UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1M28.4M28.40chrII 10,645,246contains similarity to Homo sapiens Kinesin-like protein 2; ENSEMBL:ENSP00000324020
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3F55E10.2F55E10.2n/achrX 8,340,780
4T05B4.9T05B4.9n/achrV 4,117,993contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
5F08G12.5F08G12.5n/achrX 11,309,490contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
6C16D9.3C16D9.3n/achrV 8,239,232
7C10A4.3C10A4.3n/achrX 7,408,027
8F21H7.3F21H7.3n/achrV 16,232,966contains similarity to Rickettsia conorii Hypothetical protein RC0540.; TR:Q92I80
9F32D1.3F32D1.3n/achrV 4,355,654contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (3), PF08409 (Domain of unknown function (DUF1736)) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (6)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013618 (Region of unknown function DUF1736), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
10sdz-19F45E6.6n/achrX 12,502,884C. elegans SDZ-19 protein ;
11F40F11.4F40F11.4n/achrIV 11,590,249contains similarity to Interpro domains IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
12C18D1.2C18D1.2n/achrII 10,057,912contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
13R02C2.1R02C2.1n/achrV 237,472contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14F56F11.5F56F11.5n/achrIII 2,853,197
15nlp-22T24D8.3n/achrX 2,341,705C. elegans NLP-22 protein ;
16C03H5.4C03H5.4n/achrII 375,541contains similarity to Pfam domain PF00068 Phospholipase A2 contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR001211 (Phospholipase A2, eukaryotic), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
17str-140C09H5.3n/achrV 8,066,820C. elegans STR-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18lgc-31F21A3.7n/achrV 15,516,308C. elegans LGC-31 protein
19tkr-1C38C10.1n/achrIII 9,386,535tkr-1 encodes a G protein-coupled receptor that is the C. elegans tachykinin-like neuropeptide receptor homolog; by homology, TKR-1 is predicted to function in modulation of excitatory neurotransmission; as loss of tkr-1 activity via RNAi results in moderate reduction of fat content, TKR-1 may play a specific role in regulating lipid metabolism; a tkr-1 reporter gene fusion is reportedly expressed in the socket cells of the deirid and post-deirid sensilla from the L2 larval stage through adulthood.
20srj-20Y45G12C.15n/achrV 2,572,367C. elegans SRJ-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21T07D10.1T07D10.1n/achrI 12,604,999contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Katanin p80 subunit.; TR:O61585
22srx-21F31F4.4n/achrV 678,220C. elegans SRX-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
23Y43F8B.10Y43F8B.10n/achrV 19,475,668
24dyf-5M04C9.5n/achrI 9,360,991dyf-5 encodes a putative MAP kinase orthologous to human MAK/ICK (OMIM:154235), Chlamydomonas reinhardtii LF4, and Leishmania mexicana MPK9; DYF-5 negatively regulates cilial length, restricts KAP-1 to middle ciliary segments, is required for normal localization of six IFT components, and is required for OSM-3 to comigrate normally with IFT particles; DYF-5 is also required for dye-filling of amphid and phasmid neurons and for normal chemotaxis, dauer formation, and male mating; DYF-5 is expressed in head neurons (including amphid neurons), tail neurons (including phasmid neurons), CAN cells, excretory canal neurons, posterior lateral ganglion neurons and in many male tail cells; dyf-5 mutant cilia are abnormally elongated, either failing to enter the amphid channel or accumulating IFT proteins at their distal ends, whereas DYF-5 overexpression results in truncated cilia; the dyf-5 promoter region contains an X-box, predicted to be bound and transcriptionally activated by DAF-19, and dyf-5 is regulated by DAF-19 in vivo; dyf-5 animals are slightly shorter than normal.
25F28B3.4F28B3.4n/achrI 4,937,314contains similarity to Pfam domain PF06464 DMAP1-binding Domain contains similarity to Interpro domains IPR010506 (DMAP1-binding), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
26F31F4.11F31F4.11n/achrV 663,441contains similarity to Pfam domains PF00788 (Ras association (RalGDS/AF-6) domain) , PF02204 (Vacuolar sorting protein 9 (VPS9) domain) contains similarity to Interpro domains IPR013995 (Vacuolar sorting protein 9, subgroup), IPR003123 (Vacuolar sorting protein 9), IPR000159 (Ras-association)
27T07F8.1T07F8.1n/achrII 7,150,444contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
28Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
29ZK1053.1ZK1053.1n/achrI 13,229,159contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
30php-3Y75B8A.1n/achrIII 12,075,804C. elegans PHP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
31str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C50E3.8C50E3.8n/achrV 7,598,180
33F16B12.4F16B12.4n/achrX 14,097,334contains similarity to Dictyostelium discoideum Myosin II heavy chain, non muscle.; SW:MYS2_DICDI
34srg-14F26B1.6n/achrI 6,313,673C. elegans SRG-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
35str-130C09H5.9n/achrV 8,089,962C. elegans STR-130 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36C03C10.2C03C10.2n/achrIII 4,092,033contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
37R03A10.1R03A10.1n/achrX 15,430,484contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in transcription-coupled repair nucleotide exicision repair of UV-induced DNA lesions; homolog of human CSB protein; SGD:YJR035W
38srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39str-143C09H5.4n/achrV 8,068,920C. elegans STR-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40B0207.2B0207.2n/achrI 5,955,959
41Y12A6A.2Y12A6A.2n/achrX 13,619,323contains similarity to Phaseolus lunatus Double-headed bowman-birk inhibitor (Fragment).; TR:Q941H3
42str-131C09H5.6n/achrV 8,081,002C. elegans STR-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43hlh-27C17C3.10n/achrII 5,540,531C. elegans HLH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
44T11A5.1T11A5.1n/achrV 9,859,109contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase)
45C16D6.1C16D6.1n/achrX 12,525,704contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
46ZK1240.8ZK1240.8n/achrII 2,328,024contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
47tbx-41T26C11.1n/achrX 1,865,937C. elegans TBX-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
48R02F2.2R02F2.2n/achrIII 5,493,250contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001331 (Guanine-nucleotide dissociation stimulator, CDC24, conserved site)
49fut-6T05A7.5n/achrII 4,654,556C. elegans FUT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00852 Glycosyltransferase family 10 (fucosyltransferase) contains similarity to Interpro domain IPR001503 (Glycosyl transferase, family 10)
50tbx-11F40H6.4n/achrIII 6,046,285tbx-11 encodes a T-box transcription factor that is orthologous to members of the Tbx2 subfamily of T-box transcription factors; by homology, TBX-11 is predicted to function in transcriptional regulation during cellular differentiation, potentially as both an activator and a repressor; however, as loss of tbx-11 function via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of tbx-11 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.