UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R173.3R173.30chrX 7,033,107contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
2R07H5.9R07H5.9n/achrIV 11,208,377contains similarity to Saccharomyces cerevisiae involved in septin organization; SGD:YCL024W
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4sec-24.2ZC518.2n/achrIV 12,358,176C. elegans SEC-24.2 protein; contains similarity to Pfam domains PF04811 (Sec23/Sec24 trunk domain) , PF04815 (Sec23/Sec24 helical domain) , PF04810 (Sec23/Sec24 zinc finger) , PF00626 (Gelsolin repeat) , PF08033 (Sec23/Sec24 beta-sandwich domain) contains similarity to Interpro domains IPR006900 (Sec23/Sec24 helical region), IPR012990 (Sec23/Sec24 beta-sandwich), IPR000694 (Proline-rich region), IPR006896 (Sec23/Sec24 trunk region), IPR006895 (Zinc finger, Sec23/Sec24-type), IPR007123 (Gelsolin region)
5plc-2Y75B12B.6n/achrV 15,195,140C. elegans PLC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00387 (Phosphatidylinositol-specific phospholipase C, Y domain) , PF00388 (Phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain) contains similarity to Interpro domains IPR001192 (Phospholipase C, phosphoinositol-specific, C-terminal (PLC)), IPR000909 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific , X region), IPR001711 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific, Y domain), IPR013841 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific , X and Y boxes)
6W03G11.3W03G11.3n/achrX 12,101,925contains similarity to Pfam domain PF01120 Alpha-L-fucosidase contains similarity to Interpro domains IPR016286 (Alpha-L-fucosidase), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR000933 (Glycoside hydrolase, family 29 (alpha-L-fucosidase))
7K03H1.5K03H1.5n/achrIII 9,935,960contains similarity to Pfam domains PF03782 (AMOP domain) , PF06119 (Nidogen-like) , PF00094 (von Willebrand factor type D domain) , PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR005533 (AMOP), IPR002909 (Cell surface receptor IPT/TIG), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003886 (Nidogen, extracellular region), IPR016060 (Complement control module), IPR001846 (von Willebrand factor, type D)
8F13B6.1F13B6.1n/achrIV 7,457,398
9mab-10R166.1n/achrII 10,532,058C. elegans MAB-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF04905 (NAB conserved region 2 (NCD2)) , PF04904 (NAB conserved region 1 (NCD1)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR006988 (Nab, N-terminal), IPR006989 (Nab, central region)
10B0554.2B0554.2n/achrV 435,748contains similarity to Pfam domain PF02795 Domain of unknown function (DUF225) contains similarity to Interpro domain IPR004024 (Protein of unknown function DUF225)
11D1007.3D1007.3n/achrI 4,576,495
12nsy-1F59A6.1n/achrII 5,026,357nsy-1 encodes a MAP kinase kinase kinase homolog that affects chemotaxis, egg laying, and pathogen response; NSY-1 activity is activated by the calmodulin kinase UNC-43, and is required for lateral signalling that leads to asymmetric olfactory neuron fates; interacts with SEK-1, and is expressed in the intestine, hypodermis, rectal gland cells, and neurons.
13ZK892.4ZK892.4n/achrII 10,007,287ZK892.4 is orthologous to the human gene ALPHA-METHYLACYL-CoA RACEMASE (AMACR; OMIM:604489), which when mutated leads to AMACR deficiency.
14glb-13F19H6.2n/achrX 12,374,995glb-13 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
15F35D2.1F35D2.1n/achrII 7,577,252
16dpy-1M01E10.2n/achrIII 2,041,006dpy-1 encodes a collagen that affects body length and alae formation; site of action localized to the hyp7 syncytium, based on mosaic analysis.
17gon-1F25H8.3n/achrIV 9,940,393gon-1 encodes a functional metalloprotease that defines a new sub-family of secreted proteases known as MPT (metalloprotease with thrombospondin type 1 repeats); the other two members of this family are the bovine procollagen I N-protease ( PINP ) and the murine enzyme ADAMTS-1; gon-1 is essential for hermaphrodite gonadal morphogenesis; sequence homology with other metalloproteases suggests that it functions by remodelling the extracellular matrix; GON-1 is expressed at high levels within the gonadal distal tip cell during migration.
18nas-29F58A6.4n/achrII 5,140,235C. elegans NAS-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
19cogc-2C06G3.10n/achrIV 7,038,253cogc-2 encodes an ortholog of mammalian COG-2, a subunit of lobe A of the conserved oligomeric Golgi complex (COGC); COGC-2 is required for normal gonadal distal tip cell migration, a process that also requires seven other orthologs of COGC subunits; like other lobe A subunits in both C. elegans and S. cerevisiae, COGC-2 is strongly required for normal function, while lobe B subunits are only partially required in either worms or yeast.
20str-96T10H4.2n/achrV 15,293,203C. elegans STR-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21F40A3.7F40A3.7n/achrV 7,897,725contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22F56D5.6F56D5.6n/achrIV 9,407,298contains similarity to Plasmodium falciparum Putative uncharacterized protein PFD0207c.; TR:Q8I1Y6
23F34H10.4F34H10.4n/achrX 9,649,656contains similarity to Interpro domain IPR002253 (Flavin-containing monooxygenase (FMO) 1)
24Y11D7A.8Y11D7A.8n/achrIV 9,252,608contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
25E01G6.1E01G6.1n/achrX 12,263,633contains similarity to Pfam domains PF00027 (Cyclic nucleotide-binding domain) (2), PF01734 (Patatin-like phospholipase) contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR000595 (Cyclic nucleotide-binding), IPR001423 (Lysophospholipase patatin, conserved site), IPR014710 (RmlC-like jelly roll fold)
26gpr-2C38C10.4n/achrIII 9,392,118gpr-2 encodes a protein containing a GPR (G Protein Regulator)/GoLoco motif characteristic of guanine nucleotide exchange factors specific for G-alpha GTPases; GPR-2 appears to function redundantly during early embryogenesis and germ-line development to regulate chromosome and spindle movements during cell division; GPR-2 likely acts as a positive regulator of G protein signaling and specifically, may regulate GOA-1 signaling in the embryo; GPR-2 forms a protein complex with the nearly identical GPR-1 and with LIN-5, a coiled-coil protein that is required for proper localization of GPR-2 to the cell cortex and spindle asters of the early embryo; in addition, proper GPR-2/GPR-1/LIN-5 localization between the P2 and EMS blastomeres at the four-cell stage, which may contribute to spindle positioning in EMS, requires the MES-1/SRC-1 tyrosine kinase signaling pathway; GPR-2 is believed to act downstream of, or in parallel to, PAR-3, a PDZ domain-containing protein, in mitotic spindle positioning in the early embryo.
27M28.8M28.8n/achrII 10,630,658contains similarity to Interpro domain IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II)
28F59F5.1F59F5.1n/achrX 10,530,779contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
29C50D2.2C50D2.2n/achrII 110,283contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR004841 (Amino acid permease-associated region), IPR002293 (Amino acid/polyamine transporter I)
30F45B8.3F45B8.3n/achrX 14,960,981contains similarity to Interpro domains IPR003267 (Small proline-rich), IPR000694 (Proline-rich region)
31F14B8.6F14B8.6n/achrX 6,930,764
32sgcb-1K01A2.1n/achrII 327,229K01A2.1 is orthologous to the human gene SARCOGLYCAN, BETA (43KD DYSTROPHIN-ASSOCIATED GLYCOPROTEIN) (SGCB; OMIM:600900), which when mutated leads to disease.
33H22K11.2H22K11.2n/achrX 6,785,820contains similarity to Pfam domain PF01301 Glycosyl hydrolases family 35 contains similarity to Interpro domains IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR001944 (Glycoside hydrolase, family 35)
34C53B4.3C53B4.3n/achrIV 8,972,115C53B4.3 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:23098) (SLC22A1L; OMIM:602631), which when mutated leads to disease.
35T01D3.1T01D3.1n/achrV 13,691,269contains similarity to Pfam domain PF00008 (EGF-like domain)
36F18A11.2F18A11.2n/achrII 13,034,546contains similarity to Pfam domain PF00650 CRAL/TRIO domain contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal)
37klp-8C15C7.2n/achrX 3,162,174klp-8 encodes an atypical kinesin-like motor protein with the motor domain in the N-terminus; the motor domain of KLP-8 exhibits poor homology to the globular motor domain of the kinesin heavy chain.
38K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
39F10D11.4F10D11.4n/achrI 8,441,960contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
40F41G3.3F41G3.3n/achrII 6,757,638
41K04C1.4K04C1.4n/achrX 14,246,093contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
42srh-105T27A1.7n/achrII 508,784C. elegans SRH-105 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43C09B8.3C09B8.3n/achrX 6,009,216
44mom-1T07H6.2n/achrX 6,295,619mom-1 encodes a predicted O-acyltransferase that is orthologous to Porcupine proteins conserved across a wide range of species; MOM-1 functions as part of a Wnt/MAPK signaling pathway that is required maternally for endoderm induction in the early embryo; by homology, MOM-1 is predicted to be a membrane-spanning endoplasmic reticulum protein that stimulates post-translational processing of Wnt signaling molecules such as MOM-2; embryonic mosaic analysis indicates that MOM-1 activity is required in the signaling cell, P2, for proper specification of endoderm, consistent with its predicted role in processing MOM-2/Wnt.
45ubh-1F46E10.8n/achrV 6,510,664ubh-1 encodes a putative ubiquitin C-terminal hydrolase orthologous to human UCHL1 (OMIM:191342, mutated in Parkinson disease).
46Y45F3A.8Y45F3A.8n/achrIII 10,591,217contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
47C55C3.1C55C3.1n/achrIV 5,711,705contains similarity to Pfam domains PF02886 (LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain) , PF01273 (LBP / BPI / CETP family, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
48F55A12.8F55A12.8n/achrI 5,351,713contains similarity to Pfam domains PF05127 (Putative ATPase (DUF699)) , PF08351 (Domain of unknown function (DUF1726)) contains similarity to Interpro domains IPR013562 (Region of unknown function DUF1726), IPR007807 (Protein of unknown function DUF699, ATPase putative), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR013324 (RNA polymerase sigma factor, regions 3 and 4)
49F54C9.11F54C9.11n/achrII 8,584,206contains similarity to Interpro domain IPR008126 (Outer membrane adhesion, Yersinia)
50ZK228.3ZK228.3n/achrV 18,459,731contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)