UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-158R13F6.84e-124chrIII 6,859,120C. elegans CLEC-158 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
2sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F35C5.4F35C5.4n/achrII 12,891,236contains similarity to Homo sapiens Mucin-2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000351956
4cwp-2C37H5.11n/achrV 4,842,261cwp-2 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
5F28A10.4F28A10.4n/achrII 844,685contains similarity to Interpro domain IPR009061 (Putative DNA binding)
6clec-124C17F4.1n/achrII 3,250,580C. elegans CLEC-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
7clec-99ZK39.8n/achrI 11,157,780C. elegans CLEC-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
8D1037.5D1037.5n/achrI 3,692,099contains similarity to Pfam domains PF01734 (Patatin-like phospholipase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR002110 (Ankyrin)
9aqp-3Y69E1A.7n/achrIV 10,962,555aqp-3 encodes an aquaglyceroporin whose expression in Xenopus oocytes increases water or glycerol permeability five- to seven-fold; loss of AQP-3 activity via mutation or RNAi results in no obvious defects; however, AQP-3, in conjunction with AQP-2, AQP-4, and AQP-8, is weakly required for recovery from hypotonic stress; AQP-3 is expressed in the intestine, excretory cell, seminal vesicle, and vas deferens.
10F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
11srw-141H27D07.2n/achrV 2,937,953C. elegans SRW-141 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
12W07G4.2W07G4.2n/achrV 13,035,710contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13W03D8.2W03D8.2n/achrI 2,799,577contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
14srh-166Y38H6C.12n/achrV 20,520,671C. elegans SRH-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15E02H9.9E02H9.9n/achrIII 2,467,742
16F07G11.7F07G11.7n/achrV 7,303,485contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
17F41D3.7F41D3.7n/achrI 12,267,272contains similarity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus ORF 5 (Fragment).; TR:O71053
18exp-1H35N03.1n/achrII 6,159,051exp-1 encodes an excitatory, cation-selective GABA receptor; EXP-1 activity is essential for the enteric muscle contractions that are the third in a series of three independent muscle contractions controlling defecation, and when expressed in Xenopus oocytes, EXP-1 is capable of forming a cation-selective GABA receptor; a rescuing EXP-1::GFP reporter fusion is expressed in the intestinal and anal depressor muscles, where it localizes to regions consistent with the positions of neuromuscular junctions; expression is also observed in neurons, including PDA, RID, ADE, and SABD.
19R02F2.6R02F2.6n/achrIII 5,478,761
20B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
21T05A6.4T05A6.4n/achrII 7,821,360contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
22srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23Y4C6B.3Y4C6B.3n/achrIV 5,335,043contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
24C32B5.15C32B5.15n/achrII 971,803This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
25T10D4.7T10D4.7n/achrII 3,118,051contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
26str-162E03H12.1n/achrIV 4,993,123C. elegans STR-162 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27C35E7.6C35E7.6n/achrI 10,818,223
28clec-193Y116A8A.3n/achrIV 16,805,692C. elegans CLEC-193 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
30Y23H5A.4Y23H5A.4n/achrI 2,618,955contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
31tag-272C34B2.1n/achrI 10,689,540C. elegans TAG-272 protein ;
32Y43F8C.15Y43F8C.15n/achrV 19,705,582
33ZK354.9ZK354.9n/achrIV 5,307,602contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
34F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
35klp-17W02B12.7n/achrII 11,466,706klp-17 encodes a C-terminal kinesin motor protein orthologous to Drosophila NCD and Saccharomyces cerevisiae KAR3; by homology, KLP-17 is predicted to function as a minus-end directed motor; loss of klp-17 activity via RNAi results in embryonic lethality generally at the one- or two-cell stage with disorganized mitotic spindles and polyploid nuclei, suggesting that KLP-17 plays a role in chromosome segregation and germline development; in situ hybridization studies reveal that klp-17 mRNA is localized specifically to cell nuclei during early development, from the one-cell stage of embryogenesis until early larval stages; a klp-17::gfp transgene did not yield detectable GFP expression, but did result in a small percentage of morphologically abnormal males and intersexual animals that grew slowly and died upon reaching maturity, consistent with a role for klp-17 in chromosome dynamics.
36ani-1Y49E10.19n/achrIII 12,449,658ani-1 encodes one of three C. elegans anillins; ANI-1 activity is required in the early embryo for cortical contractile events, including polar body extrusion, membrane ruffling, and pseudocleavage; at later stages of development, ANI-1 also plays a role in cuticle formation, coordinated locomotion, vulval development, and male tail formation; in regulating cortical events, ANI-1 appears to function by positively regulating septin (UNC-59 and UNC-61) localization to the contractile ring as well as formation of septin- and NMY-2-containing cortical patches; in telophase embryos, ANI-1 localizes to the cell cortex and cleavage furrow.
37srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;
38F25H5.2F25H5.2n/achrI 9,180,480
39clec-146Y48E1B.9n/achrII 13,592,126C. elegans CLEC-146 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
40Y54E5A.3Y54E5A.3n/achrI 14,698,399contains similarity to Escherichia coli Orf732.; TR:Q46767
41fbxa-99F36G9.14n/achrV 15,982,244This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
42ferl-1T05E8.1n/achrI 5,457,629C. elegans FERL-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00168 (C2 domain) , PF08165 (FerA (NUC095) domain) , PF08150 (FerB (NUC096) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012561 (FerB), IPR006614 (Dysferlin, C-terminal), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR012560 (FerA), IPR006613 (Dysferlin, N-terminal), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
43F41D3.8F41D3.8n/achrI 12,267,803contains similarity to Pfam domain PF01697 (Domain of unknown function)
44Y38H6C.18Y38H6C.18n/achrV 20,542,275contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Chromatin Assembly Complex, subunit 1: largest (p90) subunit of three-subunit protein complex (yeast CAF-I) involved in DNA-replication-linked nucleosome assembly. Homol. to p150 subunit human Chromatin Assembly Factor-I (CAF-I); SGD:YPR018W
45nhr-225T27B7.2n/achrV 2,289,169C. elegans NHR-225 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
46F28B1.2F28B1.2n/achrV 17,047,282contains similarity to Arabidopsis thaliana T12C22.10 protein.; TR:Q9LPE8
47F59A7.7F59A7.7n/achrV 2,012,769contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domain IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit)
48K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
49C14E2.4C14E2.4n/achrX 1,819,435contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
50T16H12.9T16H12.9n/achrIII 10,110,649contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RNA polymerase I subunit A34.5; SGD:YJL148W