UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1R07H5.8R07H5.80chrIV 11,210,138contains similarity to Pfam domain PF00294 pfkB family carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domains IPR011611 (Carbohydrate/purine kinase), IPR002139 (Ribokinase), IPR001805 (Adenosine kinase), IPR002173 (Carbohydrate/puine kinase, PfkB, conserved site)
2F01F1.9F01F1.9n/achrIII 5,862,653contains similarity to Pfam domain PF02127 Aminopeptidase I zinc metalloprotease (M18) contains similarity to Interpro domain IPR001948 (Peptidase M18, aminopeptidase I)
3eif-3.DR08D7.3n/achrIII 8,970,522eif-3.D encodes the C. elegans ortholog of the translation initiation factor 3 subunit d (eIF3d/Moe1); by homology, EIF-3.D is predicted to function as part of the eIF3 translation initiation complex but also as part of a Ras-mediated pathway that regulates mitotic spindle formation; in C. elegans, large-scale RNAi screens indicate that eif-3.D is required for embryonic and germline development, locomotion, and normal rates of post-embryonic growth; in the early embryo, eif-3.D is specifically required for the fidelity of meiotic divisions and normal pseudocleavage; eif-3.D function is likely conserved, as expression of eif-3.D in Schizosaccharomyces pombe can rescue the mitotic spindle and growth defects associated with moe1 mutant cells; to date, eif-3.D expression has been reported in anterior neurons and the pharynx, beginning at late stages of embryogenesis.
4K10C2.1K10C2.1n/achrX 6,425,780contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
5K07C5.4K07C5.4n/achrV 10,351,696contains similarity to Pfam domains PF01798 (Putative snoRNA binding domain) , PF08060 (NOSIC (NUC001) domain) , PF08156 (NOP5NT (NUC127) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012974 (NOP5, N-terminal), IPR005819 (Histone H5), IPR002687 (Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region), IPR012976 (NOSIC)
6T16G1.6T16G1.6n/achrV 12,936,341contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
7T25B6.2T25B6.2n/achrX 9,036,480T25B6.2 encodes two isoforms of a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T25B6.2 is orthologous to Ac-mep-1, a gut luminal neprilysin which is specifically expressed in the adult life stage of Ancylostoma caninum hookworms, and whose protein product is localized to the microvilli of the gastrointestinal tract, suggesting a role in digestion.
8gst-13T26C5.1n/achrII 9,231,840C. elegans GST-13 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
9F59A2.3F59A2.3n/achrIII 3,397,005contains similarity to Pfam domain PF02330 Mitochondrial glycoprotein contains similarity to Interpro domain IPR003428 (Mitochondrial glycoprotein)
10nhx-2B0495.4n/achrII 7,692,262nhx-2 encodes a sodium/proton exchanger expressed in the apical membranes of intestinal cells; NHX-2 is required for normally high growth rates, and for propagation or maintenance of the germline, NHX-2 is thought to prevent intracellular acidification by catalysing the electroneutral exchange of extracellular sodium for an intracellular proton.
11C26B9.5C26B9.5n/achrX 5,330,863contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
12W04G3.5W04G3.5n/achrX 11,074,823contains similarity to Pfam domain PF00156 Phosphoribosyl transferase domain contains similarity to Interpro domains IPR005946 (Phosphoribosyl pyrophosphokinase), IPR000836 (Phosphoribosyltransferase)
13Y76A2B.3Y76A2B.3n/achrIII 13,541,717contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
14dct-18F58G1.4n/achrII 12,932,607C. elegans DCT-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence)
15W09D10.3W09D10.3n/achrIII 10,708,021contains similarity to Pfam domain PF00542 Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR013823 (Ribosomal protein L7/L12, C-terminal), IPR014719 (Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like), IPR008932 (Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation)
16T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
17T08B1.1T08B1.1n/achrV 1,984,861contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR000817 (Prion protein), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
18Y40D12A.2Y40D12A.2n/achrIII 6,613,768contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
19F57B9.3F57B9.3n/achrIII 6,940,892contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014014 (RNA helicase, DEAD-box type, Q motif), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
20clec-56F08H9.7n/achrV 14,475,609C. elegans CLEC-56 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21nol-5W01B11.3n/achrI 3,268,107C. elegans NOL-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF01798 (Putative snoRNA binding domain) , PF08060 (NOSIC (NUC001) domain) , PF08156 (NOP5NT (NUC127) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012974 (NOP5, N-terminal), IPR005819 (Histone H5), IPR002687 (Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region), IPR012976 (NOSIC)
22aqp-11ZK525.2n/achrIII 13,673,891aqp-11 encodes a putative aquaporin with no function in mass RNAi assays, perhaps reflecting genetic redundancy with its paralogs AQP-9 and AQP-10; AQP-11 is orthologous to Drosophila CG12251 and human AQP11 (OMIM:609914), AQP12A (OMIM:609789), and AQP12B.
23Y49A3A.1Y49A3A.1n/achrV 14,349,107Y49A3A.1 encodes a homolog of choline/ethanolaminephosphotransferase choline phosphotransferase 1; Y49A3A.1 shares an operon with vha-13, and thus might be a previously undescribed V-ATPase component or ancillary protein.
24daf-36C12D8.5n/achrV 10,224,591daf-36 encodes a protein homologous to the catalytic subunit of Rieske-like oxygenases; DAF-36 functions in a hormone biosynthetic pathway producing a ligand for the DAF-12 nuclear receptor that regulates the developmental decision between reproductive growth and dauer formation; a daf-36::gfp reporter fusion is expressed in the intestine, the head mesodermal cell, two unidentified head neurons (not XXXR/L) and, in dauers, the lateral seam cells; DAF-36 localizes to the cytoplasm in the intestine and to a cytosolic meshwork in dauer seam cells.
25amt-4C05E11.5n/achrX 4,567,404amt-4 encodes a member of the ammonium transporter protein family.
26gas-1K09A9.5n/achrX 15,588,527The gas-1 gene encodes a 49 kDa subunit of mitochondrial complex I that is required for oxidative phosphorylation, resistance to volatile anesthetics, fecundity, and normal lifespan; gas-1 is expressed in the nematode neuromuscular system; its subcellular distribution appears to be mitochondrial; drug effects on mutants versus wild-type indicate that gas-1 functions at least partially through presynaptic effects; gas-1 mutants have strongly reduced Complex I-dependent metabolism in mitochondria, while Complex II-dependent metabolism is conversely increased in mutants; gas-1 mitochondria look structurally normal.
27ugt-46B0310.5n/achrX 528,055C. elegans UGT-46 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
28F38E11.5F38E11.5n/achrIV 9,461,841F38E11.5 encodes a beta' (beta-prime) subunit of the coatomer (COPI) complex; in mass RNAi assays, F38E11.5 is required for fertility and general health.
29ife-2R04A9.4n/achrX 382,059ife-2 encodes a translation initiation factor 4F, cap-binding subunit (eIF-4E); by homology, IFE-2 is predicted to function in cap-dependent mRNA translation initiation; loss of ife-2 activity in adult animals extends lifespan.
30apy-1F08C6.6n/achrX 7,568,879C. elegans APY-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
31cct-1T05C12.7n/achrII 8,186,346cct-1 encodes a putative alpha subunit of the eukaryotic cytosolic ('T complex') chaperonin, orthologous to human TCP1 (OMIM:186980), and required for normal pronuclear-centrosome rotation, positioning of the mitotic spindle, meiosis, and distal tip cell migration; CCT-1 is also required to repress SKN-1-dependent transcription of gst-4, and for fertility and viability; CCT-1 is expressed in larval and adult pharynx, intestine, body wall muscle, and neurons, as well as adult rectal epithelium; cct-1 mRNA is enriched in cultured touch receptor neurons.
32clec-57F08H9.6n/achrV 14,470,810C. elegans CLEC-57 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33lpd-6K09H9.6n/achrI 3,146,111lpd-6 encodes a predicted rRNA-binding protein that is orthologous to Drosophila Peter Pan and the Saccharomyces cerevisiae SSF1 and SSF2 proteins that are required for ribosomal large subunit maturation; loss of lpd-6 activity via RNAi indicates that, in C. elegans, LPD-6 is required for fat storage and for larval growth and development; based upon its similarity to yeast SSF1 and SSF2, LPD-6 is predicted to be a nucleolar protein.
34C18E9.6C18E9.6n/achrII 8,972,695contains similarity to Pfam domain PF01459 Eukaryotic porin contains similarity to Interpro domain IPR001925 (Porin, eukaryotic type)
35F55G11.2F55G11.2n/achrIV 12,968,338contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
36F35D11.4F35D11.4n/achrII 4,603,738contains similarity to Pfam domain PF01928 CYTH domain contains similarity to Interpro domains IPR008172 (Adenylate cyclase), IPR008173 (Adenylyl cyclase CyaB)
37ugt-8H23N18.3n/achrV 4,904,931C. elegans UGT-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
38W07E6.2W07E6.2n/achrII 482,556W07E6.2 encodes an ortholog of S. cerevisiae RSA4 that may suppress tumorous growth in the germline; like PRO-1, -2, and -3, W07E6.2 is probably required for ribosome biogenesis, suggesting a link between biogenesis in the distal sheath and control of cell division in the germline.
39lec-10W01A11.4n/achrV 6,488,658lec-10 encodes a galectin, a soluble galactose-binding lectin; recombinant lec-10 can bind to sugar in an in vitro assay.
40gst-36R07B1.4n/achrX 9,862,249C. elegans GST-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR003083 (S-crystallin), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
41K08D8.6K08D8.6n/achrIV 12,888,793contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3), IPR003366 (CUB-like region)
42H06H21.3H06H21.3n/achrIV 4,811,443contains similarity to Pfam domain PF01176 Translation initiation factor 1A / IF-1 contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR006196 (S1, IF1 type), IPR001253 (Eukaryotic initiation factor 1A (eIF-1A))
43F58B4.5F58B4.5n/achrV 10,933,422contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
44C08H9.2C08H9.2n/achrII 9,888,735contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
45F14D7.6F14D7.6n/achrV 14,303,902contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46F54F11.2F54F11.2n/achrII 13,512,057F54F11.2 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F54F11.2 has no clear orthologs in other organisms.
47egl-45C27D11.1n/achrIII 7,826,432egl-45 encodes a homolog of eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 10, that affects development of the HSNs that affect egg laying.
48ugt-13H23N18.1n/achrV 4,910,117C. elegans UGT-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
49F01D5.1F01D5.1n/achrII 13,997,179contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
50F28A10.6F28A10.6n/achrII 847,752contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)