UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1R52.5R52.59.999999999999999e-87chrII 2,109,416contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C55B6.4C55B6.4n/achrX 7,187,869
4str-113Y39H10B.1n/achrV 3,665,916C. elegans STR-113 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
6srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7clec-120F29A7.7n/achrII 2,756,519C. elegans CLEC-120 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
8srg-30W02F12.7n/achrV 6,717,559C. elegans SRG-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
9W06B3.1W06B3.1n/achrX 12,015,209contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR004821 (Cytidyltransferase-related), IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)
10R106.1R106.1n/achrX 17,479,990
11clec-231C29F3.4n/achrV 15,350,031C. elegans CLEC-231 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12F02C12.4F02C12.4n/achrX 13,393,433contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
13srh-241F37B4.6n/achrV 2,868,696C. elegans SRH-241 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
14gcy-9ZK455.2n/achrX 11,335,257gcy-9 encodes a membrane guanylyl cyclase; gcy-9 expression is reportedly weak and variable in non-neuronal tissues.
15srt-6R13D7.10n/achrV 7,408,161C. elegans SRT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
16C18A11.4C18A11.4n/achrX 8,046,427contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)
17R05D7.3R05D7.3n/achrI 12,169,337contains similarity to Interpro domain IPR000085 (Bacterial DNA recombination protein, RuvA)
18fip-5F41E7.4n/achrX 10,302,828C. elegans FIP-5 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000480 (Glutelin)
19srx-137F09F3.13n/achrV 13,863,436C. elegans SRX-137 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
20F10A3.12F10A3.12n/achrV 16,164,918contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21W04D2.5W04D2.5n/achrV 12,493,975contains similarity to Pfam domain PF00411 Ribosomal protein S11 contains similarity to Interpro domain IPR001971 (Ribosomal protein S11)
22B0284.3B0284.3n/achrIII 4,380,175contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
23srbc-21C45H4.7n/achrV 2,156,083C. elegans SRBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001118 (Na+/H+ exchanger, isoform 3 (NHE3))
24sre-30F57G9.2n/achrII 12,405,637C. elegans SRE-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
25D1014.4D1014.4n/achrV 8,134,170
26K08D10.11K08D10.11n/achrIV 4,185,528
27srw-1Y75B12B.7n/achrV 15,198,801C. elegans SRW-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
28F02E11.4F02E11.4n/achrII 3,276,774contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
29srd-41F17A2.6n/achrX 12,327,467C. elegans SRD-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
30srv-34F13A7.3n/achrV 16,373,569C. elegans SRV-34 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000355 (Chemokine receptor)
31C34B2.9C34B2.9n/achrI 10,701,670contains similarity to Interpro domain IPR001904 (Paxillin)
32T21D9.2T21D9.2n/achrX 2,095,709contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
33C10E2.5C10E2.5n/achrX 16,752,685
34sri-69Y102A5C.32n/achrV 17,007,786C. elegans SRI-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35F36H12.17F36H12.17n/achrIV 5,277,187
36C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
37cnc-5R09B5.10n/achrV 1,445,607cnc-5 encodes one of six C. elegans caenacin peptides; CNC-5 is predicted to be a secreted protein that, based upon similarity to CNC-2, -4, and -6, may function as an antimicrobial peptide in the innate immune response.
38C05D9.3C05D9.3n/achrX 1,114,346contains similarity to Pfam domain PF07974 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR002369 (Integrin beta subunit, N-terminal), IPR001169 (Integrin beta subunit, C-terminal), IPR015812 (Integrin beta subunit), IPR003659 (Plexin/semaphorin/integrin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
39sri-9Y102A5C.29n/achrV 17,002,496C. elegans SRI-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B)
40R155.4R155.4n/achrIII 1,978,876contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
41Y113G7A.14Y113G7A.14n/achrV 20,132,595contains similarity to Lumpy skin disease virus LSDV134 variola virus B22R-like protein.; TR:Q91MN0
42F46E10.3F46E10.3n/achrV 6,519,002contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
43srx-131F09F3.2n/achrV 13,846,060C. elegans SRX-131 protein ;
44srv-36F57G8.8n/achrV 16,324,110C. elegans SRV-36 protein ;
45F28A10.7F28A10.7n/achrII 845,493contains similarity to Interpro domain IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
46R17.3R17.3n/achrIII 10,836,977R17.3 encodes an ortholog of human retinal pigment epithelium (RPE)-spondin (RPESP).
47Y56A3A.33Y56A3A.33n/achrIII 12,001,104contains similarity to Pfam domain PF00929 Exonuclease contains similarity to Interpro domains IPR013520 (Exonuclease, RNase T and DNA polymerase III), IPR006055 (Exonuclease), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
48clec-163Y39A1B.1n/achrIII 10,795,241C. elegans CLEC-163 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
49sri-65F13A7.8n/achrV 16,387,488C. elegans SRI-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I)
50C46G7.3C46G7.3n/achrIV 6,007,411contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)