UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R03G5.6R03G5.61e-38chrX 7,808,111
2F15G9.3F15G9.3n/achrX 9,710,815contains similarity to Plasmodium falciparum Prolyl-t-RNA synthase, putative (EC 6.1.1.15).; TR:Q8I2Q5
3F38H12.5F38H12.5n/achrV 4,082,125contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
4M03D4.6M03D4.6n/achrIV 6,144,282contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
5K04F1.6K04F1.6n/achrV 1,671,713contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
6srd-70F48F5.4n/achrV 20,450,660C. elegans SRD-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7T27E7.4T27E7.4n/achrIV 14,534,258contains similarity to Pelomedusa subrufa NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 (EC 1.6.5.3).; SW:NU5M_PELSU
8M163.7M163.7n/achrX 14,466,135contains similarity to Reclinomonas americana Ribosomal protein L31.; TR:O21296
9Y17D7B.2Y17D7B.2n/achrV 18,788,749contains similarity to Xenopus laevis Phosphoinositide-3-kinase.; TR:Q8UUU2
10F55G7.1F55G7.1n/achrX 11,925,643contains similarity to Galleria mellonella Sericin-2 (Silk gum protein 2) (Fragment).; SW:SER2_GALME
11R07C3.10R07C3.10n/achrII 910,744
12php-3Y75B8A.1n/achrIII 12,075,804C. elegans PHP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
13F55C7.2F55C7.2n/achrI 4,005,729
14clec-45F07C4.2n/achrV 7,638,344C. elegans CLEC-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
15B0034.2B0034.2n/achrII 5,944,245
16Y40H7A.2Y40H7A.2n/achrIV 15,156,851contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
17srx-62K09D9.10n/achrV 3,995,344C. elegans SRX-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18C08E8.2C08E8.2n/achrV 18,354,641contains similarity to Pfam domain PF03088 Strictosidine synthase contains similarity to Interpro domains IPR004141 (Strictosidine synthase), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like)
19clec-55F08H9.9n/achrV 14,480,717C. elegans CLEC-55 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
20fbxa-188F47H4.8n/achrV 17,343,887This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
21F56F11.1F56F11.1n/achrIII 2,892,177
22T22H2.2T22H2.2n/achrI 11,705,155contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
23lgc-31F21A3.7n/achrV 15,516,308C. elegans LGC-31 protein
24acr-21F27B3.2n/achrIII 6,584,504acr-21 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR); ACR-21 is a highly divergent member of the 'ACR-16' class of nAChR subunits, which includes ACR-7, ACR-9, ACR-10, ACR-11, ACR-14, ACR-15, ACR-16, and ACR-19, and is most closely related to the alpha-7 subunits of vertebrate nAChRs.
25Y26D4A.9Y26D4A.9n/achrI 13,088,824contains similarity to Pfam domain PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral contains similarity to Interpro domains IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR004868 (DNA-directed DNA polymerase, family B, mitochondria/virus)
26F22G12.5F22G12.5n/achrI 13,172,567contains similarity to Interpro domain IPR001765 (Carbonic anhydrase)
27F55F1.1F55F1.1n/achrX 2,779,060contains similarity to Homo sapiens Rho family guanine-nucleotide exchange factor; ENSEMBL:ENSP00000328118
28T02H6.5T02H6.5n/achrII 687,130contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
29T22F3.8T22F3.8n/achrV 3,603,747contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30srd-49R04B5.8n/achrV 10,095,486C. elegans SRD-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31C03C10.2C03C10.2n/achrIII 4,092,033contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
32ZK938.4ZK938.4n/achrII 9,835,995contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
33C07B5.3C07B5.3n/achrX 9,522,844
34nca-2C27F2.2n/achrIII 4,972,657nca-2 encodes a novel, four-domain alpha1U Ca2+ channel subunit; nca-2 functions redundantly with a paralog, nca-1, to regulate locomotion and the response to specific volatile anesthetics; in regulating these processes, nca-1 and nca-2 function in the same pathway as unc-79, which encodes a conserved novel protein that positively regulates levels of NCA-1 and NCA-2 protein; nca-2::gfp reporters are expressed in the nervous system in a few pharyngeal neurons, many nerve ring interneurons, most ventral nerve motor cord neurons, and in neurons and muscles in the tail; diffuse expression is also seen in vulval muscles and the intestine.
35F49C12.1F49C12.1n/achrIV 9,295,603contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
36nhr-153C13C4.1n/achrV 12,105,417C. elegans NHR-153 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
37C36B7.2C36B7.2n/achrX 7,106,598contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38srw-84Y43F8A.4n/achrV 19,382,978C. elegans SRW-84 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
40T28A11.13T28A11.13n/achrV 3,249,973contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR006662 (Thioredoxin-related)
41T11F1.3T11F1.3n/achrII 2,955,703
42Y48A6B.1Y48A6B.1n/achrIII 10,993,565contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43Y17G7B.19Y17G7B.19n/achrII 12,110,327contains similarity to Pfam domain PF01666 (DX module)
44C56A3.3C56A3.3n/achrV 13,533,300C56A3.3 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C56A3.3 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
45str-14T08G3.2n/achrV 16,454,252C. elegans STR-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46srw-23F49A5.8n/achrV 16,874,669C. elegans SRW-23 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
47spe-38Y52B11A.1n/achrI 10,965,401C. elegans SPE-38 protein ;
48srw-7R08F11.5n/achrV 3,806,992C. elegans SRW-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
49C50H2.6C50H2.6n/achrV 9,921,737contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
50F16H6.6F16H6.6n/achrV 18,205,786contains similarity to Anthyllis vulneraria subsp lapponica Maturase-like protein.; TR:Q8HUG8