UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R04A9.3R04A9.33e-153chrX 378,980
2T04C10.3T04C10.3n/achrX 14,813,291contains similarity to Rattus norvegicus Myosin heavy chain, nonmuscle type A (Cellular myosin heavy chain,stype A) (Nonmuscle myosin heavy chain-A) (NMMHC-A).; SW:MYH9_RAT
3fbxa-171C38D9.1n/achrV 17,564,573This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
4C39B10.4C39B10.4n/achrX 10,445,432contains similarity to Brachydanio rerio Similar to synaptonemal complex protein 1 (Fragment).; TR:Q7ZVL0
5pax-2K06B9.5n/achrIV 4,202,013C. elegans PAX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
6F56A11.4F56A11.4n/achrIV 550,691contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7pik-1K09B11.1n/achrIV 13,419,126The pik-1 gene encodes a pelle/IRAK kinase homolog that may be involved in apoptosis.
8srw-39F19B2.3n/achrV 20,166,056C. elegans SRW-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domain IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
9str-248C55A1.3n/achrV 15,628,858C. elegans STR-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10F38B6.7F38B6.7n/achrX 6,697,033contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
11sre-24F37B4.9n/achrV 2,885,567C. elegans SRE-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001382 (Glycoside hydrolase, family 47)
12srsx-32F20A1.3n/achrV 7,018,087C. elegans SRSX-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13str-224K10C9.8n/achrV 1,057,769C. elegans STR-224 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14srx-63K07C6.6n/achrV 3,932,495C. elegans SRX-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15T03E6.2T03E6.2n/achrV 16,582,078contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16C11G10.1C11G10.1n/achrX 15,157,907
17F35E8.2F35E8.2n/achrV 15,906,320contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DZ81
18K09H11.4K09H11.4n/achrV 5,724,796contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
19srxa-16F44G3.5n/achrV 16,113,637C. elegans SRXA-16 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
20C14A6.3C14A6.3n/achrV 18,147,539contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
21F59D12.1F59D12.1n/achrX 15,669,484contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22Y16B4A.2Y16B4A.2n/achrX 14,766,829contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
23F53E10.3F53E10.3n/achrV 2,606,470
24nhr-280C29F9.13n/achrIII 130,464C. elegans NHR-280 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
25T21D11.1T21D11.1n/achrIII 7,246,672contains similarity to Pfam domain PF00413 Matrixin contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR001818 (Peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin)
26srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27R03G8.1R03G8.1n/achrX 13,086,031contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
28srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29nhr-116F09C6.9n/achrV 16,913,761C. elegans NHR-116 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30F28H6.7F28H6.7n/achrX 14,116,353contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
31F59E12.8F59E12.8n/achrII 5,635,699contains similarity to Interpro domain IPR015683 (Glutamate receptor-related)
32T08B6.2T08B6.2n/achrIV 4,895,590
33gnrr-3ZC374.1n/achrX 10,050,904C. elegans GNRR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
34sra-1AH6.4n/achrII 9,520,857sra-1 encodes a predicted seven transmembrane receptor; expressed in the male SPD and SPV neurons.
35srw-122H27D07.5n/achrV 2,951,456C. elegans SRW-122 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36F52F10.4F52F10.4n/achrV 1,544,140contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
37K02F6.4K02F6.4n/achrII 2,541,208contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
38srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
39T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
40srg-33F21F8.1n/achrV 8,292,769C. elegans SRG-33 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
41F54C1.6F54C1.6n/achrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)
42str-208F26G5.2n/achrV 4,957,686C. elegans STR-208 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43T04F3.4T04F3.4n/achrV 11,762,441contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
44ceh-24F55B12.1n/achrV 13,814,273ceh-24 is orthologous to the human gene SIMILAR TO THYROID TRANSCRIPTION FACTOR 1 (TITF1; OMIM:600635), which when mutated leads to disease.
45Y75B8A.19Y75B8A.19n/achrIII 12,229,214contains similarity to Lactococcus lactis Signal peptidase I (EC 3.4.21.89).; TR:Q9CDG2
46nhr-70Y51A2D.17n/achrV 18,618,286C. elegans NHR-70 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor)
47ZC482.3ZC482.3n/achrIII 12,762,606contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
48K02D7.5K02D7.5n/achrIV 309,359contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
49K10B4.1K10B4.1n/achrII 137,530contains similarity to Pfam domain PF03098 Animal haem peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR002007 (Haem peroxidase, animal)
50R10F2.5R10F2.5n/achrIII 2,924,200contains similarity to Interpro domain IPR000443 (Islet amyloid polypeptide)