UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R03H10.5R03H10.51e-88chrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
2M01E10.3M01E10.3n/achrIII 2,054,148contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
3D2062.1D2062.1n/achrII 2,632,264contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
4F44A2.7F44A2.7n/achrV 9,322,227
5clec-264F31D4.4n/achrV 20,844,595C. elegans CLEC-264 protein; contains similarity to Pfam domains PF01466 (Skp1 family, dimerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
6F10G2.7F10G2.7n/achrV 7,335,453contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
7F53B1.3F53B1.3n/achrX 2,106,394
8C17C3.3C17C3.3n/achrII 5,562,616contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
9ugt-36F09G2.6n/achrV 7,168,088C. elegans UGT-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR008081 (Cytoplasmic FMR1-interacting), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
10ZC412.1ZC412.1n/achrV 14,855,683contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11T22B2.2T22B2.2n/achrX 3,922,438
12ZC196.3ZC196.3n/achrV 8,737,532contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
13Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
14srj-13R13D7.3n/achrV 7,403,263C. elegans SRJ-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15str-106K05D4.2n/achrV 16,181,228C. elegans STR-106 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F14D7.5F14D7.5n/achrV 14,299,389contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Hypothetical protein.; TR:Q8ABS0
17srg-40T19C4.4n/achrV 11,163,867C. elegans SRG-40 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
18str-115F07B10.3n/achrV 11,269,735C. elegans STR-115 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19C18H7.9C18H7.9n/achrIV 603,317contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
20srh-100C46E10.10n/achrII 3,713,935C. elegans SRH-100 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21nhr-281F16B12.8n/achrX 14,112,277C. elegans NHR-281 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
22pqn-97ZK488.10n/achrV 609,465The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
23B0222.2B0222.2n/achrV 9,136,662contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
24srh-209ZK262.11n/achrV 18,404,256C. elegans SRH-209 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25C17A2.4C17A2.4n/achrII 3,840,560contains similarity to Cebus apella Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1 (EC 2.4.1.69) (GDP-L-sfucose:beta-D-galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1)s(Alpha(1,2)FT 1) (Fucosyltransferase 1).; SW:Q866E8
26odr-3C34D1.3n/achrV 13,248,189odr-3 encodes a G protein alpha subunit; odr-3 activity is required for normal chemotaxis, odorant avoidance, and nociceptive function as well as cilium morphogenesis in chemosensory neurons; an ODR-3::GFP is expressed in five pairs of sensory neurons AWA, AWB, AWC, ASH, and ADF; the AWC neurons consistently express GFP most strongly, while the AWB neurons express at lower levels and the AWA, ASH, and ADF neurons express only weakly; in AWC neurons, ODR-3::GFP localizes to cilia which have a characteristic wing-shaped morphology.
27C50E3.8C50E3.8n/achrV 7,598,180
28F08H9.4F08H9.4n/achrV 14,463,959F08H9.4 encodes a heat shock protein (HSP) of the HSP16 class; unlike most HSP16s in C. elegans, it is specifically expressed in a particular tissue (the excretory canal and ventral nerve-cord neurons), and its expression is only mildly induced by heat shock; however, F08H9.4 expression is increased by heat shock, is induced in a new tissue type (intestine) by heat shock, and probably aids heat shock resistance, since F08H9.4(RNAi) animals die as embryos in heat shock at a higher rate than normal; in general, HSP16 proteins are thought to act as passive ligands for unfolded proteins that keep them safe from aggregation until the proteins can be refolded by a large (ATP-consuming) HSP.
29C55A1.7C55A1.7n/achrV 15,647,283contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
30sri-13M01G12.13n/achrI 12,141,648C. elegans SRI-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31F36H5.8F36H5.8n/achrII 1,749,990This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
32clec-116K04H8.1n/achrI 14,251,698C. elegans CLEC-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
34Y44A6C.1Y44A6C.1n/achrV 20,710,785contains similarity to Plasmodium falciparum Normocyte binding protein 2b.; TR:Q7YWE8
35K06A9.2K06A9.2n/achrX 1,538,348This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
36T12A2.5T12A2.5n/achrIII 6,236,471
37F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659
38T08G5.2T08G5.2n/achrV 14,025,155contains similarity to Homo sapiens Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1; ENSEMBL:ENSP00000312021
39C01G5.4C01G5.4n/achrIV 6,533,692contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein)
40F49H6.13F49H6.13n/achrV 17,008,999contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR001285 (Synaptophysin/synaptoporin)
41srh-258T06E6.7n/achrV 15,405,935C. elegans SRH-258 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42C13A10.2C13A10.2n/achrII 1,357,598
43K03F8.1K03F8.1n/achrIII 6,511,465contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
44T04C12.1T04C12.1n/achrV 11,058,930n/a
45K12H4.6K12H4.6n/achrIII 8,042,653
46grl-8ZC487.5n/achrV 6,732,495grl-8 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
47gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
48fbxa-159C08E3.11n/achrII 1,622,248C. elegans FBXA-159 protein ;
49C34D1.4C34D1.4n/achrV 13,258,178
50glb-15F35B12.8n/achrV 11,617,517glb-15 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.