UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T02E9.1T02E9.10chrV 11,351,210contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
2K02F2.5K02F2.5n/achrI 6,807,588
3F15E11.11F15E11.11n/achrV 2,332,801contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
4lpr-2T12A7.5n/achrIV 11,783,102C. elegans LPR-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR012674 (Calycin), IPR011038 (Calycin-like), IPR002345 (Lipocalin)
5F58B4.4F58B4.4n/achrV 10,931,009contains similarity to Plasmodium yoelii Rhoptry protein.; TR:Q26216
6lgc-42Y39A3B.2n/achrIII 2,000,367C. elegans LGC-42 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
7hen-1C36B7.7n/achrX 7,116,551hen-1 encodes a secreted protein that contains a low-density lipoprotein (LDL) receptor motif A; HEN-1 activity is required for integration of sensory stimuli and behavioral plasticity; a hen-1::GFP reporter is expressed in pharyngeal muscles, the vulva, and weakly in a subset of neurons; antibodies to HEN-1 protein detect expression exclusively in the AIY and ASE neurons, where HEN-1 appears to localize to cell bodies and in a punctate pattern in nerve ring axons at sites of synapse formation; HEN-1 expression in AIY appears to be under the control of the TTX-3 LIM domain transcription factor.
8W03B1.9W03B1.9n/achrIV 4,354,761contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
9nlp-11ZK1320.10n/achrII 9,690,787C. elegans NLP-11 protein ;
10T27A10.2T27A10.2n/achrX 3,586,399
11H04M03.12H04M03.12n/achrIV 5,900,480
12R13A1.5R13A1.5n/achrIV 7,191,489
13M7.8M7.8n/achrIV 11,094,455contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
14C02H7.2C02H7.2n/achrX 734,085contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15B0261.5B0261.5n/achrI 5,250,115
16F18G5.5F18G5.5n/achrX 9,256,665
17clec-211F19F10.6n/achrV 7,560,915C. elegans CLEC-211 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
18flp-17C52D10.11n/achrIV 17,191,022C. elegans FLP-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
19R04F11.1R04F11.1n/achrV 12,309,572R04F11.1 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; R04F11.1 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; R04F11.1 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
20C30B5.5C30B5.5n/achrII 6,204,855contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013806 (Kringle-like fold), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21F14D7.8F14D7.8n/achrV 14,312,353contains similarity to Staphylococcus epidermidis Conserved hypothetical protein.; TR:Q8CSE5
22sue-1F07A5.5n/achrI 7,365,960C. elegans SUE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
23R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
24T25B6.4T25B6.4n/achrX 9,016,157
25srj-15Y40B10B.2n/achrV 1,963,860C. elegans SRJ-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002120 (Thyrotrophin-releasing hormone receptor)
26W01B6.3W01B6.3n/achrIV 10,071,407contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
27C50C3.5C50C3.5n/achrIII 8,179,701contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
28T06C12.12T06C12.12n/achrV 15,892,264contains similarity to Pyrococcus horikoshii Hypothetical protein PH0933.; TR:O58684
29W03D8.1W03D8.1n/achrI 2,789,083contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CFZ6
30Y69H2.11Y69H2.11n/achrV 18,644,329contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
31C12D5.9C12D5.9n/achrV 7,689,147contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
32glr-5ZC196.7n/achrV 8,718,671glr-5 encodes a kainate (non-NMDA)-type ionotropic glutamate receptor subunit; GLR-5 activity is required for normal brood sizes, especially at high temperatures; GLR-5 is expressed in neurons.
33C24D10.8C24D10.8n/achrIV 5,165,608n/a
34C11E4.4C11E4.4n/achrX 9,594,806contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
35C17E4.1C17E4.1n/achrI 9,409,217contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
36ZC443.4ZC443.4n/achrV 12,818,211contains similarity to Homo sapiens Isoform 4 of AT-rich interactive domain-containing protein 4B; ENSEMBL:ENSP00000375729
37glb-3C06H2.5n/achrV 11,139,410glb-3 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
38srd-23Y40H7A.5n/achrIV 15,181,398C. elegans SRD-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39des-2T26H10.1n/achrV 11,417,794des-2 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating the fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; DES-2 is coexpressed with and genetically interacts with DEG-3, which which it probably forms heteromultimers, and DES-2 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, probably unique to nematodes, which includes DEG-3, ACR-5, ACR-17, ACR-18 ACR-20, and ACR-23.
40Y106G6G.2Y106G6G.2n/achrI 10,325,764contains similarity to Interpro domain IPR000904 (SEC7-like)
41T16H12.9T16H12.9n/achrIII 10,110,649contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RNA polymerase I subunit A34.5; SGD:YJL148W
42C01G10.4C01G10.4n/achrV 15,089,864contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q5HDQ9
43cwp-5F48C11.2n/achrX 13,184,746C. elegans CWP-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
44F45C12.1F45C12.1n/achrII 1,740,047contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domains IPR000494 (EGF receptor, L domain), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
45F01D4.8F01D4.8n/achrIV 10,451,925contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domain IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit)
46C55A6.6C55A6.6n/achrV 11,514,222contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
47W03F11.4W03F11.4n/achrI 2,238,497contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
48dod-6T20G5.7n/achrIII 10,197,925C. elegans DOD-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
49C50D2.6C50D2.6n/achrII 86,096
50F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450