UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srv-12T04B2.40chrIV 10,052,440C. elegans SRV-12 protein ;
2F47B3.4F47B3.4n/achrI 3,961,620contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR003267 (Small proline-rich), IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
3skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
4F28H1.5F28H1.5n/achrI 3,979,010
5trf-1F45G2.6n/achrIII 13,431,808The trf-1 gene encodes a protein with a meprin-associated Traf homology (MATH) domain that may be involved in apoptosis.
6tba-6F32H2.9n/achrI 8,996,289C. elegans TBA-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
7F01D4.3F01D4.3n/achrIV 10,474,640contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR005819 (Histone H5), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
8scrm-8K08D10.7n/achrIV 4,165,432scrm-8 encodes a putative phospholipid scramblase required for normally short lifespan; SCRM-8 is homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1).
9C31G12.4C31G12.4n/achrV 18,177,707contains similarity to Pfam domain PF00646 (F-box domain)
10T21E3.2T21E3.2n/achrI 3,931,189contains similarity to Homo sapiens 55 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000273725
11C17C3.11C17C3.11n/achrII 5,538,392contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
12R04B5.1R04B5.1n/achrV 10,078,069contains similarity to Culex nigripalpus baculovirus Putative 33 kDa early protein (CUN014 similar to AcMNPV ORF92).; TR:Q99GP2
13F22B5.5F22B5.5n/achrII 8,453,880contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
14C10G11.10C10G11.10n/achrI 6,305,695
15W06F12.3W06F12.3n/achrIII 13,735,661contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
16rmd-5T23B3.3n/achrI 6,711,598C. elegans RMD-5 protein ; contains similarity to Xenopus laevis Protein FAM82C.; SW:Q5EAU9
17W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
18F52F10.3F52F10.3n/achrV 1,540,095contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
19T22B2.7T22B2.7n/achrX 3,909,459
20K10C9.7K10C9.7n/achrV 1,066,687
21nas-5T23H4.3n/achrI 9,887,167nas-5 encodes an astacin-like metalloprotease; loss of nas-5 activity in an RNAi hypersensitive strain results in axon guidance defects, including a failure of DD/VD motoneuron commissures to reach the dorsal cord, defasciculation of the dorsal nerve cord, and midline crossing defects in the ventral nerve cord.
22M28.9M28.9n/achrII 10,641,581contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000024599
23F23C8.8F23C8.8n/achrI 2,431,177contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
24D2062.6D2062.6n/achrII 2,619,582contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
25F18A12.4F18A12.4n/achrII 3,405,348F18A12.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.4 has no clear orthologs in other organisms.
26C08E8.3C08E8.3n/achrV 18,351,418contains similarity to Clostridium perfringens Probable Ser-type protease.; TR:Q8XHC4
27F14D7.1F14D7.1n/achrV 14,289,203contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domain IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
28tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
29C15H11.1C15H11.1n/achrV 14,394,129contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
30C44F1.2C44F1.2n/achrIII 3,769,375contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
31M03E7.3M03E7.3n/achrV 5,615,596
32C32D5.4C32D5.4n/achrII 6,322,171
33F18C5.4F18C5.4n/achrII 6,564,443contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
34Y41C4A.1Y41C4A.1n/achrIII 11,648,712contains similarity to Oryza sativa Putative aspartate kinase.; TR:Q851Z6
35C48E7.8C48E7.8n/achrI 6,267,364contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
36F45C12.9F45C12.9n/achrII 1,709,067contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
37K01D12.15K01D12.15n/achrV 12,386,487contains similarity to Interpro domains IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
38lgc-30F58H7.3n/achrIV 932,249C. elegans LGC-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
39ZK262.4ZK262.4n/achrV 18,424,010contains similarity to Arabidopsis thaliana Similarity to salt-inducible protein.; TR:Q9LVA2
40T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
41K02F6.3K02F6.3n/achrII 2,547,902contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
42R07C3.4R07C3.4n/achrII 934,987contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
43ZK1225.5ZK1225.5n/achrI 13,217,724
44C29F5.5C29F5.5n/achrII 6,297,911
45Y51A2D.18Y51A2D.18n/achrV 18,484,174contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46str-86F59E11.14n/achrV 8,983,013C. elegans STR-86 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47Y57G7A.5Y57G7A.5n/achrII 1,274,377
48C25G4.7C25G4.7n/achrIV 12,457,730contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
49F54D1.1F54D1.1n/achrIV 11,262,424contains similarity to Interpro domain IPR004087 (K Homology)
50ech-3F43H9.1n/achrV 8,022,781C. elegans ECH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)