UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1gcy-35T04D3.40chrI 13,329,337C. elegans GCY-35 protein; contains similarity to Pfam domains PF07700 (Heme NO binding) , PF07701 (Heme NO binding associated) , PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR011645 (Haem NO binding associated), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase)
2C06C6.6C06C6.6n/achrV 15,990,153contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
3B0336.3B0336.3n/achrIII 5,713,118contains similarity to Pfam domain PF00642 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) contains similarity to Interpro domains IPR000571 (Zinc finger, CCCH-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
4srh-44B0334.7n/achrII 11,516,530C. elegans SRH-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5clec-183T20D3.1n/achrIV 9,328,354C. elegans CLEC-183 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6Y48A6B.1Y48A6B.1n/achrIII 10,993,565contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7T05A8.5T05A8.5n/achrII 2,733,284contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
8F28A10.2F28A10.2n/achrII 829,085contains similarity to Pfam domains PF05050 (Protein of unknown function (DUF672)) , PF02995 (Protein of unknown function (DUF229)) contains similarity to Interpro domains IPR007744 (Protein of unknown function DUF672), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
9fbxa-165C08E3.8n/achrII 1,615,632This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
10wht-3C16C10.12n/achrIII 4,149,469C16C10.12 encodes an ATP-binding cassette (ABC) transporter; C16C10.12 activity is required for efficient RNA interference (RNAi) of a germline-expressed target, pop-1.
11Y53C10A.5Y53C10A.5n/achrI 12,000,702contains similarity to Interpro domain IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)
12K11H12.4K11H12.4n/achrIV 674,988contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
13F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
14ugt-2AC3.8n/achrV 10,399,988C. elegans UGT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
15E01B7.1E01B7.1n/achrV 17,926,717contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR000694 (Proline-rich region)
16far-5F15B9.3n/achrV 12,996,198far-5 encodes a member of a class of fatty acid-and retinol-binding proteins that are known to be secreted by parasitic nematodes and plants; far-5 binds lipid in fluorescence-based assays, however, the precise function of far-5 is not known.
17C16D6.2C16D6.2n/achrX 12,544,267contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR001402 (Prolactin-releasing peptide receptor), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
19D2063.2D2063.2n/achrV 4,330,780contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
20twk-21T01B4.1n/achrX 16,302,750C. elegans TWK-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
21T09E11.6T09E11.6n/achrI 12,367,467contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
22F14D2.9F14D2.9n/achrII 3,354,397contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
23C50A2.4C50A2.4n/achrIV 1,160,591contains similarity to Pfam domain PF00178 Ets-domain contains similarity to Interpro domains IPR000418 (Ets), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding)
24F46B3.16F46B3.16n/achrV 20,630,275
25W06G6.10W06G6.10n/achrV 16,646,964contains similarity to Escherichia coli O157:H7 C4-type zinc finger protein (TraR family).; TR:Q8X2P7
26K05F1.5K05F1.5n/achrII 5,791,755contains similarity to Pfam domain PF01551 Peptidase family M23 contains similarity to Interpro domains IPR016047 (Peptidase M23), IPR008663 (Leukocyte cell-derived chemotaxin 2), IPR011055 (Duplicated hybrid motif)
27Y39E4B.6Y39E4B.6n/achrIII 13,072,610contains similarity to Rattus norvegicus Nucleolar protein NOP5 (Nucleolar protein 5) (Nopp140 associatedsprotein).; SW:NOP5_RAT
28B0041.5B0041.5n/achrI 4,649,524contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
29C36E8.4C36E8.4n/achrIII 4,014,026contains similarity to Pfam domain PF00018 SH3 domain contains similarity to Interpro domains IPR001060 (Cdc15/Fes/CIP4), IPR001452 (Src homology-3)
30cyp-33B1C25E10.2n/achrV 9,042,479C. elegans CYP-33B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
31lgc-11F48E3.7n/achrX 7,505,176acr-22 encodes a predicted member of the nicotinic acetylcholine receptor nonalpha subunit family with highest similarity to human neuronal acetylcholine receptor alpha-9 subunit.
32pqn-84Y41C4A.5n/achrIII 11,701,451The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
33F13H8.9F13H8.9n/achrII 6,280,371contains similarity to Pfam domain PF00266 Aminotransferase class-V contains similarity to Interpro domains IPR016454 (Cysteine desulphurase, NifS), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
34clec-147C04H5.2n/achrII 14,536,651C. elegans CLEC-147 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
35T21G5.2T21G5.2n/achrI 6,870,894
36E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
37T09B9.3T09B9.3n/achrX 9,760,250contains similarity to Pfam domain PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family contains similarity to Interpro domain IPR004129 (Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)
38F49C12.1F49C12.1n/achrIV 9,295,603contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
39ZK721.4ZK721.4n/achrX 8,780,140contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40F31B12.2F31B12.2n/achrX 10,822,704contains similarity to Mus musculus Splicing factor, arginine/serine-rich 12 (Serine-arginine-richssplicing regulatory protein 86) (SRrp86).; SW:SFRC_MOUSE
41srh-178ZK228.8n/achrV 18,479,364C. elegans SRH-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42sulp-8ZK287.2n/achrV 9,671,599sulp-8 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-8 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-8::GFP fusion is expressed in the basolateral membrane of the excretory cell, intestine, and rectal gland cells.
43fbxb-65C43D7.2n/achrV 19,330,120This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
44F18E3.10F18E3.10n/achrV 7,424,056contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45F22G12.5F22G12.5n/achrI 13,172,567contains similarity to Interpro domain IPR001765 (Carbonic anhydrase)
46bath-47T07H3.1n/achrII 1,603,204C. elegans BATH-47 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) (2), PF00917 (MATH domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
47F26F2.4F26F2.4n/achrV 20,565,244contains similarity to Homo sapiens Laminin alpha-4 chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000230538
48ins-24ZC334.3n/achrI 14,031,394ins-24 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-24 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans, but as loss of INS-24 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of INS-24 in C. elegans development is not yet clear.
49clec-259M162.1n/achrV 19,786,034C. elegans CLEC-259 protein; contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR007233 (Sybindin-like protein), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
50Y57G11B.2Y57G11B.2n/achrIV 14,566,202contains similarity to Guillardia theta Hypothetical protein orf176 from chromosome 3.; TR:Q98SC3