UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1sdz-25M116.40chrIV 8,405,798C. elegans SDZ-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
2T05E7.5T05E7.5n/achrI 6,201,572contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2EJ43
3F56A8.8F56A8.8n/achrIII 13,286,178contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IHP7
4sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
5T04B8.3T04B8.3n/achrII 628,093contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
6sdz-33Y56A3A.14n/achrIII 11,907,882This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
7fbxb-26F58E1.30.00009chrII 1,683,034This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
8B0304.2B0304.2n/achrII 4,524,073
9Y106G6D.1Y106G6D.1n/achrI 10,108,184contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:Q58718
10F28D1.2F28D1.2n/achrIV 12,375,385contains similarity to Homo sapiens Myelin transcription factor 1; ENSEMBL:ENSP00000327465
11sdz-28R52.1n/achrII 2,131,740C. elegans SDZ-28 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
12Y106G6D.2Y106G6D.2n/achrI 10,111,416contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC283767; ENSEMBL:ENSP00000347269
13Y43F11A.4Y43F11A.4n/achrII 12,120,633contains similarity to Bos taurus Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory gamma subunit (PI3-kinasesp85-gamma subunit) (PtdIns-3-kinase p85-gamma) (p55PIK).; SW:P55G_BOVIN
14C35D6.4C35D6.4n/achrIV 16,351,255C35D6.4 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to other TZF proteins, such as MEX-5 and POS-1, the product of C35D6.4 is predicted to function as an RNA-binding protein.
15sdz-22F56F4.1n/achrI 6,148,622C. elegans SDZ-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
16T24C4.2T24C4.2n/achrIII 868,674
17fbxb-17F58E1.50.00000000005chrII 1,676,856This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
18fbxb-83T17A3.60.0000000003chrIII 144,210C. elegans FBXB-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
19fbxb-66Y40B1B.30.00000000002chrI 13,424,575C. elegans FBXB-66 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
20F48E3.6F48E3.6n/achrX 7,501,882
21fbxb-32M151.60.0003chrII 3,646,198C. elegans FBXB-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
22R11.4R11.4n/achrX 16,210,394contains similarity to Leishmania major Hypothetical protein.; TR:Q9GRL1
23fbxb-54K05F6.78e-16chrII 1,555,788C. elegans FBXB-54 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001404 (Heat shock protein Hsp90), IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
24ins-2ZK75.2n/achrII 5,988,821ins-2 encodes an insulin-like peptide.
25skr-21K08H2.1n/achrX 13,226,159The skr-21 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-21(RNAi) animals are at least superficially normal.
26fbxb-8F49B2.10.000000000001chrI 14,302,931This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
27ZK418.3ZK418.3n/achrIII 7,070,514contains similarity to Homo sapiens Transmembrane protein 17; ENSEMBL:ENSP00000335094
28F38C2.5F38C2.5n/achrIV 16,278,575F38C2.5 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to C. elegans POS-1, the product of F38C2.5 is predicted to function as an RNA-binding protein.
29bath-10Y49F6C.4n/achrII 3,375,923C. elegans BATH-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
30K02B12.2K02B12.2n/achrI 8,512,048contains similarity to Interpro domain IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding)
31ZK675.4ZK675.4n/achrII 7,911,649contains similarity to Homo sapiens Nuclear pore glycoprotein p62; ENSEMBL:ENSP00000305503
32fbxb-37T16A1.80.00009chrII 2,092,797This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
33fbxb-3F38H4.20.0000000003chrIV 11,839,582This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
34F58E6.3F58E6.3n/achrV 9,748,618contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (4)contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
35F13H10.1F13H10.1n/achrIV 11,004,784contains similarity to Oryza sativa Putative pM5 collagenase.; TR:Q93W04
36fbxb-22Y56A3A.100.00009chrIII 11,882,947This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
37dsl-6H02I12.4n/achrIV 11,397,523dsl-6 encodes a putative transmembrane protein whose extracellular domain has a single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-6 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
38ces-2ZK909.4n/achrI 14,963,425ces-2 encodes a basic region leucine-zipper (bZIP) transcription factor, most similar in sequence and binding specificity to the PAR (proline- and acid-rich) subfamily of bZIP proteins; ces-2 is required to activate programmed cell death in the sister cells of the serotoninergic neurosecretory motor (NSM) neurons, and is transcriptionally inhibited by activated LET-60(G12V).
39C33E10.1C33E10.1n/achrX 17,305,742This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
40K08B4.2K08B4.2n/achrIV 6,075,712
41C31H5.6C31H5.6n/achrI 9,045,096contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
42fbxb-62F55C9.8n/achrV 19,301,505This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
43T12A2.3T12A2.3n/achrIII 6,241,137
44sdz-14F14B6.1n/achrI 12,216,990C. elegans SDZ-14 protein ;
45col-74ZK1248.2n/achrII 5,831,409C. elegans COL-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
46fbxb-16ZC204.100.00000008chrII 1,651,202fbxb-16 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; FBXB-16 also contains a C-terminal type 2 F-box-associated domain of presently unknown function.
47C41H7.2C41H7.2n/achrII 3,015,393This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
48btb-10K02E7.9n/achrII 1,060,263C. elegans BTB-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
49T22C8.4T22C8.4n/achrII 8,623,075contains similarity to Interpro domains IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
50fbxb-18F58E1.80.000000006chrII 1,686,936This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains leucine-rich repeats.