UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R05H5.4R05H5.40chrII 10,198,961contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3C10G8.2C10G8.2n/achrV 5,314,980contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
4C02E7.10C02E7.10n/achrV 4,931,908
5F36H5.9F36H5.9n/achrII 1,752,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
6ggr-1C09G5.1n/achrII 10,698,711ggr-1 encodes a predicted member of the GABA/ glycine receptor family of ligand-gated chloride channels that affects thermotaxis; expressed in AIB, PVR, PVQ, AVH, and SMDV neurons and in some motor neurons in the ventral cord, and in the egg-laying muscles.
7C09D4.6C09D4.6n/achrI 5,486,821
8F22G12.1F22G12.1n/achrI 13,140,448contains similarity to Interpro domain IPR000423 (Flagellar protein FlgJ type-1)
9srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
10F44D12.3F44D12.3n/achrIV 10,022,456contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
11C25G4.8C25G4.8n/achrIV 12,461,585contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domain IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
12W01C9.4W01C9.4n/achrII 8,546,188contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
13T09E11.6T09E11.6n/achrI 12,367,467contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
14nhr-222T24A6.11n/achrV 3,542,513C. elegans NHR-222 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15F14D2.9F14D2.9n/achrII 3,354,397contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
16Y56A3A.6Y56A3A.6n/achrIII 11,874,979contains similarity to Interpro domains IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR002951 (Atrophin)
17scrm-2ZK1053.5n/achrI 13,235,906scrm-2 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); in apoptotic germline cells, SCRM-2 is fully dispensable for normally rapid engulfment and largely dispensable for phosphatidylserine exposure; SCRM-2 does not bind WAH-1 in vitro, and scrm-2(tm650) mutants have no obvious phenotype.
18dsl-5F58B3.8n/achrIV 11,620,190dsl-5 encodes a putative secreted protein with single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-5 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
19srh-282T21D12.5n/achrIV 272,850C. elegans SRH-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20srh-276F21A3.1n/achrV 15,530,042C. elegans SRH-276 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21D2063.2D2063.2n/achrV 4,330,780contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
22fbxb-46K05F6.9n/achrII 1,570,610This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
23K10D6.3K10D6.3n/achrV 11,201,218contains similarity to Homo sapiens HMG-BOX transcription factor BBX; ENSEMBL:ENSP00000319742
24R06C1.2R06C1.2n/achrI 11,920,861contains similarity to Pfam domain PF00348 Polyprenyl synthetase contains similarity to Interpro domains IPR000092 (Polyprenyl synthetase), IPR008949 (Terpenoid synthase)
25snf-8ZK829.10n/achrIV 11,967,123C. elegans SNF-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR004354 (Meiotic recombination protein rec114)
26F10C2.3F10C2.3n/achrV 12,022,395contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
27T27A3.5T27A3.5n/achrI 6,101,032contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
28ceh-33C10G8.7n/achrV 5,323,911ceh-33 encodes a Six/sine oculis class homeodomain transcription factor; preliminary RNAi experiments suggest that CEH-33 activity may be required for gonad development; a ceh-33::gfp reporter shows very weak pharyngeal expression in late embryos and early larvae.
29ZK1053.4ZK1053.4n/achrI 13,243,185contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Nucleoporin nup124 (Nuclear pore protein nup124).; SW:N124_SCHPO
30srh-83F09G2.7n/achrV 7,165,183C. elegans SRH-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31twk-4ZK1067.5n/achrII 9,192,128C. elegans TWK-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
32wht-3C16C10.12n/achrIII 4,149,469C16C10.12 encodes an ATP-binding cassette (ABC) transporter; C16C10.12 activity is required for efficient RNA interference (RNAi) of a germline-expressed target, pop-1.
33srb-11F23F12.10n/achrIII 6,492,077C. elegans SRB-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
34T06E4.5T06E4.5n/achrV 9,631,723contains similarity to Interpro domains IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein), IPR001266 (Ribosomal protein S19e)
35F10E7.6F10E7.6n/achrII 7,113,277
36rsr-1F28D9.1n/achrI 11,179,945C. elegans RSR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01480 PWI domain contains similarity to Interpro domains IPR002483 (Splicing factor PWI), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR002185 (Dopamine D4 receptor)
37C26C6.6C26C6.6n/achrI 7,506,305contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
38srx-42C06B3.11n/achrV 13,921,696C. elegans SRX-42 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39ugt-2AC3.8n/achrV 10,399,988C. elegans UGT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
40T19D2.1T19D2.1n/achrX 3,935,349contains similarity to Pfam domains PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) (4), PF01421 (Reprolysin (M12B) family zinc metalloprotease) contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR013273 (Peptidase M12B, ADAM-TS), IPR001590 (Peptidase M12B, ADAM/reprolysin)
41sra-2AH6.6n/achrII 9,529,242C. elegans SRA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
42C14E2.3C14E2.3n/achrX 1,811,106
43ZK1320.5ZK1320.5n/achrII 9,664,562contains similarity to Interpro domain IPR008107 (Mycoplasma P48 major surface lipoprotein)
44Y57G11C.8Y57G11C.8n/achrIV 14,782,524contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000302919
45C01G5.3C01G5.3n/achrIV 6,537,601contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
46abt-6F56F4.6n/achrI 6,139,832F56F4.6 encodes a protein that contains an ATP-binding cassette (ABC) that is most closely related to that of the ABCA subfamily of ABC transport proteins; as the product of F56F4.6 lacks a predicted transmembrane domain, and as loss of F56F4.6 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of this gene in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
47F41F3.1F41F3.1n/achrV 4,655,174
48srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
49W05F2.7W05F2.7n/achrI 3,357,913contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
50Y45F10A.3Y45F10A.3n/achrIV 13,511,278contains similarity to Mus musculus Probable arylformamidase (EC 3.5.1.9) (Kynurenine formamidase) (KF).; SW:Q8K4H1