UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R13H9.5R13H9.51e-177chrIV 5,066,321contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2Y81G3A.1Y81G3A.1n/achrII 13,082,998Y81G3A.1 encodes a nematode-specific sperm protein; Y81G3A.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and T08G11.2); Y81G3A.1(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; Y81G3A.1 expression is enriched in spermatogenesis.
3F47D12.7F47D12.7n/achrIII 6,294,525contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF00651 (BTB/POZ domain) , PF07646 (Kelch motif) contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013069 (BTB/POZ), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
4F02E9.3F02E9.3n/achrI 8,405,244contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein required for the decapping of mRNAs, functions to allow the production of active Dcp1p, contains a pyrophosphatase MutT motif and several alpha-helical leucine-rich motifs; SGD:YNL118C
5B0273.1B0273.1n/achrIV 5,494,609
6W03D8.9W03D8.9n/achrI 2,785,349contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
7Y18D10A.21Y18D10A.21n/achrI 12,930,221contains similarity to Watermelon silver mottle virus L protein.; TR:Q9DSQ1
8F32B4.2F32B4.2n/achrI 11,513,362contains similarity to Interpro domain IPR002056 (Protein import receptor MAS20)
9Y6E2A.8Y6E2A.8n/achrV 15,725,749contains similarity to Encephalitozoon cuniculi UPF0329 protein ECU05_1680/ECU11_0050.; SW:Q8STA9
10C34F11.2C34F11.2n/achrII 5,212,509
11F36A4.2F36A4.2n/achrIV 4,271,510contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
12C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
13F36A4.4F36A4.4n/achrIV 4,267,908contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
14M7.7M7.75e-31chrIV 11,090,870contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15ZK354.7ZK354.7n/achrIV 5,302,598contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR000533 (Tropomyosin)
16T21E12.5T21E12.5n/achrI 4,412,759
17T20F5.5T20F5.5n/achrI 3,918,806contains similarity to Homo sapiens Isoform E of Proteoglycan-4 precursor; ENSEMBL:ENSP00000356454
18clec-134W10G11.11n/achrII 3,580,752C. elegans CLEC-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
19F42C5.5F42C5.5n/achrIV 7,293,350contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
20C15A11.2C15A11.2n/achrI 7,388,033contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CF92
21AH6.3AH6.3n/achrII 9,519,577contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
22mab-9T27A1.6n/achrII 518,813mab-9 encodes a member of the T-box family of transcriptional regulators containing a 200-amino acid T-box DNA-binding domain most similar to mouse Brachyury; mab-9 is involved in hindgut and male tail development, specifically affecting the fate of two posterior blast cells in the hindgut, B and F; in the male this results in a grossly abnormal tail lacking spicules, and renders them incapable of mating; in the hermaphrodite this results in hindgut defects; mab-9 may also be part of a network of T-box genes that includes tbx-8, tbx-9 and vab-7 and is important for the correct patterning of posterior cells in the developing embryo; mab-9 affects movement to some extent though the basis for this defect is unknown; MAB-9 localizes to the nucleus of B and F and their descendents during development.
23C25A8.2C25A8.2n/achrIV 7,010,276contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
24R04B5.11R04B5.11n/achrV 10,090,998contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000248104
25F46F5.9F46F5.9n/achrII 822,679contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
26ZC412.9ZC412.9n/achrV 14,881,691contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
27C56C10.6C56C10.61.0000000000000001e-39chrII 6,580,455contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
29C17F3.3C17F3.3n/achrI 6,682,871contains similarity to Interpro domains IPR000956 (Stathmin), IPR005819 (Histone H5), IPR000533 (Tropomyosin), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
30Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
31F13E9.5F13E9.5n/achrIV 10,883,638contains similarity to Helicobacter pylori;Helicobacter pylori J99 Hypothetical protein HP0031/JHP0027.; SW:Y031_HELPY
32ZK1225.4ZK1225.4n/achrI 13,215,147contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8EL91
33F47B3.1F47B3.1n/achrI 3,972,934contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
34fbxa-196T05H4.2n/achrV 6,449,403This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
35T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
36K01H12.4K01H12.4n/achrIV 9,714,029contains similarity to Simian T-lymphotropic virus 1 Rex p27 protein (Fragment).; TR:O12387
37F44D12.6F44D12.6n/achrIV 10,034,055contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein of unknown function, mediates sensitivity to salt stress; interacts physically with the splicing factor Msl1p and also displays genetic interaction with MSL1; SGD:YNL091W
38W02A2.8W02A2.8n/achrIV 13,356,775
39ZK930.4ZK930.4n/achrII 11,908,092contains similarity to Homo sapiens Similar to hypothetical protein FLJ20094; ENSEMBL:ENSP00000324274
40W03D8.5W03D8.5n/achrI 2,817,203contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
41F46F5.6F46F5.6n/achrII 814,673contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
42dct-9W03F11.3n/achrI 2,234,343C. elegans DCT-9 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
43C47E8.1C47E8.1n/achrV 14,666,582
44F36H12.4F36H12.4n/achrIV 5,269,346
45F42G4.6F42G4.6n/achrII 13,079,994F42G4.6 encodes a nematode-specific sperm protein; F42G4.6 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, T08G11.2, and Y81G3A.1); F42G4.6(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; F42G4.6 expression is enriched in spermatogenesis.
46T08H10.4T08H10.4n/achrV 4,480,975contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
47kin-5T13H10.1n/achrIV 9,968,114kin-5 encodes a predicted protein tyrosine kinase that is most closely related to the non-receptor tyrosine kinases Fes/Fps and Fer that contain an SH2 domain and a tyrosine kinase domain (OMIM:190030, murine Fes appears to be required for hemopoietic homeostasis); as loss of kin-5 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of kin-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
48R03D7.5R03D7.5n/achrII 10,948,319contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
49C38C3.3C38C3.3n/achrV 1,497,058
50F33D11.2F33D11.2n/achrI 5,848,329contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053