UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T03F7.6T03F7.61.9999999999999998e-172chrV 11,295,604contains similarity to Interpro domain IPR001036 (Acriflavin resistance protein)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3hda-4C10E2.3n/achrX 16,737,045hda-4 encodes a class II histone deacetylase that contains a putative MEF-2 DNA binding domain, a nuclear localization signal domain, and a single catalytic domain and may affect locomotion, body morphology, and growth; interacts with MEF-2 in in vitro assays and is expressed in body-wall muscle, neurons, and hypodermal seam cells
4C53A5.11C53A5.11n/achrV 14,563,580contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF07646 (Kelch motif) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
5F53E10.3F53E10.3n/achrV 2,606,470
6R05H10.5R05H10.5n/achrII 14,868,296contains similarity to Pfam domain PF00255 Glutathione peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
7T21D11.1T21D11.1n/achrIII 7,246,672contains similarity to Pfam domain PF00413 Matrixin contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR001818 (Peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin)
8srw-65Y38H6C.2n/achrV 20,497,408C. elegans SRW-65 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
9ceh-24F55B12.1n/achrV 13,814,273ceh-24 is orthologous to the human gene SIMILAR TO THYROID TRANSCRIPTION FACTOR 1 (TITF1; OMIM:600635), which when mutated leads to disease.
10F45G2.10F45G2.10n/achrIII 13,438,200contains similarity to Pfam domain PF01883 Domain of unknown function DUF59 contains similarity to Interpro domain IPR002744 (Protein of unknown function DUF59)
11srt-65C03A7.10n/achrV 5,171,907C. elegans SRT-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
12T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
13fbxa-166C08E3.9n/achrII 1,617,962C. elegans FBXA-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
14T01B10.5T01B10.5n/achrX 8,496,580
15srv-11H25K10.3n/achrIV 16,220,615C. elegans SRV-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF01461 (7TM chemoreceptor) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16R05D7.3R05D7.3n/achrI 12,169,337contains similarity to Interpro domain IPR000085 (Bacterial DNA recombination protein, RuvA)
17D1053.3D1053.3n/achrX 11,731,700contains similarity to Interpro domain IPR001208 (MCM)
18srbc-58R09E12.2n/achrV 776,135C. elegans SRBC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19srt-3F47D2.3n/achrV 4,259,059C. elegans SRT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20F58A3.4F58A3.4n/achrX 11,010,149contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
21glb-2C06E4.7n/achrIV 7,262,720glb-2 encodes a globin; glb-2 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-2 has no obvious function in mass RNAi assays.
22M163.5M163.5n/achrX 14,475,017contains similarity to Interpro domain IPR008995 ()
23T07H6.4T07H6.4n/achrX 6,284,028contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002396 (Selectin (CD62E/L/P antigen)), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
24T08G2.2T08G2.2n/achrX 17,207,313contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
25srh-295ZK1037.8n/achrV 15,331,670C. elegans SRH-295 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26F47G4.8F47G4.8n/achrI 14,053,124
27F49C5.4F49C5.4n/achrII 12,539,002contains similarity to Pfam domain PF00069 (Eukaryotic protein kinase domain)
28srh-118K03D7.6n/achrV 17,495,205C. elegans SRH-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29nhr-280C29F9.13n/achrIII 130,464C. elegans NHR-280 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30clec-177E03H12.2n/achrIV 4,987,125C. elegans CLEC-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
31C53B7.6C53B7.6n/achrX 6,868,654
32Y43F8B.13Y43F8B.13n/achrV 19,459,852contains similarity to Puumala virus Nucleocapsid protein (Fragment).; TR:Q8B3A4
33C11G10.1C11G10.1n/achrX 15,157,907
34F38A1.13F38A1.13n/achrIV 1,265,538
35C38D9.5C38D9.5n/achrV 17,589,380contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
36C15C8.5C15C8.5n/achrV 12,749,106contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
37F36D1.8F36D1.8n/achrI 11,257,879contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
38R07C12.2R07C12.2n/achrIV 4,149,092
39srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40F52D1.2F52D1.2n/achrX 447,631
41srv-8F53F1.7n/achrV 13,419,959C. elegans SRV-8 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002456 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
42srh-18C50B6.5n/achrV 13,319,254C. elegans SRH-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F35E8.2F35E8.2n/achrV 15,906,320contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DZ81
44str-122W03D2.10n/achrIV 4,067,151C. elegans STR-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45K03D10.3K03D10.3n/achrI 14,122,952The K03D10.3 gene encodes a MYST acetyltransferase orthologous to the Drosophila MALES-ABSENT-ON-THE-FIRST (MOF) and CG1894 proteins, the human MOF protein, and the S. cerevisiae SAS2 protein.
46sre-24F37B4.9n/achrV 2,885,567C. elegans SRE-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001382 (Glycoside hydrolase, family 47)
47cdk-2K03E5.3n/achrI 3,411,552C. elegans CDK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48ZK856.6ZK856.6n/achrV 10,199,178contains similarity to Ralstonia solanacearum Composite TWO-component regulatory (Sensor kinase and responsesregulator hybrid) transcription regulator protein.; TR:Q8XWL8
49srh-200F07C4.13n/achrV 7,652,983C. elegans SRH-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)