UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T01A4.3T01A4.30chrI 4,465,379contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3srm-3F58G6.2n/achrIV 9,649,830C. elegans SRM-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4scm-1M01D7.2n/achrI 1,867,460C. elegans SCM-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04144 SCAMP family contains similarity to Interpro domains IPR001395 (Aldo/keto reductase), IPR007273 (SCAMP)
5zyg-8Y79H2A.11n/achrIII 12,066,888The zyg-8 gene encodes a protein with a doublecortin-like domain and a protein kinase domain; mutations of zyg-8 impair mitosis at the one-cell embryonic stage, which is normally asymmetrical, but which fails to show proper asymmetry in zyg-8 mutant embryos.
6K02E10.1K02E10.1n/achrX 2,498,552contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras)
7F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
8srz-23F58E2.9n/achrIV 3,454,195C. elegans SRZ-23 protein ;
9ZC190.6ZC190.6n/achrV 8,675,924
10F21H7.3F21H7.3n/achrV 16,232,966contains similarity to Rickettsia conorii Hypothetical protein RC0540.; TR:Q92I80
11hlh-29F31A3.4n/achrX 17,548,141C. elegans HLH-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
12Y43F8C.13Y43F8C.13n/achrV 19,691,051contains similarity to Pfam domain PF01156 Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001910 (Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase)
13bath-34W02A11.5n/achrI 12,751,040C. elegans BATH-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
14srab-13F59A7.3n/achrV 2,026,295C. elegans SRAB-13 protein ;
15Y49G5B.1Y49G5B.1n/achrV 5,228,330contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
16clec-195Y116A8C.21n/achrIV 17,044,558C. elegans CLEC-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
17srbc-58R09E12.2n/achrV 776,135C. elegans SRBC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18chn-1T09B4.10n/achrI 6,182,743chn-1 encodes an ortholog of mammalian carboxyl-terminus of Hsc70 interacting protein (CHIP), an E4 ubiquitin-chain elongation factor; chn-1 is ubiquitously expressed; chn-1(by155) mutants are viable and superficially normal, but have reduced fertility and arrest as larvae if subjected to heat shock; chn-1 overexpression causes either embryonic lethality (if strong) or defective egg-laying and locomotion, along with constitutive dauer formation (if weak); chn-1(by155) mutations suppress viable unc-45(e286ts) and unc-45(m94ts) mutations, but not lethal unc-45(st604) ones; chn-1(by155) mutants, unlike wild-type, show defective sarcomeres if overexpressing unc-45 from a extrachromosomal array; CHN-1 binds the ubiquitin conjugating enzyme UFD-2, which in turn binds the Hsp90 cochaperone UNC-45; UNC-45 is a substrate for CHN-1- and UFD-2-dependent multiubiquitination; the parkin ortholog PDR-1 binds CHN-1, and requires CHN-1 for self-ubiquitination; chn-1(RNAi) animals accumulate abnormally phosphorylated tau proteins.
19R05D7.5R05D7.5n/achrI 12,186,205contains similarity to Ascaris suum P40.; TR:Q7YXJ9
20Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
21F21D5.9F21D5.9n/achrIV 8,724,343contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
22F36D1.1F36D1.1n/achrI 11,278,248contains similarity to Interpro domain IPR006578 (MADF)
23Y39A1C.1Y39A1C.1n/achrIII 10,857,346contains similarity to Xylella fastidiosa Hypothetical protein Xf0776.; TR:Q9PFA2
24T13F2.9T13F2.9n/achrIV 9,768,468contains similarity to Interpro domain IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
25F52B11.5F52B11.5n/achrIV 14,102,592contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE2159.; TR:Q8XIG1
26Y49F6C.7Y49F6C.7n/achrII 3,367,722
27W04G3.7W04G3.7n/achrX 11,084,822contains similarity to Interpro domain IPR001211 (Phospholipase A2)
28ceh-13R13A5.5n/achrIII 7,556,858a homolog of Hox genes of labial/Hox1 type; affects viability, body shape and anterior patterning during embryogenesis, interacts genetically with hox genes; and is expressed in A, D, E and MS lineages in the early embryo, and in the anterior dorsal hypodermal cells, anterior body wall muscle cells, and in the cells of the prospective ventral nerve cord at the comma stage; and in the ventral nerve cord and and ventral and dorsal hypodermal cells in L1 larvae.
29Y73C8C.3Y73C8C.3n/achrV 3,116,714contains similarity to Homo sapiens Isoform 3 of Centromeric protein E; ENSEMBL:ENSP00000369365
30Y7A5A.2Y7A5A.2n/achrX 15,772,148contains similarity to Aquifex aeolicus Hypothetical protein AQ_372.; SW:Y372_AQUAE
31gcy-37C54E4.3n/achrIV 2,154,905gcy-37 encodes a predicted soluble guanylyl cyclase that is expressed in four candidate sensory neurons connected to the pseudocoelom, URXL, URXR, AQR, and PQR; as loss of gcy-37 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-37 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; GCY-37 expression in neurons connected to the pseudocoelom suggests, however, that GCY-37 may play a role in fluid homeostasis.
32T02G5.11T02G5.11n/achrII 7,080,284contains similarity to Pfam domain PF05741 Nanos RNA binding domain contains similarity to Interpro domain IPR008705 (Zinc finger, Nanos)
33F52C12.4F52C12.4n/achrIV 1,934,886contains similarity to Pfam domains PF01535 (PPR repeat) , PF02141 (DENN (AEX-3) domain) , PF03456 (uDENN domain) , PF03455 (dDENN domain) contains similarity to Interpro domains IPR005112 (dDENN), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR005113 (uDENN), IPR002885 (Pentatricopeptide repeat), IPR001194 (DENN)
34R10D12.7R10D12.7n/achrV 13,950,209contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
35srd-44F17A2.8n/achrX 12,339,267C. elegans SRD-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36Y38H6C.8Y38H6C.8n/achrV 20,510,594contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR002350 (Proteinase inhibitor I1, Kazal), IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR002352 (Eosinophil major basic protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37W03C9.1W03C9.1n/achrII 11,961,452contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
38R11.3R11.3n/achrX 16,198,339contains similarity to Haemophilus influenzae Hypothetical protein HI0386.; SW:YBGC_HAEIN
39F09C11.1F09C11.1n/achrIV 543,658
40fbxa-137T27B7.7n/achrV 2,280,414C. elegans FBXA-137 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
41elp-1F38A6.2n/achrV 20,762,946elp-1 encodes a WD repeat-containing protein that is the sole C. elegans EMAP (echinoderm microtubule-associated protein) homolog; ELP-1 binds microtubules in vitro, but as loss of ELP-1 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of ELP-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; ELP-1 is expressed in many tissues, including body wall muscle, male-specific sex muscles, the vulva, spermatheca, sensory neurons, and intestinal cells.
42C08G9.2C08G9.2n/achrIV 7,668,512contains similarity to Pfam domains PF02822 (Antistasin family) (6), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) , PF00095 (WAP-type (Whey Acidic Protein) 'four-disulfide core') (8), PF00086 (Thyroglobulin type-1 repeat) (6)contains similarity to Interpro domains IPR000716 (Thyroglobulin type-1), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR008197 (Whey acidic protein, 4-disulphide core), IPR008198 (Proteinase inhibitor I17), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR004094 (Proteinase inhibitor I15, antistasin), IPR015874 (4-disulphide core), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type), IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal), IPR000737 (Proteinase inhibitor I7, squash)
43chw-1F22E12.2n/achrV 10,463,355C. elegans CHW-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
44F49C12.12F49C12.12n/achrIV 9,320,583contains similarity to Homo sapiens RNase K; VG:OTTHUMP00000182776
45C05D12.5C05D12.5n/achrII 11,434,516contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Cingulin-like protein 1; ENSEMBL:ENSP00000281282
46nhr-181F38H12.3n/achrV 4,097,665nhr-181 encodes a putative nuclear hormone receptor (NHR), belonging to a large nematode-specific expanded family of NHRs, that inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
47Y49E10.25Y49E10.25n/achrIII 12,490,261contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
48E04A4.6E04A4.6n/achrIV 4,746,804contains similarity to Homo sapiens Isoform 5 of Tectonic-1 precursor; ENSEMBL:ENSP00000380771
49W08F4.11W08F4.11n/achrII 593,637
50Y39A1A.17Y39A1A.17n/achrIII 10,688,996contains similarity to Interpro domain IPR001611 (Leucine-rich repeat)