UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sru-40R07B5.30chrV 9,833,347C. elegans SRU-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
2Y49E10.25Y49E10.25n/achrIII 12,490,261contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
3nhr-220T19H12.8n/achrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4cyp-33C2C45H4.17n/achrV 2,185,028C. elegans CYP-33C2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
5F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
6ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
7lgc-1T05B4.1n/achrV 4,136,911C. elegans LGC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
8fbxa-135T06E6.5n/achrV 15,402,649This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
9srd-5T19E7.5n/achrIV 5,673,565C. elegans SRD-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR004268 (Virulence factor MVIN-like)
10F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
11F22E5.12F22E5.12n/achrII 2,646,586contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
12C04F5.2C04F5.2n/achrV 5,094,981
13T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
14F45F2.6F45F2.6n/achrV 8,527,305contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
15srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
16nhr-190F48G7.11n/achrV 641,845C. elegans NHR-190 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17C18H7.1C18H7.1n/achrIV 618,237contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
18B0212.1B0212.1n/achrIV 3,575,057contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
19Y106G6H.4Y106G6H.4n/achrI 10,437,301contains similarity to Interpro domain IPR006578 (MADF)
20K02A2.5K02A2.5n/achrII 7,411,491
21srx-23F31F4.2n/achrV 683,114C. elegans SRX-23 protein ;
22nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23srh-102F40D4.11n/achrV 17,164,173C. elegans SRH-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24R05H10.5R05H10.5n/achrII 14,868,296contains similarity to Pfam domain PF00255 Glutathione peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
25F23B2.7F23B2.7n/achrIV 9,151,248contains similarity to Homo sapiens similar to Cylicin I (Multiple-band polypeptide I); ENSEMBL:ENSP00000331556
26T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
27F55D12.1F55D12.1n/achrI 7,884,957contains similarity to Brachydanio rerio Hypothetical protein.; TR:Q803L4
28M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
29hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
30F22D6.8F22D6.8n/achrI 7,099,204
31math-31F52C6.6n/achrII 1,912,654C. elegans MATH-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
32ceh-13R13A5.5n/achrIII 7,556,858a homolog of Hox genes of labial/Hox1 type; affects viability, body shape and anterior patterning during embryogenesis, interacts genetically with hox genes; and is expressed in A, D, E and MS lineages in the early embryo, and in the anterior dorsal hypodermal cells, anterior body wall muscle cells, and in the cells of the prospective ventral nerve cord at the comma stage; and in the ventral nerve cord and and ventral and dorsal hypodermal cells in L1 larvae.
33T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675
34nhr-126F44C8.10n/achrV 2,230,032nhr-126 encodes a member of the nuclear hormone receptor family.
35srsx-17F58D7.1n/achrV 5,929,015C. elegans SRSX-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36ifta-1C54G7.4n/achrX 5,549,123C. elegans IFTA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR017233 (WD repeat protein 35), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
37R10E8.5R10E8.5n/achrV 18,255,890contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38snb-1T10H9.4n/achrV 6,656,014The snb-1 gene encodes synaptobrevin, a synaptic vesicle protein orthologous to human vesicle-associated membrane protein 1 (VAMP1 OMIM:185880) and 2 (VAMP2 OMIM:185881), and is required for viability and synaptic transmission; SNB-1 is likely to play a role in vesicle docking and/or fusion and is expressed in neurons where it colocalizes with synaptic vesicle proteins RAB-3 and synaptotagmin.
39F38B6.7F38B6.7n/achrX 6,697,033contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
40clec-243Y68A4B.1n/achrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
41dhs-16C10F3.2n/achrV 5,984,592dhs-16 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
42nhr-150C06B8.1n/achrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43T05A6.5T05A6.5n/achrII 7,824,034contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
44Y54G9A.1Y54G9A.1n/achrII 13,700,041contains similarity to Carabus linnei NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment).; TR:O79584
45C15C8.5C15C8.5n/achrV 12,749,106contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
46elc-2W03H1.2n/achrX 1,777,746elc-2 encodes a protein containing a Skp1 dimerisation domain that has homology to human transcription elongation factor B (SIII), polypeptide I (15kD, elonginsC).
47scd-2T10H9.2n/achrV 6,636,446C. elegans SCD-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR002919 (Protease inhibitor I8, cysteine-rich trypsin inhibitor-like), IPR000998 (MAM), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
48srbc-66T24A6.5n/achrV 3,531,539C. elegans SRBC-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
49F52B11.5F52B11.5n/achrIV 14,102,592contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE2159.; TR:Q8XIG1
50clec-34T25E12.8n/achrV 16,736,555C. elegans CLEC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)