UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T01C3.5T01C3.54e-137chrV 14,997,353contains similarity to Oryza sativa Similar to gene for Pib.; TR:Q9LWW7
2C08G5.3C08G5.3n/achrII 744,119contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
3F47C12.7F47C12.7n/achrIV 3,994,654contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
4F07E5.8F07E5.8n/achrII 2,074,096contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
5K04F1.8K04F1.8n/achrV 1,667,509
6H38K22.4H38K22.4n/achrIII 4,323,189contains similarity to Interpro domain IPR010070 ()
7T11G6.7T11G6.7n/achrIV 10,844,729contains similarity to Fundulus heteroclitus Lens major intrinsic protein.; TR:Q9PUE2
8C17H12.6C17H12.6n/achrIV 6,821,899contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
9Y56A3A.9Y56A3A.9n/achrIII 11,884,269contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR000694 (Proline-rich region)
10srd-23Y40H7A.5n/achrIV 15,181,398C. elegans SRD-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11K09D9.11K09D9.11n/achrV 3,999,279contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
12T22F3.8T22F3.8n/achrV 3,603,747contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
13Y69H2.11Y69H2.11n/achrV 18,644,329contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
14tbx-33Y66A7A.8n/achrIII 11,635,769C. elegans TBX-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
15F49F1.6F49F1.6n/achrIV 4,122,198contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
16C09D4.3C09D4.3n/achrI 5,489,487contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
17C43F9.5C43F9.5n/achrIV 10,590,044contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
18kin-23W04G5.6n/achrI 11,641,436kin-23 encodes a predicted protein tyrosine kinase; like KIN-30, KIN-23 contains an unusual K to R substitution in kinase subdomain VII; kin-23 mRNA is expressed strongly during the L1/L2 larval stages, weakly in L3 and L4 stages, and at undetectable levels in adults.
19F26A1.3F26A1.3n/achrIII 4,827,878contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
20des-2T26H10.1n/achrV 11,417,794des-2 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating the fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; DES-2 is coexpressed with and genetically interacts with DEG-3, which which it probably forms heteromultimers, and DES-2 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, probably unique to nematodes, which includes DEG-3, ACR-5, ACR-17, ACR-18 ACR-20, and ACR-23.
21C35E7.6C35E7.6n/achrI 10,818,223
22F41D3.6F41D3.6n/achrI 12,265,384contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
23srd-20Y38A10A.1n/achrV 6,056,149C. elegans SRD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24F11D5.6F11D5.6n/achrX 3,325,709
25F48B9.3F48B9.3n/achrX 2,165,518contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
26acc-4T27E9.9n/achrIII 13,482,337C. elegans ACC-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
27clec-58ZK666.3n/achrII 10,475,101C. elegans CLEC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
28T21E8.4T21E8.4n/achrX 10,882,602contains similarity to Rattus norvegicus Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase (EC 1.1.1.49) (G6PD).; SW:G6PD_RAT
29Y18D10A.2Y18D10A.2n/achrI 12,808,033contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
30flp-23F22B7.2n/achrIII 8,651,368C. elegans FLP-23 protein ;
31sma-1R31.1n/achrV 11,908,070sma-1 encodes a beta-H spectrin; during embryonic morphogenesis, SMA-1 activity is required for a normal rate of elongation and thus, for a wild-type body length upon hatching; in addition, SMA-1 is required for proper morphogenesis of the pharynx and the excretory cell; sma-1 mRNA transcripts are first detected in hypodermal cells at the beginning of embryonic morphogenesis with later expression visible in the developing pharynx, intestine, and excretory cell.
32T22H2.2T22H2.2n/achrI 11,705,155contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
33sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
35K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
36C07H4.1C07H4.1n/achrII 9,091,587contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical conserved protein.; TR:Q8ETI8
37Y38H6C.18Y38H6C.18n/achrV 20,542,275contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Chromatin Assembly Complex, subunit 1: largest (p90) subunit of three-subunit protein complex (yeast CAF-I) involved in DNA-replication-linked nucleosome assembly. Homol. to p150 subunit human Chromatin Assembly Factor-I (CAF-I); SGD:YPR018W
38F44B9.9F44B9.9n/achrIII 8,030,412contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
39srg-51Y40H7A.8n/achrIV 15,139,977C. elegans SRG-51 protein ;
40K09C6.7K09C6.7n/achrV 837,078contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
41ZC504.1ZC504.1n/achrX 10,408,560contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
42C11E4.4C11E4.4n/achrX 9,594,806contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
43col-64F52F12.2n/achrI 9,894,637C. elegans COL-64 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
44K04F1.6K04F1.6n/achrV 1,671,713contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
45Y17D7B.2Y17D7B.2n/achrV 18,788,749contains similarity to Xenopus laevis Phosphoinositide-3-kinase.; TR:Q8UUU2
46ZC132.2ZC132.2n/achrV 4,311,620
47C31A11.1C31A11.1n/achrV 16,294,149contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
48srz-1F14F8.3n/achrV 16,676,674srz-1 encodes a predicted seven-pass G protein-coupled receptor; as loss of srz-1 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, the precise role of SRZ-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
49ZC8.6ZC8.6n/achrX 4,985,068contains similarity to Pfam domain PF00454 Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase contains similarity to Interpro domain IPR000403 (Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic)
50B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918