UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1set-13K12H6.110chrII 2,818,048set-13 encodes a SET domain-containing protein; SET-13 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-6, SET-15, SET-19, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-13(n5012) nor set-13(RNAi) have any obvious phenotypes.
2F19G12.3F19G12.3n/achrX 1,425,941contains similarity to Pfam domain PF02170 PAZ domain contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
3T23G5.3T23G5.3n/achrIII 9,230,130contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF00786 (P21-Rho-binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000095 (PAK-box/P21-Rho-binding), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
4sre-40T05A7.8n/achrII 4,682,734C. elegans SRE-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
5C10B5.1C10B5.1n/achrV 8,582,501contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
6W06G6.9W06G6.9n/achrV 16,646,169contains similarity to Ralstonia solanacearum Hypothetical protein RSc2317.; TR:Q8XX01
7C48B4.7C48B4.7n/achrIII 9,558,981contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7ZYB3
8C02H6.1C02H6.1n/achrV 7,389,111contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
9F44E5.2F44E5.2n/achrII 11,770,321contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat
10F26D2.14F26D2.14n/achrV 16,436,268contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
11C18A11.4C18A11.4n/achrX 8,046,427contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)
12srd-3K10B4.5n/achrII 127,822C. elegans SRD-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13K08D9.2K08D9.2n/achrV 3,228,961contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
14R119.5R119.5n/achrI 391,462contains similarity to Pfam domain PF01135 Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (PCMT) contains similarity to Interpro domain IPR000682 (Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)
15ncx-6C07A9.4n/achrIII 9,712,021ncx-6 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-7/-10; NCX-6 may function intracellularly; NCX-6 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
16wee-1.1F35H8.7n/achrII 9,582,677C. elegans WEE-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
17W06G6.12W06G6.12n/achrV 16,652,565contains similarity to Methanosarcina mazei Hypothetical protein MM2681.; TR:Q8PTN2
18F09F9.3F09F9.3n/achrX 4,120,310
19clec-90F57C9.2n/achrI 4,846,413C. elegans CLEC-90 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002919 (Protease inhibitor I8, cysteine-rich trypsin inhibitor-like), IPR001304 (C-type lectin)
20T06D4.2T06D4.2n/achrII 3,385,081
21C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
22F09E10.6F09E10.6n/achrX 1,496,339
23gcy-27C06A12.4n/achrIV 17,436,419C. elegans GCY-27 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
24Y17D7B.5Y17D7B.5n/achrV 18,775,675contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
25B0034.5B0034.5n/achrII 5,973,873contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26T26A5.4T26A5.4n/achrIII 6,461,112contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
27puf-4M4.2n/achrIV 3,207,566C. elegans PUF-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00806 Pumilio-family RNA binding repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR001313 (Pumilio RNA-binding region), IPR016024 (Armadillo-type fold)
28Y39A1A.2Y39A1A.2n/achrIII 10,602,626contains similarity to Oryza sativa Hypothetical protein.; TR:Q9LH25
29str-229C17E7.11n/achrV 3,901,512C. elegans STR-229 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30srh-47T03F7.4n/achrV 11,299,983C. elegans SRH-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
31srh-97F49H6.4n/achrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32T02G6.6T02G6.6n/achrI 11,821,054contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
33T02G5.11T02G5.11n/achrII 7,080,284contains similarity to Pfam domain PF05741 Nanos RNA binding domain contains similarity to Interpro domain IPR008705 (Zinc finger, Nanos)
34taf-11.3F43D9.5n/achrIII 10,504,535The taf-11.3 gene encodes an ortholog of human TATA-binding protein associated factor TAF11 (TAFII28, OMIM:600772) that is a component of the TFIID general transcription factor that recognizes the transcription start site; TAF-11.3 is required for proper post-embryonic development.
35srx-13C44B12.4n/achrIV 1,116,817C. elegans SRX-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36F11A1.2F11A1.2n/achrX 10,658,016
37T05C1.5T05C1.5n/achrII 4,490,625contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
38srx-3R03H4.3n/achrV 9,006,212C. elegans SRX-3 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39F41C6.2F41C6.2n/achrX 6,870,966
40srbc-18C45H4.6n/achrV 2,169,987C. elegans SRBC-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41F02E11.4F02E11.4n/achrII 3,276,774contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
42F49H6.8F49H6.8n/achrV 17,022,485contains similarity to Rattus norvegicus Transcription factor 8 (Zinc finger homeodomain enhancer-bindingsprotein) (Zfhep).; SW:TCF8_RAT
43srh-233Y113G7A.1n/achrV 20,046,361C. elegans SRH-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44F10D2.8F10D2.8n/achrV 7,150,438contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
45srx-41F59B1.7n/achrV 3,635,917C. elegans SRX-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46F14D2.5F14D2.5n/achrII 3,340,796
47F36H12.17F36H12.17n/achrIV 5,277,187
48C47E12.2C47E12.2n/achrIV 10,002,723contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
49D2013.3D2013.3n/achrII 9,318,488contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
50F13B9.6F13B9.6n/achrX 8,266,671contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)