UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R04B5.5R04B5.50chrV 10,088,214contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR011597 (GroES-related), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002328 (Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site)
2tag-189T04A8.12n/achrIII 4,706,131C. elegans TAG-189 protein ; contains similarity to Cricetulus griseus Post-GPI-attachment to proteins 2.; TR:Q2ABP2
3B0250.5B0250.5n/achrV 20,491,021contains similarity to Pfam domain PF03446 NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR006115 (6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding), IPR013328 (Dehydrogenase, multihelical), IPR015815 (3-hydroxyacid dehydrogenase/reductase), IPR011548 (3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase), IPR006183 (6-phosphogluconate dehydrogenase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002204 (3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase-related, conserved site)
4C34C12.2C34C12.2n/achrIII 3,458,263contains similarity to Homo sapiens Putative protein TPRXL; ENSEMBL:ENSP00000322097
5K03B4.1K03B4.1n/achrV 4,690,455
6R09E12.6R09E12.6n/achrV 767,566contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
7his-62F55G1.3n/achrIV 7,486,714his-62 encodes an H2B histone.
8C27B7.2C27B7.2n/achrIV 8,893,280contains similarity to Arabidopsis thaliana F3O9.12 protein (At1g16320/F3O9_12).; TR:Q9SA31
9F41C3.1F41C3.1n/achrII 4,752,652contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domain IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
10sra-29F18C5.8n/achrII 6,575,011C. elegans SRA-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
11tag-179T24D1.4n/achrI 9,961,143C. elegans TAG-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF04922 DIE2/ALG10 family contains similarity to Interpro domains IPR016900 (Alpha-1, 2 glucosyltransferase Alg10), IPR007006 (DIE2/ALG10)
12B0001.7B0001.7n/achrIV 12,152,686contains similarity to Herpestes ichneumon Acetylcholine receptor protein, alpha chain (Fragment).; SW:ACHA_HERIC
13fbxa-200T07D3.1n/achrII 905,248C. elegans FBXA-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
14F10E7.11F10E7.11n/achrII 7,121,124contains similarity to Pfam domain PF01448 ELM2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR000949 (ELM2)
15M03F4.4M03F4.4n/achrX 4,957,667
16F56G4.4F56G4.4n/achrI 11,377,362contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
17Y17G7B.3Y17G7B.3n/achrII 11,990,838Y17G7B.3 is orthologous to the human gene HYDROXYACYLGLUTATHIONE HYDROLASE (HAGH; OMIM:138760), which when mutated leads to disease.
18mut-7ZK1098.8n/achrIII 9,540,593mut-7 encodes a homolog of RnaseD that represses transposition of Tc1, Tc3, Tc4, and Tc5, perhaps by degrading transposon-specific messages; also affects sperm development, sensitivity to RNAi of mainly germline expressed genes, silencing of some germline transgenes, X chromosome loss, and is required for cosuppression (functional silencing of chromosomal loci induced by transgenes) and for silencing induced by antisense RNA oligomers; cellular fractionation experiments indicate that MUT-7 is expressed in adult worms, and resides in a complex in both the cytosol and nucleus; in the cytosolic complex, MUT-7 interacts with RDE-2, a novel protein also required for RNA interference.
19nas-8C34D4.9n/achrIV 7,117,415nas-8 encodes an astacin-like metalloprotease.
20msp-38K08F4.8n/achrIV 10,143,514msp-38 encodes a member of the major sperm protein family; msp-38 has a C. briggsae homolog as predicted by the Wobble Bulk Aware Bulk Aligner (WABA).
21B0334.6B0334.6n/achrII 11,512,193contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22T26C5.4T26C5.4n/achrII 9,249,704contains similarity to Encephalitozoon cuniculi SER/THR protein phosphatase 2-A (EC 3.1.3.16) (Serine/threoninesprotein phosphatase).; TR:Q8SS50
23osm-11F11C7.5n/achrX 17,420,817C. elegans OSM-11 protein ;
24M01E5.2M01E5.2n/achrI 13,278,606contains similarity to Pfam domains PF01018 (GTP1/OBG) , PF01926 (GTPase of unknown function) contains similarity to Interpro domains IPR014100 (GTP-binding protein Obg/CgtA), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR006169 (GTP1/OBG subdomain), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG)
25K04G11.1K04G11.1n/achrX 14,335,998contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
26M02G9.3M02G9.3n/achrII 10,319,023contains similarity to Pfam domain PF02363 Cysteine rich repeat contains similarity to Interpro domains IPR003341 (Cysteine rich repeat, tripleX), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
27K09A9.4K09A9.4n/achrX 15,593,283contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
28C41D11.1C41D11.1n/achrI 4,458,028
29secs-1D1054.13n/achrV 10,803,314C. elegans SECS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05889 Soluble liver antigen/liver pancreas antigen (SLA/LP autoantigen) contains similarity to Interpro domains IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR008829 (Soluble liver antigen/liver pancreas antigen)
30C14B1.6C14B1.6n/achrIII 3,716,084contains similarity to Interpro domain IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase)
31sra-27F18C5.1n/achrII 6,569,673C. elegans SRA-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32ced-12Y106G6E.5n/achrI 10,224,961ced-12 is required both for phagocytotic engulfment of dying (apoptotic) cells, and for normal migrations of healthy cells during development.
33M28.2M28.2n/achrII 10,636,216contains similarity to Phytophthora infestans NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L (EC 1.6.5.3).; SW:NULM_PHYIN
34str-78Y40H7A.1n/achrIV 15,145,449C. elegans STR-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35F02C12.3F02C12.3n/achrX 13,397,291
36C04G6.4C04G6.4n/achrII 5,082,452contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
37kin-4C10C6.1n/achrIV 11,441,819C. elegans KIN-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF08926 (Domain of unknown function (DUF1908)) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR015022 (Region of unknown function DUF1908), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000961 (Protein kinase, C-terminal)
38nhr-256ZK697.2n/achrV 1,745,848C. elegans NHR-256 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39F31D5.4F31D5.4n/achrII 4,179,466contains similarity to Pfam domain PF01825 Latrophilin/CL-1-like GPS domain contains similarity to Interpro domain IPR000203 (GPS)
40JC8.7JC8.7n/achrIV 13,248,845contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C4orf27; ENSEMBL:ENSP00000261511
41drh-3D2005.5n/achrI 7,823,605drh-3 encodes a DExH-box helicase.
42ddl-2Y48E1B.1n/achrII 13,545,140C. elegans DDL-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
43srw-8F59D6.5n/achrV 3,033,490C. elegans SRW-8 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
44srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45ulp-4C41C4.6n/achrII 8,132,271C. elegans ULP-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02902 Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain contains similarity to Interpro domain IPR003653 (Peptidase C48, SUMO/Sentrin/Ubl1)
46coq-4T03F1.2n/achrI 3,869,644coq-4 encodes an ortholog of S. cerevisiae COQ4; while COQ-4 is conserved between eukaryotes and bacteria, its biochemical function is unknown; by orthology, COQ-4 is predicted to peripherally associate with the matrix face of the mitochondrial inner membrane, in a complex with COQ-3 (and perhaps COQ-6), and to be required to maintain a steady-state level of CLK-1/COQ-7 protein; COQ-4 is required for ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis and for normally short lifespan; coq-4(RNAi) animals have reduced levels of coenzyme Q9 and superoxide, and have abnormally long lifespans.
47C05A9.3C05A9.3n/achrX 10,830,625contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
48C10A4.2C10A4.2n/achrX 7,412,571
49F46B6.4F46B6.4n/achrV 9,778,673contains similarity to Pfam domain PF01926 GTPase of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR016496 (GTP-binding protein, HflX), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR006073 (GTP1/OBG)
50T26E3.4T26E3.4n/achrI 12,666,969contains similarity to Pfam domain PF05773 RWD domain contains similarity to Interpro domains IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like)