UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srd-39R04D3.81e-178chrX 13,299,680C. elegans SRD-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2srh-102F40D4.11n/achrV 17,164,173C. elegans SRH-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3C46E10.2C46E10.2n/achrII 3,723,631
4math-31F52C6.6n/achrII 1,912,654C. elegans MATH-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
5K12H6.2K12H6.2n/achrII 2,814,250
6T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675
7C04F5.2C04F5.2n/achrV 5,094,981
8R11D1.4R11D1.4n/achrV 12,713,623contains similarity to Xenopus laevis Similar to kinesin-like 1.; TR:Q8AVK8
9T28A11.6T28A11.6n/achrV 3,262,901
10C36C5.4C36C5.4n/achrV 3,167,003contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
11H25K10.4H25K10.4n/achrIV 16,226,802contains similarity to Pseudomonas putida Hypothetical protein.; TR:Q8VMP3
12srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13C45G3.4C45G3.4n/achrI 9,219,134contains similarity to Dictyostelium discoideum Prespore-specific protein (Fragment).; TR:O97140
14C04B4.6C04B4.6n/achrX 12,275,348contains similarity to Corynebacterium efficiens Putative alanyl-tRNA synthetase.; TR:Q8FT23
15Y116A8C.11Y116A8C.11n/achrIV 16,989,256contains similarity to Streptococcus pyogenes serotype M5 M protein, serotype 5 precursor.; SW:P02977
16B0336.12B0336.12n/achrIII 5,710,236
17srw-86C25F9.7n/achrV 19,400,392C. elegans SRW-86 protein ;
18Y5F2A.3Y5F2A.3n/achrIV 11,069,794contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
19C41G6.12C41G6.12n/achrV 15,207,410contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
20C56G7.2C56G7.2n/achrIII 3,387,880This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
21C38C5.1C38C5.1n/achrX 5,560,137
22ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
23F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
24srbc-25F40D4.6n/achrV 17,174,753C. elegans SRBC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25K02A2.5K02A2.5n/achrII 7,411,491
26C30E1.8C30E1.8n/achrX 16,917,982contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
27nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
28F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
29srh-203F20E11.10n/achrV 17,455,364C. elegans SRH-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
31Y116A8C.1Y116A8C.1n/achrIV 16,901,344contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
32F16G10.6F16G10.6n/achrII 2,377,526contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
33F53F4.1F53F4.1n/achrV 13,585,118contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
34nhr-174E03H4.6n/achrI 12,418,082C. elegans NHR-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
35C49F5.5C49F5.5n/achrX 11,986,477contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
36F10A3.11F10A3.11n/achrV 16,163,213contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
37T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
38T20D4.16T20D4.16n/achrV 3,394,536
39str-257C01B4.1n/achrV 2,519,650C. elegans STR-257 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40sri-9Y102A5C.29n/achrV 17,002,496C. elegans SRI-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B)
41srt-4C29G2.4n/achrV 2,578,859C. elegans SRT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42srw-47K10G4.2n/achrV 17,261,345C. elegans SRW-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43W04B5.6W04B5.6n/achrIII 2,434,376
44R10E8.5R10E8.5n/achrV 18,255,890contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45srh-80DC2.1n/achrV 221,355C. elegans SRH-80 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46sru-40R07B5.3n/achrV 9,833,347C. elegans SRU-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
47sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48str-196T01G6.3n/achrV 492,687C. elegans STR-196 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
49T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
50C44C10.6C44C10.6n/achrX 11,698,664contains similarity to Streptococcus pneumoniae GtrA family protein.; TR:Q97R28