UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1T04A11.5T04A11.50chrIV 12,485,693contains similarity to Pfam domain PF02567 Phenazine biosynthesis-like protein contains similarity to Interpro domain IPR003719 (Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3pqn-92Y75B8A.27n/achrIII 12,309,726The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
4scl-1F49E11.9n/achrIV 13,056,795scl-1 encodes a predicted secretory protein that is a member of the cysteine-rich secretory protein (CRISP) family; scl-1 activity positively regulates longevity and stress resistance; in wild-type animals, scl-1 mRNA is detected solely in eggs, while in daf-2 mutants it is detected in eggs and late adult stages; scl-1 expression appears to be under the control of the DAF-2/insulin-like signaling pathway as, in mixed-stage cultures, scl-1 mRNA levels are increased in daf-2 and age-1 mutants and undetectable in daf-16 mutants; scl-1 contains a DAF-16 consensus binding element within its predicted regulatory regions.
5K08D8.1K08D8.1n/achrIV 12,893,458contains similarity to Fusobacterium nucleatum Tryptophanase (EC 4.1.99.1).; TR:Q8RHQ6
6srh-227C35D6.2n/achrIV 16,343,304C. elegans SRH-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7K07C11.3K07C11.3n/achrV 8,207,597contains similarity to Interpro domains IPR008993 (TIMP-like, OB-fold), IPR001820 (Proteinase inhibitor I35, tissue inhibitor of metalloproteinase), IPR001134 (Netrin, C-terminal)
8C54D2.2C54D2.2n/achrX 7,839,011
9F52E10.4F52E10.4n/achrX 16,286,357contains similarity to Homo sapiens Zinc finger protein 277; ENSEMBL:ENSP00000006035
10F56B6.6F56B6.6n/achrX 3,532,316contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
11R03H4.5R03H4.5n/achrV 9,020,799contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
12F23B2.10F23B2.10n/achrIV 9,153,550contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
13math-25C46F9.4n/achrII 1,896,912C. elegans MATH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
14F14D2.7F14D2.7n/achrII 3,337,168contains similarity to Interpro domain IPR006642 (Zinc finger, Rad18-type putative)
15rlbp-1T23G11.5n/achrI 7,688,763C. elegans RLBP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00620 RhoGAP domain contains similarity to Interpro domains IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
16B0228.6B0228.6n/achrII 7,754,791
17C40C9.4C40C9.4n/achrX 13,651,413contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein with a putative role in sister chromatid segregation, potentially phosphorylated by Cdc28p; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localizes to the nuclear periphery; SGD:YML034W
18sulp-5K12G11.2n/achrV 11,881,591sulp-5 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-5 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-5::GFP fusion is expressed in punctate structures irregularly distributed along the apical membrane of excretory cell canals and is also expressed weakly in adult seam cells.
19dod-20B0554.6n/achrV 423,333C. elegans DOD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
20C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
21Y51B9A.9Y51B9A.9n/achrII 9,396,480contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR008351 (JNK MAP kinase), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
22T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
23F56H6.7F56H6.7n/achrI 12,299,265contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domains IPR005049 (Protein of unknown function DUF288), IPR001692 (Histidinol dehydrogenase)
24T28H10.1T28H10.1n/achrV 12,504,477contains similarity to Pfam domain PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR008278 (4'-phosphopantetheinyl transferase)
25T28A11.3T28A11.3n/achrV 3,275,745contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
26C04F12.5C04F12.5n/achrI 9,690,333contains similarity to Plasmodium yoelii nigeriensis Ookinete surface antigen-like protein Pfs28.; TR:Q9GTY7
27col-50T28F2.6n/achrI 3,651,949col-50 encodes a cuticle collagen.
28F48A9.2F48A9.2n/achrI 6,593,082
29clec-5C35D10.14n/achrIII 4,882,708C. elegans CLEC-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site), IPR001304 (C-type lectin)
30B0393.7B0393.7n/achrIII 4,777,124contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
31Y106G6D.6Y106G6D.6n/achrI 10,120,080contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
32srj-16T06A1.2n/achrV 1,955,236C. elegans SRJ-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33tag-244C34H4.3n/achrIV 1,551,970C. elegans TAG-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
34F19F10.3F19F10.3n/achrV 7,552,413
35H12D21.3H12D21.3n/achrV 14,886,000contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
36T05C3.2T05C3.2n/achrV 5,498,362The T05C3.2 gene encodes a protein that may be involved in apoptosis.
37Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
38R08H2.8R08H2.8n/achrV 15,371,455contains similarity to Mycoplasma penetrans Conserved hypothetical protein.; TR:Q8EV71
39K03D3.2K03D3.2n/achrIV 16,328,334contains similarity to Sulfolobus tokodaii Hypothetical protein ST0074.; TR:Q976W5
40K06H6.6K06H6.6n/achrV 584,556contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
41srp-6C03G6.19n/achrV 7,385,156srp-6 encodes a functional serpin (serine protease inhibitor)
42F26G1.3F26G1.3n/achrII 4,759,013F26G1.3 encodes a protein containing a transthyretin-like domain; the product of F26G1.3 belongs to a family of apparently nematode-specific proteins whose function is not yet known.
43sod-4F55H2.1n/achrIII 9,499,079C. elegans SOD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00080 Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) contains similarity to Interpro domain IPR001424 (Superoxide dismutase, copper/zinc binding)
44srsx-2F20E11.2n/achrV 17,437,669C. elegans SRSX-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
45F17E9.2F17E9.2n/achrIV 8,356,187
46K09C4.9K09C4.9n/achrX 3,271,553
47Y2H9A.4Y2H9A.4n/achrV 13,447,397contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR007883 (Protein of unknown function DUF713), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
48F27E5.1F27E5.1n/achrII 10,140,416contains similarity to Pfam domain PF02275 Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR003199 (Choloylglycine hydrolase), IPR016699 (Acid ceramidase-like)
49srg-23Y25C1A.11n/achrII 3,095,026C. elegans SRG-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
50B0207.10B0207.10n/achrI 5,959,278