UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R09E10.6R09E10.61.0000000000000001e-163chrIV 10,293,542contains similarity to Coturnix coturnix Nectinepsin.; TR:Q90351
2bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
3F08H9.2F08H9.2n/achrV 14,460,857contains similarity to Interpro domain IPR004064 (EDG-6 sphingosine 1-phosphate receptor)
4F44D12.4F44D12.4n/achrIV 10,027,010contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
5C04F12.7C04F12.7n/achrI 9,696,226contains similarity to Legionella pneumophila CITA.; TR:O54543
6ZK938.1ZK938.1n/achrII 9,830,005contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
7F17E9.5F17E9.5n/achrIV 8,346,163
8sss-1F32B6.5n/achrIV 9,893,216C. elegans SSS-1 protein ;
9ZK1251.1ZK1251.1n/achrIV 9,683,245contains similarity to Pfam domains PF00808 (Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone) , PF00125 (Core histone H2A/H2B/H3/H4) contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core), IPR002119 (Histone H2A), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
10sss-2F47B8.11n/achrV 14,346,480C. elegans SSS-2 protein ;
11ssq-1K07F5.11n/achrIV 9,853,029C. elegans SSQ-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
12nspd-4T23B7.1n/achrII 4,842,734C. elegans NSPD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domain IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
13F21H7.5F21H7.5n/achrV 16,238,153contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
14T28H11.7T28H11.7n/achrIV 5,015,779contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
15ZK484.5ZK484.5n/achrI 6,087,568
16nspd-1ZK484.8n/achrI 6,097,668C. elegans NSPD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
17C39H7.1C39H7.1n/achrIV 5,632,623contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
18C35D10.2C35D10.2n/achrIII 4,871,376contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
19F27C1.1F27C1.1n/achrI 5,435,299
20T23B3.5T23B3.5n/achrI 6,705,973contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
21ssp-9E03H12.10n/achrIV 4,994,521C. elegans SSP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
22C02F5.5C02F5.5n/achrIII 8,236,454
23T08B2.12T08B2.12n/achrI 6,231,810contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:Q6S6W0
24R10E9.2R10E9.2n/achrIII 3,963,390contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein (At2g34570).; TR:Q8GWS9
25Y69E1A.1Y69E1A.1n/achrIV 10,948,034contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
26C25A8.1C25A8.1n/achrIV 7,011,175
27ssq-4T28H11.1n/achrIV 5,017,101C. elegans SSQ-4 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR013286 (Annexin, type VII)
28ssp-16T27A3.3n/achrI 6,102,250C. elegans SSP-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
29C10G11.9C10G11.9n/achrI 6,274,923contains similarity to Urechis caupo Sperm acrosomal protein.; TR:A4GND9
30gst-9R05F9.5n/achrII 4,892,523gst-9 encodes a predicted glutathione S-transferase; by homology, GST-9 is predicted to play a role in the detoxification of environmental toxins and xenobiotics by transferring glutathione to reactive electrophilic compounds; however, as loss of gst-9 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of GST-9 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
31msp-32R05F9.3n/achrII 4,898,889msp-32 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; msp-32 has a C. briggsae homolog as predicted by the Wobble Aware Bulk Aligner (WABA); the msp family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
32msp-74F09C12.7n/achrII 5,115,201msp-74 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
33col-179C34F6.3n/achrX 11,201,934C. elegans COL-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000596 (Cholecystokinin receptor, type A), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
34col-19ZK1193.1n/achrX 422,242col-19 encodes a member of the collagen superfamily containing collagen triple helix repeats (20 copies) that is required for normal structure of the alae; expressed during the L2-to-dauer and L4-to-adult molts with strongest expression in adult animals.
35K08C9.2K08C9.2n/achrI 11,487,661
36Y69E1A.2Y69E1A.2n/achrIV 10,950,445contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
37rmd-4F36H12.11n/achrIV 5,256,341C. elegans RMD-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
38ssp-31ZK1225.6n/achrI 13,219,303C. elegans SSP-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
39C18G1.9C18G1.9n/achrV 4,768,777contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
40E03H12.5E03H12.5n/achrIV 4,977,628contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
41ssq-2T28H11.5n/achrIV 4,996,828C. elegans SSQ-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR003982 (Leukotriene B4 type 2 receptor), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein)
42F37A8.1F37A8.1n/achrIII 3,928,769contains similarity to Rattus norvegicus Myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase MRCK-beta.; TR:O54875
43ZC317.6ZC317.6n/achrV 5,467,199
44F07A5.2F07A5.2n/achrI 7,353,071contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Serine/arginine repetitive matrix protein 2; ENSEMBL:ENSP00000371738
45K06A5.2K06A5.2n/achrI 6,468,758contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
46ZC168.6ZC168.6n/achrIV 10,738,430contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
47T05C12.1T05C12.1n/achrII 8,174,196contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48ssp-11T28H11.6n/achrIV 4,999,632C. elegans SSP-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
49ZK637.12ZK637.12n/achrIII 8,924,673contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YDR545W
50F36A4.3F36A4.3n/achrIV 4,269,952contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)