UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R12H7.4R12H7.40chrX 13,217,956contains similarity to Homo sapiens similar to zinc-finger helicase; ENSEMBL:ENSP00000304137
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
4T02E9.3T02E9.3n/achrV 11,364,314T02E9.3 encodes a homolog of human melatonin type 1b receptors, and more generally of mammalian dopamine and serotonin (5-HT) receptors; T02E9.3 is partly required for male tail curling, with T02E9.3(RNAi) animals showing reduced curling in exogenous 5-HT; T02E9.3 is required for full sensitivity to 5-HT, normal brood sizes, and pharyngeal pumping; T02E9.3 is expressed in head and tail neurons.
5fbxa-30ZC47.4n/achrIII 1,275,041This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
6K10D6.3K10D6.3n/achrV 11,201,218contains similarity to Homo sapiens HMG-BOX transcription factor BBX; ENSEMBL:ENSP00000319742
7Y18D10A.3Y18D10A.3n/achrI 12,812,894contains similarity to Pfam domain PF03853 YjeF-related protein N-terminus contains similarity to Interpro domain IPR004443 (YjeF-related protein, N-terminal)
8C45G9.8C45G9.8n/achrIII 5,052,953
9F18A12.6F18A12.6n/achrII 3,401,335F18A12.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.6 has no clear orthologs in other organisms.
10srd-58E04F6.13n/achrII 7,204,421C. elegans SRD-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11tag-194W02D3.6n/achrI 6,730,509C. elegans TAG-194 protein; contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
12srz-1F14F8.3n/achrV 16,676,674srz-1 encodes a predicted seven-pass G protein-coupled receptor; as loss of srz-1 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, the precise role of SRZ-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
13R07H5.10R07H5.10n/achrIV 11,214,469contains similarity to Pfam domain PF07716 Basic region leucine zipper contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
14cpb-1C40H1.1n/achrIII 9,323,513cpb-1 encodes a cytoplasmic polyadenylation element binding (CPEB) protein homolog involved in two steps of spermatogenesis; two CPEB proteins have distinct functions in spermatogenesis, with FOG-1 specifying sperm cell fate, and CPB-1 conversely executing that decision, being required for progression through meiosis; cpb-1(RNAi) spermatocytes fail to undergo meiotic cell divisions; CPB-1 protein is present in the germ line just prior to overt spermatogenesis, but once sperm differentiation begins, CPB-1 disappears; CPB-1 physically interacts with EBF, which, like CPEB, regulates genes by binding the 3' UTRs of mRNAs; while CPB-1 is required for spermatogenesis, it is dispensable for oogenesis; this is in contrast to CPEBs in vertebrates (Xenopus), arthropods (Drosophila), and molluscs (Spisula), which all participate in oogenesis.
15srz-19F56D6.4n/achrIV 3,920,703C. elegans SRZ-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16Y40B1A.3Y40B1A.3n/achrI 13,356,226contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region)
17W01B6.5W01B6.5n/achrIV 10,077,459contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
18F47G6.2F47G6.2n/achrI 1,475,611contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
19K02D10.2K02D10.2n/achrIII 8,770,897
20Y57G11C.23Y57G11C.23n/achrIV 14,858,495contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
21ndx-2W02G9.1n/achrV 2,664,041ndx-2 encodes a NUDIX hydrolase; by sequence comparison, NDX-2 is predicted to be orthologous to human NUDT5 which, in vitro, possesses ADP-sugar diphosphatase activity; in C. elegans, loss of ndx-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, consistent with the proposed nonessential roles for Nudix proteins in eliminating potentially toxic nucleotide metabolites from cells and modulating levels of metabolic intermediates by shuttling them into alternative biochemical pathways.
22skr-20R12H7.5n/achrX 13,223,155The skr-20 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-20(RNAi) animals are at least superficially normal.
23M04D8.5M04D8.5n/achrIII 10,032,724contains similarity to Periplaneta americana Large conductance calcium activated potassium channel pSlo spliceforms1-5A.; TR:Q8I9V1
24clec-116K04H8.1n/achrI 14,251,698C. elegans CLEC-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25K08C9.6K08C9.6n/achrI 11,499,274contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Hypothetical protein AF0327.; TR:O29920
26srh-142T08G3.3n/achrV 16,460,149C. elegans SRH-142 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27str-97F10A3.8n/achrV 16,154,443C. elegans STR-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28F49F1.6F49F1.6n/achrIV 4,122,198contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
29srh-61T21B4.8n/achrII 12,515,614C. elegans SRH-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
30F26A1.3F26A1.3n/achrIII 4,827,878contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
31T23F1.5T23F1.5n/achrV 15,461,926contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
32T27A1.1T27A1.1n/achrII 504,620
33Y62H9A.13Y62H9A.13n/achrX 11,918,504contains similarity to Homo sapiens Hu-Claspin; ENSEMBL:ENSP00000251195
34tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
35W07G1.1W07G1.1n/achrII 13,938,717contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
36ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
37Y113G7A.12Y113G7A.12n/achrV 20,140,914
38F15D3.4F15D3.4n/achrI 11,568,010contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
39W02D7.3W02D7.3n/achrV 8,294,341
40T08B6.5T08B6.5n/achrIV 4,890,263contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
41W03F11.4W03F11.4n/achrI 2,238,497contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
42C14B1.3C14B1.3n/achrIII 3,704,316This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
43F27C8.5F27C8.5n/achrIV 9,591,134contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
44fbxa-188F47H4.8n/achrV 17,343,887This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
45K03B4.6K03B4.6n/achrV 4,673,573contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domains IPR004920 (Protein of unknown function DUF263), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
46ins-37F08G2.6n/achrII 13,835,294ins-37 encodes an insulin-like peptide.
47R10D12.8R10D12.8n/achrV 13,951,956contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
48sma-1R31.1n/achrV 11,908,070sma-1 encodes a beta-H spectrin; during embryonic morphogenesis, SMA-1 activity is required for a normal rate of elongation and thus, for a wild-type body length upon hatching; in addition, SMA-1 is required for proper morphogenesis of the pharynx and the excretory cell; sma-1 mRNA transcripts are first detected in hypodermal cells at the beginning of embryonic morphogenesis with later expression visible in the developing pharynx, intestine, and excretory cell.
49C01A2.6C01A2.6n/achrI 13,382,132contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54BK4
50str-261W09D6.2n/achrIII 11,075,857C. elegans STR-261 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR011256 (Regulatory factor, effector, bacterial), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)