UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1M79.2M79.21e-143chrX 10,628,258contains similarity to Homo sapiens 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase theta; ENSEMBL:ENSP00000264409
2M79.3M79.3n/achrX 10,626,990contains similarity to Pfam domain PF01553 Acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
3fbxa-150Y38H6C.11n/achrV 20,518,929This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
4nhr-183F41B5.10n/achrV 2,263,548C. elegans NHR-183 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5pad-1Y18D10A.13n/achrI 12,890,677The pad-1 gene encodes a highly conserved, but unfamiliar, protein that is required for embryonic development.
6prl-1T19D2.2n/achrX 3,941,707C. elegans PRL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
7tba-7T28D6.2n/achrIII 11,369,983C. elegans TBA-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
8fbxa-105C02H6.2n/achrV 7,391,288This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
9W03A5.2W03A5.2n/achrIII 5,407,000W03A5.2 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:19580) (GGCX; OMIM:137167), which when mutated leads to disease.
10F36H2.3F36H2.3n/achrI 9,258,077contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
11Y38H6C.20Y38H6C.20n/achrV 20,544,616contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
12W01A8.3W01A8.3n/achrI 7,066,580contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
13Y54G9A.4Y54G9A.4n/achrII 13,714,353contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
14T05H10.3T05H10.3n/achrII 8,049,736
15C39E9.10C39E9.10n/achrIV 13,088,275contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR006052 (Tumor Necrosis Factor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
16gpb-1F13D12.7n/achrII 11,745,729gpb-1 encodes a heterotrimeric G protein beta subunit that is required during embryonic development for the proper orientation of the mitotic spindle during early cell divisions and thus affects the orientation of early cell division axes, and is also required for larval viability, negatively regulates locomotion and egg-laying, and may affect germline development and osmotic balance; expressed in early embryos with highest expression at cell membranes and colocalizes with asters just before and during early cell divisions (this localization is dependent upon G alpha subunits); adults display high levels of expression in neurons with lower expression in the somatic gonad, vulva, and hypodermal seam cells and expression is also detected in the intestine, pharynx, body wall muscles and in the germline.
17Y39A1A.14Y39A1A.14n/achrIII 10,649,949contains similarity to Pfam domain PF03587 Nep1 ribosome biogenesis protein contains similarity to Interpro domain IPR005304 (Suppressor Mra1)
18glb-23R13A1.8n/achrIV 7,218,772glb-23 encodes a globin; glb-23 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-23 has no obvious function in mass RNAi assays.
19ztf-2F13G3.1n/achrI 7,292,255C. elegans ZTF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR013993 (Zinc finger, N-recognin, metazoa), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
20alh-5T08B1.3n/achrV 1,997,845C. elegans ALH-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00171 Aldehyde dehydrogenase family contains similarity to Interpro domains IPR016163 (Aldehyde dehydrogenase, C-terminal), IPR016162 (Aldehyde dehydrogenase, N-terminal), IPR012394 (Aldehyde dehydrogenase NAD(P)-dependent), IPR016161 (Aldehyde/histidinol dehydrogenase), IPR015590 (Aldehyde dehydrogenase)
21exc-7F35H8.5n/achrII 9,578,446exc-7 encodes an ELAV, an mRNA-binding protein homologous to Drosophila ELAV and human HuC/D (OMIM:603458, 168360, autoimmune antigens associated with paraneoplastic neurologic disorders); EXC-7 is required for formation of the tailspike and the excretory cell canals; exc-7 mutations enhance defects produced by mutations in exc-3, predicted to encode a peptidase, and sma-1, which encodes beta H-spectrin, a key component of the apical cytokeleton of polarized epithelial cells such as the excretory cell; in vitro, EXC-7 can bind the sma-1 mRNA 3' UTR, and thus is predicted to regulate SMA-1 expression in vivo; EXC-7 is expressed transiently in the excretory cell nucleus during mid-embryogenesis and during larval stages is detected in the pharynx, nerve ring, and nerve cord nuclei.
22fbxa-90Y102A5C.19n/achrV 16,967,704This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
23K08D9.4K08D9.4n/achrV 3,199,601contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase)
24B0331.2B0331.2n/achrV 9,660,245contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
25gst-21ZK697.6n/achrV 1,731,381C. elegans GST-21 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
26cpt-6W01A11.5n/achrV 6,491,977C. elegans CPT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00755 Choline/Carnitine o-acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR000542 (Acyltransferase ChoActase/COT/CPT)
27cyp-33C6F41B5.7n/achrV 2,248,474C. elegans CYP-33C6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
28F13C5.5F13C5.5n/achrX 606,710
29F19B2.7F19B2.7n/achrV 20,150,407contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30F28F5.4F28F5.4n/achrIII 6,816,698
31C50F4.2C50F4.2n/achrV 9,533,151C50F4.2 encodes a putative 6-phosphofructokinase, paralogous to Y71H10A.1; C50F4.2 is required for fertility, full body size, and normally rapid growth in mass RNAi assays; C50F4.2 transcripts are enriched during spermatogenesis.
32F59A1.10F59A1.10n/achrV 17,661,006contains similarity to Pfam domain PF03982 Diacylglycerol acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR007130 (Diacylglycerol acyltransferase)
33F38B2.2F38B2.2n/achrX 11,278,957contains similarity to Pneumocystis carinii DNA-directed RNA polymerase III (EC 2.7.7.6) (Fragment).; TR:Q06358
34bath-46T07H3.2n/achrII 1,598,755C. elegans BATH-46 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
35R90.1R90.1n/achrV 12,893,678contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
36nas-32T02B11.7n/achrV 897,042C. elegans NAS-32 protein; contains similarity to Pfam domains PF01549 (ShK domain-like) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
37Y41C4A.11Y41C4A.11n/achrIII 11,721,632Y41C4A.11 encodes a divergent paralog of F38E11.5, the beta' (beta-prime) subunit of the coatomer (COPI) complex; unlike F38E11.5, Y41C4A.11 has no obvious function in mass RNAi assays.
38sulp-3F41D9.5n/achrX 8,405,893sulp-3 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-3 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a sulp-3::GFP transcriptional fusion is expressed exclusively in the pharyngeal muscles.
39his-16ZK131.10n/achrII 13,817,860his-16 encodes an H2A histone; his-16 is contained within the histone gene cluster HIS3.
40K09A9.1K09A9.1n/achrX 15,609,812contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
41F35H10.10F35H10.10n/achrIV 8,310,117contains similarity to Pfam domain PF00003 7 transmembrane receptor (metabotropic glutamate family) contains similarity to Interpro domain IPR000337 (GPCR, family 3)
42Y41E3.6Y41E3.6n/achrIV 15,006,683contains similarity to Bacillus halodurans Stress-and starvation-induced gene controlled by sigma-B.; TR:Q9KE40
43ZK228.3ZK228.3n/achrV 18,459,731contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
44F35E8.1F35E8.1n/achrV 15,904,615contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
45T25B9.10T25B9.10n/achrIV 10,771,465contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
46K11G9.1K11G9.1n/achrV 6,677,918contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
47Y43F4A.4Y43F4A.4n/achrIII 13,245,650contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein DKFZp313C0640; ENSEMBL:ENSP00000367438
48D1005.3D1005.3n/achrX 1,453,357contains similarity to Pfam domain PF07716 Basic region leucine zipper contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
49nhr-7F54D1.4n/achrIV 11,267,544C. elegans NHR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
50scl-10F49E11.5n/achrIV 13,049,134C. elegans SCL-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)