UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1shw-3R186.50chrV 12,974,845C. elegans SHW-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003973 (Potassium channel, voltage dependent, Kv2), IPR003970 (Potassium channel, voltage dependent, Kv8), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003969 (Potassium channel, voltage dependent, Kv6), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
2F59A3.10F59A3.10n/achrI 5,542,985
3srh-174F40D4.1n/achrV 17,179,348C. elegans SRH-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4F53B1.8F53B1.8n/achrX 2,126,824contains similarity to Interpro domain IPR001441 (Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase)
5C28F5.4C28F5.4n/achrII 7,521,547contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
6ZK938.6ZK938.6n/achrII 9,844,266contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
7tag-117C01B7.4n/achrV 8,794,107C. elegans TAG-117 protein; contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) , PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) contains similarity to Interpro domains IPR011511 (Variant SH3), IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001452 (Src homology-3)
8lact-3M28.6n/achrII 10,654,998lact-3 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted signal sequence; loss of lact-3 activity via RNAi has been reported to result in reduced fat content.
9C34E7.3C34E7.3n/achrX 12,931,101contains similarity to Plasmodium falciparum Ribonuclease, putative.; TR:Q8ICL5
10T07H6.4T07H6.4n/achrX 6,284,028contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002396 (Selectin (CD62E/L/P antigen)), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
11F25H2.2F25H2.2n/achrI 10,544,713contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) , PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001683 (Phox-like), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
12C39F7.1C39F7.1n/achrV 1,261,350
13Y54E2A.10Y54E2A.10n/achrII 14,791,729contains similarity to Dictyostelium discoideum Protein-tyrosine phosphatase 3 (EC 3.1.3.48) (Protein-tyrosine-sphosphate phosphohydrolase 3).; SW:PTP3_DICDI
14C01F1.4C01F1.4n/achrII 4,277,663contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15R05A10.3R05A10.3n/achrIV 14,175,025contains similarity to Saccharomyces cerevisiae <b><u>C</u></b>onserved <b><u>O</u></b>ligomeric <b><u>G</u></b>olgi complex <b><u>1</u></b><br> Complexed with Cog8p; interacts with Cog2p; SGD:YGL223C
16sra-1AH6.4n/achrII 9,520,857sra-1 encodes a predicted seven transmembrane receptor; expressed in the male SPD and SPV neurons.
17Y6B3B.1Y6B3B.1n/achrI 13,699,504contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
18F40A3.7F40A3.7n/achrV 7,897,725contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19C38D9.5C38D9.5n/achrV 17,589,380contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
20qui-1Y45F10B.10n/achrIV 13,568,114The qui-1 gene encodes a protein of unknown function that contains several WD-40 domains.
21F18F11.4F18F11.4n/achrIV 332,622contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
22snt-2F42G9.7n/achrIII 789,889C. elegans SNT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
23cmk-1K07A9.2n/achrIV 1,829,288cmk-1 encodes a Ca+2/calmodulin-dependent protein kinase I (CaMK1); CMK-1 activity is required, cell autonomously and downstream of the cyclic nucleotide-gated channel TAX-4, for several aspects of AFD thermosensory neuron differentiation, including expression of the gcy-8 guanylyl cyclase and nhr-38 nuclear hormone receptor genes and morphology of the AFD sensory endings; cmk-1 activity is thus also required for normal thermosensory behavior; a cmk-1::gfp reporter is expressed in head sensory and interneurons as well as in the ventral nerve cord; expression is seen specifically in the neurons of the thermosensory circuit, AFD, AIY, and AIZ; CMK-1 localizes exclusively to the cytoplasm.
24nhr-207R07B7.14n/achrV 12,097,016C. elegans NHR-207 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR001728 (Thyroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
25T13C2.2T13C2.2n/achrII 6,795,686
26ugt-20K08B4.4n/achrIV 6,082,263C. elegans UGT-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
27C24A8.1C24A8.1n/achrX 4,323,582C24A8.1 encodes an homolog of mammalian D2 or D3 dopamine receptors, and a paralog of DOP-2/-3; C24A8.1 is expressed in the nervous system; because of its paralogy, C24A8.1 might act redundantly with DOP-2 to promote the basal slowing response to bacterial feeding, or it might account for the residual response to excess dopamine seen in triple dop-1/-2/-3 mutants; but C24A8.1 otherwise has no obvious function in RNAi assays of brood size, egg laying, pharyngeal pumping, locomotion, or male mating.
28dod-22F55G11.5n/achrIV 12,966,321C. elegans DOD-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
29E03A3.5E03A3.5n/achrIII 4,061,679contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold)
30elc-2W03H1.2n/achrX 1,777,746elc-2 encodes a protein containing a Skp1 dimerisation domain that has homology to human transcription elongation factor B (SIII), polypeptide I (15kD, elonginsC).
31Y54E2A.1Y54E2A.1n/achrII 14,736,737contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32clec-192Y116A8A.1n/achrIV 16,803,039C. elegans CLEC-192 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33fbxa-148Y102A5C.9n/achrV 16,939,509C. elegans FBXA-148 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
34srj-5F31F4.16n/achrV 652,439C. elegans SRJ-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35hda-4C10E2.3n/achrX 16,737,045hda-4 encodes a class II histone deacetylase that contains a putative MEF-2 DNA binding domain, a nuclear localization signal domain, and a single catalytic domain and may affect locomotion, body morphology, and growth; interacts with MEF-2 in in vitro assays and is expressed in body-wall muscle, neurons, and hypodermal seam cells
36F23A7.3F23A7.3n/achrX 16,221,101contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Endocytosis protein end4 (SLA2 protein homolog).; SW:Q9P6L5
37gur-4K09E4.5n/achrII 14,106,298C. elegans GUR-4 protein ;
38C15C8.1C15C8.1n/achrV 12,735,091contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003073 (Orphan nuclear receptor, NURR type)
39srw-7R08F11.5n/achrV 3,806,992C. elegans SRW-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
40K01A11.2K01A11.2n/achrIII 3,426,861contains similarity to Xenopus laevis LOC495955 protein.; TR:Q5PQ79
41str-15T08G3.1n/achrV 16,458,013C. elegans STR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42sri-10C54E10.4n/achrV 18,805,260C. elegans SRI-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR016040 (NAD(P)-binding)
43F45E1.2F45E1.2n/achrX 8,003,850
44F58E2.2F58E2.2n/achrIV 3,470,373
45B0379.1B0379.1n/achrI 10,076,345contains similarity to Plasmodium falciparum ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, putative.; TR:Q8IL98
46sru-24F31F4.13n/achrV 669,671C. elegans SRU-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
47fozi-1K01B6.1n/achrIII 9,291,244fozi-1 encodes an unusual zinc-finger protein that has two C2H2 zinc-finger motifs that probably mediate transcriptional regulation along with a glutamine-rich region and a vestigial formin homology 2 (FH2) domain that has lost its ability to polymerize actin but retained its ability to dimerize; during postembryonic development, FOZI-1 acts with MAB-5 and redundantly with HLH-1/CeMyoD to autonomously specify coelomocyte and striated body wall muscle fates; in addition, fozi-1 is required for the fully asymmetrical phenotypic distinction of ASER cells from ASEL cells; fozi-1 mutant animals variably express flp-4, gcy-6, gcy-7 and lim-6, genes normally restricted to ASEL, in ASER as well, while maintaining expression of ASER-specific genes; ectopic FOZI-1 expression in ASEL can suppress lim-6 expression; fozi-1 genetically interacts with several regulatory proteins and miRNAs; FOZI-1 is a nuclear protein that is expressed in neuronal lineages beginning at the 2-fold stage of embryogenesis, and then in neurons and cells derived from the M mesoblast during larval development; expression in the M lineage corresponds to cells that will generate coelomocytes and body wall muscles and is not seen in the sex myoblasts (SMs); FOZI-1 expression in the M lineage requires the Hox co-factor CEH-20.
48his-25ZK131.2n/achrII 13,824,963his-25 encodes an H3 histone.
49C11G10.1C11G10.1n/achrX 15,157,907
50K02E10.5K02E10.5n/achrX 2,477,930