UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R07C3.8R07C3.80chrII 914,449
2ceh-27F46F3.1n/achrV 11,663,161ceh-27 encodes a homeodomain protein of the NK-2 class that contains Drosophila scarecrow and human NKX-2 (OMIM:606727); CEH-27 activity is essential for embryogenesis and appears to be required for maintaining hypodermal integrity during movement as embryos lacking CEH-27 burst at a breach in the ventral hypodermis upon commencement of muscle contractions; CEH-27 expression is first detected in the ~100-cell embryo in what appear to be MS-derived cells while in later embryos expression is seen in a number of cells in the anterior head region.
3F46A8.6F46A8.6n/achrI 11,244,411contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
4ser-3K02F2.6n/achrI 6,821,820ser-3 encodes a putative homolog of mammalian 5-HT4 metabotropic serotonin receptors; SER-3 is required for normal inhibition of movement by 5-HT, with ser-3 mutants being hyperactive and excessively curling their male tails (but this phenotype is reversed by exogenous 5-HT, with ser-3 mutants then becoming sluggish); SER-3 activity is required for normally high brood sizes and for embryonic development, and weakly required for pharyngeal pumping; SER-3 is expressed in pharynx, head and tail neurons, nerve ring, and intestine.
5C53C7.3C53C7.3n/achrX 13,049,643contains similarity to Triticum aestivum Alpha/beta-gliadin A-V precursor (Prolamin).; SW:GDA5_WHEAT
6K09E2.2K09E2.2n/achrX 8,677,297
7C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
8sra-28F18C5.6n/achrII 6,572,192C. elegans SRA-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
9bath-33C08E3.3n/achrII 1,605,408C. elegans BATH-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00917 (MATH domain) , PF00651 (BTB/POZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
10C41D11.3C41D11.3n/achrI 4,430,732contains similarity to Interpro domain IPR001041 (Ferredoxin)
11W03H9.1W03H9.1n/achrII 14,148,639contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
12gnrr-7F13D2.3n/achrX 11,186,568C. elegans GNRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
14F53E10.5F53E10.5n/achrV 2,597,474
15H16D19.3H16D19.3n/achrI 12,639,596contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
16C31E10.5C31E10.5n/achrX 13,993,587contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q92614 Myosin XVIIIA; ENSEMBL:ENSP00000332202
17cdc-25.2F16B4.8n/achrV 1,581,313cdc-25.2 encodes a putative homolog of Cdc25 phosphatase protein family that affects germline proliferation.
18str-57T06C12.2n/achrV 15,871,734C. elegans STR-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19C17C3.9C17C3.9n/achrII 5,531,799
20F55C5.1F55C5.1n/achrV 12,263,644contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
21set-24Y43F11A.5n/achrII 12,122,894set-24 encodes a protein with an N-terminal SET domain, followed by two SPK domains; SET-24's domain organization resembles that of SET-5, but SET-24 has no known non-nematode orthologs or C. elegans paralogs; neither set-24(n4909) nor set-24(RNAi) have any obvious phenotypes.
22H25P06.4H25P06.4n/achrI 11,307,702contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR001300 (Peptidase C2, calpain), IPR008906 (HAT dimerisation)
23F31F7.3F31F7.3n/achrV 6,269,506
24srg-62C24B9.12n/achrV 2,741,420C. elegans SRG-62 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
25B0034.5B0034.5n/achrII 5,973,873contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26C10A4.5C10A4.5n/achrX 7,394,900
27ZK1098.1ZK1098.1n/achrIII 9,523,635ZK1098.1 encodes a protein, with multiple WW/rsp5/WWP domains and FF domains, required for embryonic viability and for normally high rates of postembryonic growth.
28Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
29C07A4.3C07A4.3n/achrX 10,175,118contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
30F20E11.7F20E11.7n/achrV 17,465,622contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR005098 (Protein of unknown function DUF281), IPR006662 (Thioredoxin-related)
31nhr-189F47C10.8n/achrV 3,859,413C. elegans NHR-189 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
32F47G6.3F47G6.3n/achrI 1,467,585contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
33T26A5.4T26A5.4n/achrIII 6,461,112contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
34tag-263C11E4.3n/achrX 9,590,518C. elegans TAG-263 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
35sdf-9Y44A6D.4n/achrV 20,795,100sdf-9 encodes a protein tyrosine phosphatase, paralogous to EAK-6; sdf-9 acts in parallel to akt-1 to regulate insulin-like signaling and dauer formation and may promote DAF-9 activity by means of steroid hormone signalling; sdf-9 dauer larvae resemble those of daf-9 and daf-12 dauer-constitutive mutants, and these Daf-c mutants are all enhanced by cholesterol deprivation; SDF-9 is expressed in the neuroendocrine XXXL/R cells, where it associates with the plasma membrane; ablation of the XXXL/R cells in wild-type L1 larvae also causes daf-9-like pseudodauer larvae.
36ZK563.2ZK563.2n/achrX 3,371,077contains similarity to Pfam domain PF02690 Na+/Pi-cotransporter contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003841 (Na+/Pi-cotransporter)
37T07D3.2T07D3.2n/achrII 902,779contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
38C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
39math-16C16C4.8n/achrII 1,878,171C. elegans MATH-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
40Y54E2A.4Y54E2A.4n/achrII 14,754,890contains similarity to Archaeoglobus fulgidus NADH oxidase (NOXA-3).; TR:O29847
41K07G5.3K07G5.3n/achrI 7,163,733contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
42sri-54T10D4.8n/achrII 3,136,737C. elegans SRI-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
43C23H5.1C23H5.1n/achrIV 2,132,010contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
44clec-128W10G11.6n/achrII 3,570,162C. elegans CLEC-128 protein; contains similarity to Interpro domains IPR003566 (T-cell surface glycoprotein CD5), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
45srw-96K04F1.2n/achrV 1,674,580C. elegans SRW-96 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
46W02H3.1W02H3.1n/achrX 11,104,112contains similarity to Bacillus halodurans Myo-inositol 2-dehydrogenase.; TR:Q9KAH1
47srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
48K05G3.2K05G3.2n/achrX 16,497,319
49E02H4.5E02H4.5n/achrX 14,254,507contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBC6
50T02G6.4T02G6.4n/achrI 11,811,897contains similarity to Buchnera aphidicola RpoD protein (EC 2.7.7.6).; TR:Q89AY7