UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T02G6.6T02G6.60chrI 11,821,054contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
2Y39E4B.7Y39E4B.7n/achrIII 13,113,204contains similarity to Pfam domain PF01529 (DHHC zinc finger domain)
3M03E7.2M03E7.2n/achrV 5,617,970contains similarity to Plasmodium berghei 58 kDa phosphoprotein (Heat shock-related protein) (HRP).; SW:Q08168
4F44E5.2F44E5.2n/achrII 11,770,321contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat
5taf-11.3F43D9.5n/achrIII 10,504,535The taf-11.3 gene encodes an ortholog of human TATA-binding protein associated factor TAF11 (TAFII28, OMIM:600772) that is a component of the TFIID general transcription factor that recognizes the transcription start site; TAF-11.3 is required for proper post-embryonic development.
6E04F6.10E04F6.10n/achrII 7,215,446
7F47E1.3F47E1.3n/achrX 9,049,405contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
8ZK546.5ZK546.5n/achrII 4,936,745contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
9srh-233Y113G7A.1n/achrV 20,046,361C. elegans SRH-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10str-134C05E4.6n/achrV 744,563C. elegans STR-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11srw-53T05G11.7n/achrV 15,944,112C. elegans SRW-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
12F31F4.1F31F4.1n/achrV 685,113contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
13C01H6.9C01H6.9n/achrI 7,231,276C01H6.9 encodes a homolog of haploid germ cell-specific nuclear protein kinase (haspin) that specifically binds GOA-1 in yeast two-hybrid assays; C01H6.9 is expressed in PHB sensory neurons and PVT interneurons in the tail, several unidentified neurons in the head (with projections to the nose and nerve ring), and intestinal cells, with mainly nuclear localization; C01H6.9 has no obvious function or phenotype in RNAi assays, either alone or with inactivation of a close paralog (F22H10.5).
14F40E3.3F40E3.3n/achrI 2,638,982
15srw-94H06H21.1n/achrIV 4,815,890C. elegans SRW-94 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
16Y52B11A.9Y52B11A.9n/achrI 11,036,452contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR005824 (KOW), IPR002358 (Ribosomal protein L6, conserved site-1), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
17F26F4.6F26F4.6n/achrIII 4,892,477contains similarity to Homo sapiens Similar to Suppressor protein SRP40; VG:OTTHUMP00000170311
18T14G10.8T14G10.8n/achrIV 10,146,609contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P08235 Mineralocorticoid receptor; ENSEMBL:ENSP00000281330
19R148.2R148.2n/achrIII 3,184,321
20F53F8.1F53F8.1n/achrV 20,682,534The F53F8.1 gene encodes a homolog of human WT1, which when mutated leads to Wilms tumour (OMIM:194070).
21W06G6.9W06G6.9n/achrV 16,646,169contains similarity to Ralstonia solanacearum Hypothetical protein RSc2317.; TR:Q8XX01
22srw-26T05G11.3n/achrV 15,931,865C. elegans SRW-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
23K09A11.1K09A11.1n/achrX 13,263,425contains similarity to Pfam domains PF05699 (hAT family dimerisation domain) , PF02892 (BED zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR008906 (HAT dimerisation), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
24srh-97F49H6.4n/achrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25str-1C42D4.5n/achrIV 7,174,381C. elegans STR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26nhr-271T03E6.3n/achrV 16,579,462C. elegans NHR-271 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
27F47E1.1F47E1.1n/achrX 9,075,645
28C14A4.11C14A4.11n/achrII 10,606,420contains similarity to Pfam domain PF06840 Protein of unknown function (DUF1241) contains similarity to Interpro domain IPR009652 (Protein of unknown function DUF1241)
29ceh-5C16C2.1n/achrI 9,727,604ceh-5 encodes a homeodomain protein, similar to the human VENTRAL ANTERIOR HOMEO BOX 2 gene (VAX2; OMIM:604295); CEH-5 is dispensable for viability and gross morphology.
30srd-3K10B4.5n/achrII 127,822C. elegans SRD-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31evl-20F22B5.1n/achrII 8,444,637evl-20 encodes a functional ortholog of human ADP-ribosylation factor-like protein 2 (ARL2; OMIM:601175), with evl-20(ar103) mutants being rescued by transgenic human ARL2 but not ARL1 or ARL3-7; EVL-20 is required for cortical microtubule formation during cytokinesis and morphogenesis; EVL-20 is required for vulval, gonadal, and male tail development, as well as for embryonic mitosis, hypodermal enclosure, and elongation; EVL-20 is expressed in migrating hypodermal embryonic cells, larval vulval and somatic gonad cells, larval and adult neurons, and adult male proctodeal cells, being subcellularly associated with both the cell cortex and astral microtubules.
32athp-1C44B9.4n/achrIII 10,887,899C. elegans ATHP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF02178 (AT hook motif) (2), PF00628 (PHD-finger) contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000294 (Vitamin K-dependent carboxylation/gamma-carboxyglutamic region), IPR000253 (Forkhead-associated), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
33ZK402.1ZK402.1n/achrX 1,405,182
34srh-222F47C12.10n/achrIV 3,980,509C. elegans SRH-222 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35T24H10.1T24H10.1n/achrII 9,099,835contains similarity to Pfam domains PF07500 (Transcription factor S-II (TFIIS), central domain) , PF08711 (Transcription elongation factor S-II protein N terminal) , PF01096 (Transcription factor S-II (TFIIS)) contains similarity to Interpro domains IPR001222 (Zinc finger, TFIIS-type), IPR003618 (Transcription elongation factor S-II, central region), IPR014754 (Transcription elongation factor, TFIIS, N-terminal, fungal-type), IPR003617 (Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type), IPR014765 (Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal), IPR016492 (Transcription elongation factor, IIS), IPR006289 (Transcription elongation factor, TFIIS), IPR010990 (Transcription elongation factor, TFIIS/elongin A/CRSP70, N-terminal)
36C41D11.4C41D11.4n/achrI 4,442,876
37srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38cic-1H14E04.5n/achrIII 2,397,836C. elegans CIC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00134 Cyclin, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal), IPR015429 (Transcription regulator cyclin)
39sri-65F13A7.8n/achrV 16,387,488C. elegans SRI-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I)
40srj-26ZK262.10n/achrV 18,422,252C. elegans SRJ-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41sptf-3Y40B1A.4n/achrI 13,362,400C. elegans SPTF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
42B0207.6B0207.6n/achrI 5,936,242contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
43Y49F6C.8Y49F6C.8n/achrII 3,369,682
44C14F11.2C14F11.2n/achrX 6,211,298contains similarity to Pfam domains PF00560 (Leucine Rich Repeat) (6), PF00307 (Calponin homology (CH) domain) contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR016146 (Calponin-homology), IPR001715 (Calponin-like actin-binding), IPR003590 (Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype)
45F10E9.7F10E9.7n/achrIII 8,306,002contains similarity to Interpro domain IPR016193 (Cytidine deaminase-like)
46C17H11.5C17H11.5n/achrX 8,183,262
47T05C1.5T05C1.5n/achrII 4,490,625contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
48set-13K12H6.11n/achrII 2,818,048set-13 encodes a SET domain-containing protein; SET-13 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-6, SET-15, SET-19, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-13(n5012) nor set-13(RNAi) have any obvious phenotypes.
49Y17D7B.5Y17D7B.5n/achrV 18,775,675contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
50F22F7.6F22F7.6n/achrV 2,116,951contains similarity to Homo sapiens N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase; ENSEMBL:ENSP00000309096