of X-chromosomal genes in XX but not XO animals (dosage compensation), and for some undetermined aspect of body morphogenesis; DPY-28 is part of a multiprotein 'dosage compensation' complex with DPY-26, DPY-27 and MIX-1.
43F54C8.6F54C8.6n/achrIII 9,445,388contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAL7
44T03D8.7T03D8.7n/achrV 20,811,735contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein ENSP00000381489; ENSEMBL:ENSP00000335483
45dhc-1T21E12.4n/achrI 4,394,384dhc-1 encodes a cytoplasmic dynein heavy chain homolog required in one-cell embryos for pronuclear migration, centrosome separation, centrosome proximity to the male pronucleus, and mitotic spindle orientation, suggesting that DHC-1 helps position the microtubule organizing center; DHC-1 genetically interacts with SPD-5, a coiled-coil centrosomal protein.
46ZK112.5ZK112.5n/achrIII 7,738,805
47ssr-2C14A11.7n/achrX 2,825,197C. elegans SSR-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras), IPR006689 (ARF/SAR superfamily)
48F49D11.2F49D11.2n/achrI 10,922,443contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
49F15D3.8F15D3.8n/achrI 11,580,950contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii Chromosome partition protein smc homolog.; SW:Q59037
50C40D2.4C40D2.4n/achrII 2,000,282contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)