UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sru-17T04A11.100chrIV 12,506,509C. elegans SRU-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C03G6.5C03G6.5n/achrV 7,365,571contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
4F47B8.6F47B8.6n/achrV 14,329,569contains similarity to Drosophila heteroneura Aminopeptidase N (Fragment).; TR:O61534
5ZK632.4ZK632.4n/achrIII 9,806,382ZK632.4 is orthologous to the human gene PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE (MPI; OMIM:154550), which when mutated leads to disease.
6srd-4ZK863.5n/achrV 12,185,574C. elegans SRD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7W01B6.6W01B6.6n/achrIV 10,081,890contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
8fbxb-7Y20C6A.2n/achrV 17,378,293C. elegans FBXB-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
9bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
10srd-26T02B5.4n/achrV 14,162,174C. elegans SRD-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11cyp-33C4F44C8.1n/achrV 2,237,058C. elegans CYP-33C4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
12C06A5.6C06A5.6n/achrI 5,984,551
13srbc-29C02A12.2n/achrV 3,470,161C. elegans SRBC-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14R07B7.6R07B7.6n/achrV 12,073,908contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
15clec-38T25E12.10n/achrV 16,734,718C. elegans CLEC-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
16srj-25C05E4.10n/achrV 735,347C. elegans SRJ-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
17ard-1F01G4.2n/achrIV 11,132,448ard-1 encodes a homolog of mammalian 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (HADH II)/amyloid-beta binding alcohol dehydrogenase (ABAD) that is predicted to be mitochondrial.
18C04E6.4C04E6.4n/achrV 5,908,497
19hdl-1ZK829.2n/achrIV 11,947,905C. elegans HDL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00282 Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR010977 (Aromatic-L-amino-acid decarboxylase), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
20K12D9.12K12D9.12n/achrV 3,021,212contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
21sru-18T04A11.94.0000000000000003e-112chrIV 12,503,147C. elegans SRU-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
22srd-34F32G8.1n/achrV 10,548,271C. elegans SRD-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23F08F1.3F08F1.3n/achrX 8,430,035
24ncx-8C13D9.7n/achrV 4,985,459ncx-8 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-6/-7 and NCX-9/-10; NCX-8 may function intracellularly; NCX-8 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-8 is required for normally high levels of body fat.
25F35E2.9F35E2.9n/achrI 11,724,844contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
26let-502C10H11.9n/achrI 4,741,246let-502 encodes a Rho-binding Ser/Thr kinase orthologous to human myotonic dystrophy kinase (DM-kinase); let-502 is required for early embryonic cleavages, embryonic elongation, migration of hypodermal P cells to a ventral position, normal spermathecal contraction, and fertility; LET-502 is required for hypodermal cells to properly change their shape, and is expressed in those cells, during embryonic elongation; let-502 mutations are suppressed by mel-11 mutations, and the pattern of LET-502 expression in the embryonic epidermis and the spermatheca is opposite to that of MEL-11, indicating that LET-502 and MEL-11 have opposing functions (presumably tissue contraction and relaxation); MEL-11 requires LET-502 (along with the nonmuscle myosin NMY-1) for proper localization.
27R13H4.6R13H4.6n/achrV 11,864,309contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Putative protease La homolog type (EC 3.4.21.-).; SW:O29883
28T09F5.10T09F5.10n/achrV 15,180,897contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
29vps-16C05D11.2n/achrIII 6,434,734vps-16 encodes the C. elegans homolog of the Saccharomyces cerevisiae vacuolar sorting protein Vps16p; in C. elegans, vps-16 activity is required for biogenesis of the lysosome-related gut granules and for embryonic development; in addition, vps-16 is required for normal body morphology and regulation of germline apoptosis.
30ZK550.5ZK550.5n/achrIV 17,258,404contains similarity to Pfam domain PF05721 Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) contains similarity to Interpro domain IPR008775 (Phytanoyl-CoA dioxygenase)
31T09E11.4T09E11.4n/achrI 12,361,669contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
32tag-199F45E4.4n/achrIV 7,612,783C. elegans TAG-199 protein ; contains similarity to Trypanosoma brucei Putative uncharacterized protein.; TR:Q4GZ45
33pqn-73W01C9.3n/achrII 8,543,297The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
34ptr-16T21H3.2n/achrV 1,172,902ptr-16 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-16 is partially required for normal molting from L2 to L3 larval stages; however, PTR-16 and PTR-1 together are strongly required for both molting and viability, with double ptr-1/-16 RNAi animals showing pronounced molting defects and lethality; PTR-16 is also required for normal growth to full size and locomotion.
35F32D8.3F32D8.3n/achrV 10,887,380F32D8.3 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; F32D8.3 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; F32D8.3 has no obvious function in mass RNAi assays.
36ZC443.1ZC443.1n/achrV 12,809,256contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
37C04E6.11C04E6.11n/achrV 5,915,960contains similarity to Homo sapiens Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial precursor; ENSEMBL:ENSP00000260665
38F32D8.2F32D8.2n/achrV 10,884,916contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
39F32D8.4F32D8.4n/achrV 10,892,425F32D8.4 is homologous to Yip1p, an essential Golgi membrane protein in S. cerevisiae that specifically binds the transport GTPases Ypt1p and Ypt31p, as well as Yop1p (the yeast homolog of human ADENOMATOUS POLYPOSIS COLI 1); F32D8.4 is also homologous to the Golgi membrane protein SB140 of H. sapiens, and contains a glutamine/asparagine-rich domain.
40W06D4.4W06D4.4n/achrI 9,061,846contains similarity to Interpro domain IPR014644 (Protein arginine N-methyltransferase)
41lact-2ZK945.1n/achrII 10,096,751lact-2 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted transmembrane domain in its N terminus.
42T25C8.1T25C8.1n/achrIII 13,611,268contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000577 (Carbohydrate kinase, FGGY)
43W02B12.4W02B12.4n/achrII 11,457,473contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
44srx-56C03G6.2n/achrV 7,374,979C. elegans SRX-56 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
45mat-2W10C6.1n/achrII 11,116,985mat-2 encodes a subunit of the anaphase-promoting complex or cyclosome (APCC) which is a multi-subunit E3 ubiquitin ligase that targets proteins for degradation during the metaphase-to-anaphase transition of the cell cycle; mat-2 is required for chromosome segregation during meiosis I and is involved in polarity specification of the anterior/posterior axis in the developing embryo.
46C04E7.3C04E7.3n/achrX 345,208contains similarity to Homo sapiens inner centromere protein antigens 135/155kDa isoform 2; ENSEMBL:ENSP00000278849
47C06E7.4C06E7.4n/achrIV 5,855,392contains similarity to Human cytomegalovirus Protein UL53 (Protein HFRF2).; SW:P16794
48C14C6.8C14C6.8n/achrV 552,129contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
49C13A2.10C13A2.10n/achrV 7,274,350contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
50cpr-3T10H4.12n/achrV 15,297,739C. elegans CPR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)