UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T01B6.4T01B6.41.0000000000000001e-75chrX 2,337,975
2F57H12.5F57H12.5n/achrIV 7,968,487contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
3C47E12.10C47E12.10n/achrIV 9,973,388contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR004296 (Protein of unknown function DUF236)
4Y69E1A.3Y69E1A.3n/achrIV 10,953,548contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
5Y66A7A.4Y66A7A.4n/achrIII 11,614,038
6Y116A8C.37Y116A8C.37n/achrIV 17,130,526contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
7snb-5C30A5.5n/achrIII 8,204,022snb-5 encodes a predicted synaptobrevin.
8F20D6.1F20D6.1n/achrV 8,191,303contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
9T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
10spe-8F53G12.6n/achrI 119,489C. elegans SPE-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
11clec-104Y18D10A.10n/achrI 12,860,337C. elegans CLEC-104 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12W02B3.7W02B3.7n/achrIII 691,490contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
13F32B6.10F32B6.10n/achrIV 9,888,531contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14F44D12.8F44D12.8n/achrIV 10,024,253contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of MAP7 domain-containing protein 1; ENSEMBL:ENSP00000362244
15C18G1.3C18G1.3n/achrV 4,762,839contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
16C35B1.3C35B1.3n/achrIV 4,081,235
17clec-233F21H7.4n/achrV 16,234,383C. elegans CLEC-233 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
18ZK849.5ZK849.5n/achrI 14,202,318contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
19T05D4.5T05D4.5n/achrIII 13,582,099contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR000533 (Tropomyosin)
20skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
21clec-108Y26D4A.6n/achrI 13,081,794C. elegans CLEC-108 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
22M110.7M110.7n/achrII 8,235,210contains similarity to Pfam domain PF01237 Oxysterol-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR000648 (Oxysterol-binding protein)
23F46A8.4F46A8.4n/achrI 11,241,589contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
24F25H5.2F25H5.2n/achrI 9,180,480
25F56F4.4F56F4.4n/achrI 6,138,476
26srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27nhr-225T27B7.2n/achrV 2,289,169C. elegans NHR-225 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
28K05F1.1K05F1.1n/achrII 5,802,499contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
29M162.7M162.7n/achrV 19,789,204contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
30C16C8.8C16C8.8n/achrII 3,461,412
31F59A6.2F59A6.2n/achrII 5,015,006contains similarity to Homo sapiens High mobility group protein 1-like 10; ENSEMBL:ENSP00000215935
32F21A3.4F21A3.4n/achrV 15,537,300contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC338999 isoform 2; HI:HIT000389435
33F41D3.7F41D3.7n/achrI 12,267,272contains similarity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus ORF 5 (Fragment).; TR:O71053
34T10D4.7T10D4.7n/achrII 3,118,051contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
35C46H11.6C46H11.6n/achrI 5,022,021contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
36T22H9.3T22H9.3n/achrV 345,542contains similarity to Pfam domains PF02170 (PAZ domain) , PF02171 (Piwi domain) contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
37T28D9.9T28D9.9n/achrII 6,484,502
38C55B7.10C55B7.10n/achrI 6,502,907contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
39C50E10.2C50E10.2n/achrII 12,306,600contains similarity to Pfam domain PF06887 (Protein of unknown function (DUF1265))
40F59A1.6F59A1.6n/achrV 17,685,618contains similarity to Brachydanio rerio SI:dZ186F8.4 (Novel immune-type receptor) (Fragment).; TR:Q8UVA1
41F16G10.10F16G10.10n/achrII 2,390,323contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
42T09A12.1T09A12.1n/achrIV 8,245,495contains similarity to Xenopus laevis DNA topoisomerase 1 (EC 5.99.1.2) (DNA topoisomerase I).; SW:P41512
43clec-134W10G11.11n/achrII 3,580,752C. elegans CLEC-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
44C04E6.5C04E6.5n/achrV 5,903,504contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
45T08H10.4T08H10.4n/achrV 4,480,975contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
46F36G9.15F36G9.15n/achrV 15,987,734contains similarity to Pfam domain PF06678 Protein of unknown function (DUF1179) contains similarity to Interpro domain IPR009564 (Protein of unknown function DUF1179)
47F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
48sulp-6W01B11.2n/achrI 3,290,255sulp-6 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-6 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a sulp-6::GFP transcriptional fusion is expressed in the posterior intestine.
49sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50F36H12.14F36H12.14n/achrIV 5,263,576