UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1R13F6.10R13F6.100chrIII 6,867,259contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3let-754C29E4.8n/achrIII 7,950,857let-754 was identified in screens for ethyl methane sulfonate-induced lethal mutations on chromosome III; the let-754 mutation results in mid larval lethality; the molecular identity of let-754 is not yet known.
4pgk-1T03F1.3n/achrI 3,868,329T03F1.3 is orthologous to the human gene PHOSPHOGLYCERETE KINASE 1 (PGK1; OMIM:311800), which when mutated leads to hemolytic anemia and neurologic disturbances.
5F23B12.5F23B12.5n/achrV 14,446,285F23B12.5 is orthologous to the human gene DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE (DLD; OMIM:109720), which when mutated leads to lactic acidosis due to lipoamide dehydrogenase deficiency; F23B12.5 protein is predicted to be mitochondrial.
6hsp-1F26D10.3n/achrIV 17,280,029hsp-1 encodes hsp70A, a member of the heat shock family of proteins; hsp70A is closely related to the Drosophila heat inducible hsp70s and the S. cerevisiae SSA hsp70 subfamily; the hsp-1 gene is normally expressed throughout development and upon heat-shock the hsp-1 mRNA is enhanced 2-6 fold; down-regulation of hsp-1 via RNA interference results in a small reduction in the life-span of an age-1 mutant indicating that hsp-1 may play some role in regulating longevity.
7gst-36R07B1.4n/achrX 9,862,249C. elegans GST-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR003083 (S-crystallin), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
8rps-13C16A3.9n/achrIII 6,374,498rps-13 encodes a small ribosomal subunit S13 protein; by homology, RPS-13 is predicted to function in protein biosynthesis; in C. elegans, RPS-13 activity is required for embryonic and germline development.
9C26B9.5C26B9.5n/achrX 5,330,863contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
10R10H10.3R10H10.3n/achrIV 10,390,865contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016857 (Uncharacterised conserved protein UCP027682, CUB, vWA), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
11clec-262ZC15.2n/achrV 20,309,111C. elegans CLEC-262 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
12T08B1.1T08B1.1n/achrV 1,984,861contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR000817 (Prion protein), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
13dap-3C14A4.2n/achrII 10,581,748dap-3 is an ortholog of mammalian death-associated protein 3 (DAP3), a mitochondrial ribosomal protein that promotes apoptosis.
14R03D7.1R03D7.1n/achrII 10,928,740R03D7.1 is orthologous to the human gene METHIONINE SYNTHASE (MTR; OMIM:156570), which when mutated leads to disease.
15T04A8.5T04A8.5n/achrIII 4,690,700contains similarity to Pfam domains PF00310 (Glutamine amidotransferases class-II) , PF00156 (Phosphoribosyl transferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II), IPR005854 (Amidophosphoribosyl transferase), IPR000836 (Phosphoribosyltransferase), IPR002375 (Purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase, conserved site)
16F47B10.2F47B10.2n/achrX 10,894,920F47B10.2 is orthologous to the human gene HISTIDASE (HAL; OMIM:235800), which when mutated leads to disease.
17K08D8.6K08D8.6n/achrIV 12,888,793contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3), IPR003366 (CUB-like region)
18pqn-47F59B10.1n/achrII 10,499,684pqn-47 encodes a protein with a glutamine/asparagine-rich domain, homologous to human C11orf9 and Drosophila CG3328, that is required for locomotion, vulval development, full body size, cuticular integrity, and general health in mass RNAi assays; pqn-47(cxP5915) homozygotes are sluggish.
19gas-1K09A9.5n/achrX 15,588,527The gas-1 gene encodes a 49 kDa subunit of mitochondrial complex I that is required for oxidative phosphorylation, resistance to volatile anesthetics, fecundity, and normal lifespan; gas-1 is expressed in the nematode neuromuscular system; its subcellular distribution appears to be mitochondrial; drug effects on mutants versus wild-type indicate that gas-1 functions at least partially through presynaptic effects; gas-1 mutants have strongly reduced Complex I-dependent metabolism in mitochondria, while Complex II-dependent metabolism is conversely increased in mutants; gas-1 mitochondria look structurally normal.
20C29F7.2C29F7.2n/achrX 13,417,071contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
21srt-55T16H12.8n/achrIII 10,105,558C. elegans SRT-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22D2085.3D2085.3n/achrII 8,663,227D2085.3 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:9947) (EIF2B5; OMIM:603945), which when mutated leads to disease.
23C08H9.2C08H9.2n/achrII 9,888,735contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
24ZK829.4ZK829.4n/achrIV 11,954,203ZK829.4 is orthologous to the human gene GLYCINE DECARBOXYLASE PRECURSOR (GLUD1; OMIM:238300), which when mutated leads to disease.
25ucr-1F56D2.1n/achrIII 5,593,099C. elegans UCR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
26tag-18T14G12.3n/achrX 3,732,674C. elegans TAG-18 protein ;
27clec-166F38A1.5n/achrIV 1,250,233C. elegans CLEC-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
28lec-10W01A11.4n/achrV 6,488,658lec-10 encodes a galectin, a soluble galactose-binding lectin; recombinant lec-10 can bind to sugar in an in vitro assay.
29F35E12.5F35E12.5n/achrV 13,737,761contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
30rpl-9R13A5.8n/achrIII 7,572,403rpl-9 encodes a large ribosomal subunit L9 protein that affects fertility and embryonic viability.
31Y49A3A.1Y49A3A.1n/achrV 14,349,107Y49A3A.1 encodes a homolog of choline/ethanolaminephosphotransferase choline phosphotransferase 1; Y49A3A.1 shares an operon with vha-13, and thus might be a previously undescribed V-ATPase component or ancillary protein.
32tag-210W08E3.3n/achrI 13,342,122C. elegans TAG-210 protein; contains similarity to Pfam domains PF01926 (GTPase of unknown function) , PF06071 (Protein of unknown function (DUF933)) contains similarity to Interpro domains IPR012675 (Beta-grasp fold, ferredoxin-type), IPR013029 (Protein of unknown function DUF933), IPR004396 (Conserved hypothetical protein CHP00092), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR012676 (TGS-like), IPR006073 (GTP1/OBG)
33eat-3D2013.5n/achrII 9,327,192The eat-3 gene encodes a mitochondrial dynamin-related protein, closely related to bacterial dynamin-like proteins, that is orthologous to human OPA1 (OMIM:203740, mutated in autosomal dominant optic atrophy); EAT-3 is localized to the mitochondrial matrix and may play a role in regulating inner mitochondrial membrane morphology; EAT-3 is expressed in body wall muscle, intestine, and neurons, all tissues with high metabolic rates.
34T02G5.4T02G5.4n/achrII 7,083,184contains similarity to Pfam domains PF02803 (Thiolase, C-terminal domain) , PF00108 (Thiolase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR002155 (Thiolase), IPR016039 (Thiolase-like)
35F27D4.1F27D4.1n/achrI 7,703,501The F27D4.1 gene encodes an ortholog of the human gene ELECTRON-TRANSFER-FLAVOPROTEIN, ALPHA POLYPEPTIDE (ETFA), which when mutated leads to glutaricaciduria type IIA (OMIM:231680).
36daf-36C12D8.5n/achrV 10,224,591daf-36 encodes a protein homologous to the catalytic subunit of Rieske-like oxygenases; DAF-36 functions in a hormone biosynthetic pathway producing a ligand for the DAF-12 nuclear receptor that regulates the developmental decision between reproductive growth and dauer formation; a daf-36::gfp reporter fusion is expressed in the intestine, the head mesodermal cell, two unidentified head neurons (not XXXR/L) and, in dauers, the lateral seam cells; DAF-36 localizes to the cytoplasm in the intestine and to a cytosolic meshwork in dauer seam cells.
37R09E12.3R09E12.3n/achrV 774,205contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (3), PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (6)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR006636 (Heat shock chaperonin-binding), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
38rpl-6R151.3n/achrIII 7,209,034rpl-6 encodes a large ribosomal subunit L6 protein.
39gst-13T26C5.1n/achrII 9,231,840C. elegans GST-13 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
40ile-1K07A1.8n/achrI 9,610,665ile-1 is orthologous to the human gene human ERGIC-53, which when mutated leads to deficiency of coagulation factors V/VIII (OMIM:227300).
41prdx-3R07E5.2n/achrIII 4,407,867C. elegans PRDX-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen)
42F55B11.1F55B11.1n/achrIV 14,406,976The F55B11.1 gene encodes an ortholog of the human gene XANTHINE DEHYDROGENASE (XDH), which when mutated leads to xanthinuria (OMIM:278300).
43F01F1.9F01F1.9n/achrIII 5,862,653contains similarity to Pfam domain PF02127 Aminopeptidase I zinc metalloprotease (M18) contains similarity to Interpro domain IPR001948 (Peptidase M18, aminopeptidase I)
44F23C8.5F23C8.5n/achrI 2,419,472The F23C8.5 gene encodes an ortholog of the human gene ELECTRON TRANSFER FLAVOPROTEIN BETA SUBUNIT (ETFB), which when mutated leads to glutaricaciduria type IIB (OMIM:130410).
45rpl-4B0041.4n/achrI 4,646,348rpl-4 encodes a large ribosomal subunit L4 protein.
46nhr-81C47F8.8n/achrI 12,328,787C. elegans NHR-81 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
47C18E9.5C18E9.5n/achrII 8,970,895contains similarity to Turkey herpesvirus LORF11.; TR:Q9IBS2
48D2096.8D2096.8n/achrIV 8,378,494D2096.8 encodes a protein related in sequence to the conserved NAP (Nucleosome Assembly Protein) family of proteins involved in chromatin remodeling; loss of D2096.8 activity in wild-type and various mutant backgrounds suggests that in C. elegans the product of D2096.8 is required for proper transcriptional regulation that affects a number of biological processes including embryonic and larval development, body morphology, locomotion, and vulval formation.
49abcf-1F18E2.2n/achrV 12,762,189C. elegans ABCF-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00005 ABC transporter contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
50Y76A2B.3Y76A2B.3n/achrIII 13,541,717contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)