UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1R13H9.6R13H9.60chrIV 5,067,998contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2C25D7.1C25D7.1n/achrV 15,036,540contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
3F53B6.4F53B6.4n/achrI 8,948,016contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
4K08C9.2K08C9.2n/achrI 11,487,661
5rmd-4F36H12.11n/achrIV 5,256,341C. elegans RMD-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
6ZK512.8ZK512.8n/achrIII 9,146,610contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CDC5 is dispensable for premeiotic DNA synthesis and recombination, but required for tripartite synaptonemal complexes, haploidization, and spores; SGD:YMR001C
7T27E7.1T27E7.1n/achrIV 14,520,345contains similarity to Bos taurus Annexin A7 (Annexin VII) (Synexin) (Fragment).; SW:ANX7_BOVIN
8gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
9K05F1.9K05F1.9n/achrII 5,800,592contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
10F07A5.2F07A5.2n/achrI 7,353,071contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Serine/arginine repetitive matrix protein 2; ENSEMBL:ENSP00000371738
11rmd-3B0491.3n/achrII 11,338,942C. elegans RMD-3 protein ; contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54XR4
12rmd-6R13H9.1n/achrIV 5,069,350C. elegans RMD-6 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
13Y67A6A.1Y67A6A.1n/achrI 9,830,034contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
14T05F1.5T05F1.5n/achrI 9,634,552contains similarity to Cyanidium caldarium Phycobilisome linker polypeptide (Anchor polypeptide) (PBS-anchorsprotein).; SW:APCE_CYACA
15T16A9.5T16A9.5n/achrV 14,214,256contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
16Y37D8A.5Y37D8A.5n/achrIII 12,854,726contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
17C45G9.4C45G9.4n/achrIII 5,063,224contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
18K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
19C18G1.9C18G1.9n/achrV 4,768,777contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
20F36H12.8F36H12.84e-53chrIV 5,259,332contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
21C24D10.2C24D10.2n/achrIV 5,163,991contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
22T23B3.5T23B3.5n/achrI 6,705,973contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
23E03H12.5E03H12.5n/achrIV 4,977,628contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
24T21G5.4T21G5.4n/achrI 6,873,167contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
25K09E4.1K09E4.10.000003chrII 14,138,852contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
26Y69E1A.1Y69E1A.1n/achrIV 10,948,034contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
27ZC317.6ZC317.6n/achrV 5,467,199
28F32H2.7F32H2.7n/achrI 8,996,424contains similarity to Staphylococcus staphylolyticus Lysostaphin precursor (EC 3.4.24.75) (Glycyl-glycine endopeptidase).; SW:LSTP_STAST
29F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
30ZK637.12ZK637.12n/achrIII 8,924,673contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YDR545W
31T28H11.7T28H11.7n/achrIV 5,015,779contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
32gln-2K03H1.1n/achrIII 9,943,903C. elegans GLN-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF03951 (Glutamine synthetase, beta-Grasp domain) , PF00120 (Glutamine synthetase, catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR008147 (Glutamine synthetase, beta-Grasp), IPR014746 (Glutamine synthetase/guanido kinase, catalytic region), IPR008146 (Glutamine synthetase, catalytic region)
33C54G4.3C54G4.3n/achrI 8,005,688contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, skeletal muscle, fetal; ENSEMBL:ENSP00000255381
34Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
35F32A11.3F32A11.3n/achrII 13,152,330contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Serine/threonine rich cell surface protein that contains an EF hand motif; involved in the regulation of cell wall beta-1,3 glucan synthesis and bud site selection; overexpression confers resistance to Hansenula mrakii killer toxin, HM-1; SGD:YDR420W
36R02D5.7R02D5.7n/achrV 14,480,818contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
37W06D4.2W06D4.2n/achrI 9,057,051contains similarity to Pyrobaculum aerophilum PaREP2b.; TR:Q8ZWN7
38F11G11.9F11G11.9n/achrII 4,862,873contains similarity to Pfam domain PF00581 Rhodanese-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001763 (Rhodanese-like)
39T22B3.3T22B3.3n/achrIV 11,703,476contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
40F41G4.4F41G4.4n/achrX 16,830,293
41T23F11.2T23F11.2n/achrIII 4,654,871contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ20276; ENSEMBL:ENSP00000262360
42C27D6.3C27D6.3n/achrII 5,173,959contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
43C39H7.1C39H7.15e-52chrIV 5,632,623contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44C01G10.14C01G10.14n/achrV 15,105,627contains similarity to Pfam domain PF03147 Ferredoxin-fold anticodon binding domain contains similarity to Interpro domain IPR005121 (Phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, ferrodoxin-fold anticodon-binding)
45Y38H8A.3Y38H8A.32e-51chrIV 13,473,210contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
46Y57A10B.7Y57A10B.7n/achrII 12,393,162contains similarity to Rattus norvegicus Merlin (Schwannomin) (Neurofibromin 2) (Fragment).; SW:MERL_RAT
47F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
48F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
49ZK637.15ZK637.15n/achrIII 8,920,543contains similarity to Ureaplasma parvum Hypothetical membrane lipoprotein.; TR:Q9PQR8
50ZK507.1ZK507.15e-24chrIII 9,100,387contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)