UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1srw-115K12D9.40chrV 2,993,268C. elegans SRW-115 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
4F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
5C13A10.1C13A10.1n/achrII 1,353,185
6ugt-34F29F11.2n/achrV 10,655,665ugt-34 encodes a putative UDP-glucuronosyltransferase (UGT), belonging to a large nematode-specific expanded family of UGTs, that inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
7hlh-15C43H6.8n/achrX 2,413,123C. elegans HLH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
8C54D10.9C54D10.9n/achrV 12,448,057contains similarity to Interpro domain IPR001904 (Paxillin)
9his-10ZK131.4n/achrII 13,823,128his-10 encodes an H4 histone.
10F35F10.7F35F10.7n/achrV 3,286,914contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
11Y38F1A.8Y38F1A.8n/achrII 12,999,329contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Post-GPI attachment to proteins factor 2; ENSEMBL:ENSP00000300730
12tag-225K07C11.5n/achrV 8,202,146K07C11.5 is orthologous to the human gene SIMILAR TO TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE 3 (SORSBY FUNDUS DYSTROPHY, PSEUDOINFLAMMATORY) (TIMP3; OMIM:188826), which when mutated leads to disease.
13nhr-18F44C8.3n/achrV 2,228,092The nhr-18 gene encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain; the human homolog of nhr-18, CYP21, when mutated leads to congenital adrenal hyperplasia (OMIM:201910).
14F09C12.6F09C12.6n/achrII 5,117,137contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15btb-21F47C10.2n/achrV 3,850,930C. elegans BTB-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
16C35D10.5C35D10.5n/achrIII 4,862,879contains similarity to Pfam domain PF03981 Ubiquinol-cytochrome C chaperone contains similarity to Interpro domain IPR007129 (Ubiquinol-cytochrome C chaperone)
17C54A12.2C54A12.20.0000000001chrII 5,254,604contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18Y20C6A.1Y20C6A.1n/achrV 17,374,108This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
19srsx-18C04E6.2n/achrV 5,923,404C. elegans SRSX-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
20mxl-3F46G10.6n/achrX 13,350,149C. elegans MXL-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding), IPR002418 (Transcription regulator Myc)
21F35F10.5F35F10.5n/achrV 3,285,611
22sru-31C50C10.4n/achrV 9,817,248C. elegans SRU-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
23C11D2.1C11D2.1n/achrIV 6,191,401
24R10H1.1R10H1.1n/achrII 7,495,254contains similarity to Interpro domain IPR008374 (SF-assemblin)
25F35F10.6F35F10.6n/achrV 3,288,593contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
26F59F4.1F59F4.1n/achrX 15,836,220contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
27T22F7.4T22F7.4n/achrIII 526,147
28K07A9.3K07A9.3n/achrIV 1,835,383contains similarity to Interpro domain IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase)
29nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30F07G11.9F07G11.9n/achrV 7,317,554contains similarity to Pfam domains PF01476 (LysM domain) (12), PF05938 (Plant self-incompatibility protein S1) , PF00704 (Glycosyl hydrolases family 18) contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR010264 (Plant self-incompatibility S1), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR001579 (Glycoside hydrolase, chitinase active site), IPR002482 (Peptidoglycan-binding LysM), IPR001002 (Chitin-binding, type 1)
31T25D10.4T25D10.4n/achrII 6,408,988
32xtr-1F54F7.4n/achrX 11,852,038xtr-1 encodes a protein with similarity to TRA-2A and TRA-2B in a region known as the MX region, hypothesized to be a protein-protein interaction domain involved in negatively regulating tra-2 activity in the germ line.
33Y2H9A.4Y2H9A.4n/achrV 13,447,397contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR007883 (Protein of unknown function DUF713), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
34ZK593.3ZK593.3n/achrIV 10,917,060contains similarity to Bacillus cereus YndE protein (Spore germination protein BB).; TR:Q9K337
35F38A1.9F38A1.9n/achrIV 1,244,866
36col-44F54B11.2n/achrX 13,591,900col-44 encodes a cuticle collagen.
37C02F12.5C02F12.5n/achrX 3,671,203C02F12.5 encodes a putatively secreted protein with a Kunitz/bovine pancreatic trypsin inhibitor domain; C02F12.5 has no obvious function in mass RNAi assays.
38lov-1ZK945.9n/achrII 10,115,543lov-1 encodes an ortholog of human PKD1 (OMIM:601313; mutated in autosomal dominant polycystic kidney disease) that is expressed in the ciliated sensory endings of three types of male-specific neurons and that is required for two aspects of male mating behavior: response to hermaphrodite contact and vulva location; LOV-1 acts with PKD-2; EGL-44 and EGL-46 regulate cell-specific expression of lov-1 and pkd-2 to specify the behavioral function of the HOB neuron; in vitro, LOV-1 interacts, via its conserved PLAT domain, with the N-terminus of ATP-2, the beta subunit of ATP synthase that also localizes to cilia, suggesting that ATP synthase may play a role in C. elegans polycystin signaling.
39F18G5.1F18G5.1n/achrX 9,260,392
40T28C6.8T28C6.8n/achrIV 8,830,136contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
41col-51T28F2.8n/achrI 3,654,613col-51 encodes a cuticle collagen.
42his-14ZK131.8n/achrII 13,819,690his-14 encodes an H4 histone.
43K07D4.5K07D4.5n/achrII 4,022,169
44K02E2.7K02E2.7n/achrV 20,380,450contains similarity to Homo sapiens RB1-inducible coiled-coil protein 1; ENSEMBL:ENSP00000025008
45F45E1.4F45E1.4n/achrX 7,986,049
46try-2C07G1.1n/achrIV 8,213,133try-2 encodes a homolog of human TRYP1 and ELA2; mutation of human TRYP1 or ELA2 leads, respectively, to hereditary pancreatitis (OMIM:276000) or cyclic haematopoiesis (OMIM:162800).
47his-26ZK131.1n/achrII 13,825,596his-26 encodes an H4 histone.
48F54D12.5F54D12.5n/achrII 1,370,835contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
49F21C10.4F21C10.4n/achrV 9,127,111contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
50srx-66K07C6.9n/achrV 3,920,192C. elegans SRX-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)