UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1M01G12.6M01G12.60chrI 12,120,129contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
2F28C10.1F28C10.1n/achrX 543,683
3C32B5.6C32B5.6n/achrII 969,468
4sre-9C17E7.3n/achrV 3,896,569C. elegans SRE-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
5ZK945.4ZK945.4n/achrII 10,104,330contains similarity to Pfam domains PF00621 (RhoGEF domain) , PF00169 (PH domain) contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR015721 (Rho GTP exchange factor)
6C10C6.6C10C6.6n/achrIV 11,476,280contains similarity to Pfam domains PF00122 (E1-E2 ATPase) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) contains similarity to Interpro domains IPR008250 (E1-E2 ATPase-associated region), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit), IPR006544 (P-type ATPase of unknown pump specificity (type V)), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
7Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
8C53C7.3C53C7.3n/achrX 13,049,643contains similarity to Triticum aestivum Alpha/beta-gliadin A-V precursor (Prolamin).; SW:GDA5_WHEAT
9VF39H2L.1VF39H2L.1n/achrI 8,645,323contains similarity to Pfam domain PF05739 SNARE domain contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
10H34P18.1H34P18.10.002chrV 6,805,459contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11srh-244C03G6.9n/achrV 7,344,629C. elegans SRH-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12hsd-2ZC8.1n/achrX 5,006,115The ZC8.1 gene encodes a homolog of the human gene 3BH1, which when mutated leads to giant cell hepatitis (OMIM:231100).
13str-170T08B6.7n/achrIV 4,878,848C. elegans STR-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
15C40H5.2C40H5.2n/achrX 11,754,976contains similarity to Bifidobacterium longum Possible magnesium and cobalt transport protein.; TR:Q8G4E0
16M04D8.4M04D8.4n/achrIII 10,030,454contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE0262.; TR:Q8XNS0
17nhr-89E03H4.13n/achrI 12,440,583C. elegans NHR-89 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18M151.2M151.2n/achrII 3,632,782contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
19K09D9.12K09D9.12n/achrV 4,003,740
20F41G4.7F41G4.7n/achrX 16,834,908
21R02E12.5R02E12.5n/achrX 3,997,923
22mvb-12C06A6.3n/achrIV 7,831,453C. elegans MVB-12 protein ; contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Protein FAM125B; ENSEMBL:ENSP00000354772
23aat-4T13A10.10n/achrIV 6,274,136aat-4 encodes a predicted amino acid transporter catalytic subunit; unlike catalytic subunits in other organisms, however, AAT-4 does not contain the highly conserved cysteine residue known to facilitate covalent interaction with a glycoprotein subunit, suggesting that AAT-4 does not require this residue for heterodimer formation or, alternatively, does not require the glycoprotein subunit for function.
24F57G4.6F57G4.6n/achrV 17,643,424contains similarity to Interpro domains IPR013048 (Meiotic recombination Spo11), IPR006578 (MADF)
25C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
26srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
27str-108F10A3.13n/achrV 16,166,795C. elegans STR-108 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28F58B3.6F58B3.6n/achrIV 11,637,391contains similarity to Pfam domains PF04836 (Interferon-related protein conserved region) , PF05004 (Interferon-related developmental regulator (IFRD)) contains similarity to Interpro domains IPR007701 (Interferon-related developmental regulator), IPR006921 (Interferon-related protein conserved region), IPR016024 (Armadillo-type fold)
29emb-27F10B5.6n/achrII 8,160,979emb-27 encodes a tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein that is the C. elegans ortholog of the anaphase-promoting complex (APC) subunit APC-6 (CDC16); required maternally and paternally, EMB-27 activity is essential for proper execution of the metaphase-to-anaphase transition during meiosis (both oogenesis and spermatogenesis) and mitosis (during germline proliferation); EMB-27 activity is also critical for embryonic anterior-posterior (A-P) axis formation, production of the secreted eggshell, and normal vulval development; in establishing the embryonic A-P axis, EMB-27 likely acts upstream of the separin protease to ensure proper localization of PAR-3 and PAR-2 to the anterior and posterior cortices, respectively.
30srh-104F21H7.7n/achrV 16,243,471C. elegans SRH-104 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31T23C6.3T23C6.3n/achrX 17,137,111
32C18D4.3C18D4.3n/achrV 17,532,536contains similarity to Acetobacter diazotrophicus FixX.; TR:Q9FA07
33B0205.9B0205.9n/achrI 10,722,143contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
34tbx-32ZK380.1n/achrX 1,656,225C. elegans TBX-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
35Y51A2A.5Y51A2A.5n/achrV 18,299,724contains similarity to Saccharomyces cerevisiae transcription factor tau (TFIIIC) subunit 95; SGD:YBR123C
36C31E10.5C31E10.5n/achrX 13,993,587contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q92614 Myosin XVIIIA; ENSEMBL:ENSP00000332202
37C08G5.1C08G5.1n/achrII 736,664contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
38F25H9.6F25H9.6n/achrV 13,467,638contains similarity to Pfam domain PF02441 Flavoprotein contains similarity to Interpro domain IPR003382 (Flavoprotein)
39R09H3.3R09H3.3n/achrX 1,667,620
40T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
41gnrr-7F13D2.3n/achrX 11,186,568C. elegans GNRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42nhr-257C17A2.1n/achrII 3,853,795C. elegans NHR-257 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43nhr-189F47C10.8n/achrV 3,859,413C. elegans NHR-189 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44ZC196.4ZC196.4n/achrV 8,734,518contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR007883 (Protein of unknown function DUF713), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B)
45xpa-1K07G5.2n/achrI 7,160,236xpa-1 encodes an ortholog of human XPA, the xeroderma pigmentosum complementation group A protein (OMIM:278700, mutations are associated with sensitivity to ultraviolet light and carcinomata at an early age); by homology, XPA-1 is predicted to function as a DNA-binding protein that is required for nucleotide excision repair of damaged DNA; in C. elegans, loss of xpa-1 activity via mutation or RNA-mediated interference (RNAi) results in increased sensitivity to UV irradiation at all stages of development; xpa-1 mRNA is detected in eggs and mixed stage populations.
46F13H8.3F13H8.3n/achrII 6,264,731contains similarity to Pfam domain PF01156 Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001910 (Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase)
47K11G9.3K11G9.3n/achrV 6,670,893contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
48set-24Y43F11A.5n/achrII 12,122,894set-24 encodes a protein with an N-terminal SET domain, followed by two SPK domains; SET-24's domain organization resembles that of SET-5, but SET-24 has no known non-nematode orthologs or C. elegans paralogs; neither set-24(n4909) nor set-24(RNAi) have any obvious phenotypes.
49str-165F55B12.6n/achrV 13,832,194C. elegans STR-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001358 (Neuropeptide Y2 receptor)
50F13A2.2F13A2.2n/achrV 4,384,088