UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K12B6.4K12B6.42e-104chrV 6,280,741
2gpc-1K02A4.2n/achrX 12,881,921The gpc-1 gene encodes a heterotrimeric guanine nucleotide-binding protein gamma subunit, expressed specifically in sensory neurons, that is involved in taste adaptation.
3zig-5Y48A6A.1n/achrIII 10,952,247zig-5 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-5::gfp reporter fusion is expressed in a number of neurons, including PVT, VD1-13, RID, AFD, ASK, RIV, RIB, PVQ, DVA, and RIS; zig-5::gfp is detected in the PVT neuron beginning at the three-fold stage of embryogenesis and continuing throughout larval development; loss of zig-5 activity in large-scale RNAi screens has been reported to result in low levels of embryonic lethality.
4tsp-1C02F5.8n/achrIII 8,238,638C. elegans TSP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
5C47D2.1C47D2.1n/achrX 8,215,243
6srbc-14T05E12.2n/achrV 17,071,071C. elegans SRBC-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7F43G9.5F43G9.5n/achrI 8,615,863F43G9.5 encodes a NUDIX hydrolase that that inhibits DHC-1 in vivo, and is a (perhaps evolutionarily conserved) target of transcriptional activation by DAF-16; F43G9.5(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that F43G9.5 negatively regulates dynein; while loss of F43G9.5 function has no obvious effect on lifespan, dauer formation, or fat storage, F43G9.5 is required for embryonic development, fertility, and general health in mass RNAi assays.
8arl-3F19H8.3n/achrII 14,607,534arl-3 encodes a member of the ARL (ADP-ribosylation factor(ARF)-like) family of proteins which are very similar to ARF proteins but lack the ability to stimulate ADP ribosylation by cholera toxin; as loss of arl-3 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of ARL-3 is not yet known.
9C55A1.6C55A1.6n/achrV 15,648,434contains similarity to Lactococcus lactis Protein maturation protein.; TR:Q9CEV9
10F53E10.4F53E10.4n/achrV 2,593,813
11F58E6.1F58E6.1n/achrV 9,742,698n/a
12F10F2.4F10F2.4n/achrIII 4,624,572contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
13Y42A5A.4Y42A5A.4n/achrV 11,106,364contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14C54G4.5C54G4.5n/achrI 7,996,207
15F39G3.4F39G3.4n/achrV 4,725,680contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
16C54C6.5C54C6.5n/achrIII 3,549,652contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_4440.; TR:Q98QC2
17F22B7.3F22B7.3n/achrIII 8,649,167
18T25B6.4T25B6.4n/achrX 9,016,157
19nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
20ZK353.4ZK353.4n/achrIII 8,388,992contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Uncharacterized serine/threonine-rich protein PB15E9.01c precursor.; SW:Q8TFG9
21Y43F8A.1Y43F8A.1n/achrV 19,370,930contains similarity to Rhizobium sp Probable conjugal transfer protein trbD.; SW:TRBD_RHISN
22clec-139F35D11.10n/achrII 4,620,939C. elegans CLEC-139 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
23T24C4.4T24C4.4n/achrIII 873,063contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR008368 (Voltage-dependent calcium channel, gamma subunit), IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
24F07G11.7F07G11.7n/achrV 7,303,485contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
25T26E4.3T26E4.3n/achrV 15,783,606contains similarity to Pfam domain PF01531 (Glycosyl transferase family 11)
26T21C9.11T21C9.11n/achrV 10,594,469contains similarity to Homo sapiens Popeye domain containing protein 3; ENSEMBL:ENSP00000254765
27F41D3.8F41D3.8n/achrI 12,267,803contains similarity to Pfam domain PF01697 (Domain of unknown function)
28C33A12.4C33A12.4n/achrIV 9,510,301contains similarity to Homo sapiens Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E; ENSEMBL:ENSP00000324074
29F36D4.4F36D4.4n/achrV 9,404,118contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
30F58B4.4F58B4.4n/achrV 10,931,009contains similarity to Plasmodium yoelii Rhoptry protein.; TR:Q26216
31glb-27W01C9.5n/achrII 8,548,030glb-27 encodes a globin whose expression is probably induced by anoxia in a HIF-1-dependent manner; glb-27 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-27 has no obvious function in mass RNAi assays.
32xbx-3M04D8.6n/achrIII 10,036,315C. elegans XBX-3 protein ;
33W04A4.3W04A4.3n/achrI 13,680,877contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
34F47B10.8F47B10.8n/achrX 10,905,841contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
35R10H10.4R10H10.4n/achrIV 10,394,780contains similarity to Arabidopsis thaliana T15B16.1 protein.; TR:Q9ZSH8
36C39D10.2C39D10.2n/achrX 7,889,123
37ZC239.3ZC239.3n/achrII 3,216,335contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
38fipr-22C37A5.2n/achrI 14,155,893C. elegans FIPR-22 protein ; contains similarity to Homo sapiens Keratin-associated protein 20-2; ENSEMBL:ENSP00000330746
39F52E1.8F52E1.8n/achrV 8,393,368contains similarity to Pfam domains PF00300 (Phosphoglycerate mutase family) , PF00328 (Histidine acid phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR000560 (Histidine acid phosphatase), IPR013078 (Phosphoglycerate mutase)
40R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
41ZK1248.1ZK1248.1n/achrII 5,843,377ZK1248.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; ZK1248.1 has no clear orthologs in other organisms.
42F32H2.6F32H2.6n/achrI 8,999,077contains similarity to Pfam domain PF00109 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR000794 (Beta-ketoacyl synthase), IPR014030 (Beta-ketoacyl synthase, N-terminal), IPR016039 (Thiolase-like)
43F28H7.4F28H7.4n/achrV 10,746,917contains similarity to Interpro domain IPR011893 (SelT/selW/selH selenoprotein)
44ZK697.3ZK697.3n/achrV 1,729,883contains similarity to Interpro domain IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
45gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
46ubc-22C06E2.7n/achrX 8,868,414ubc-22 encodes an E2 ubiquitin-conjugating enzyme orthologous to Saccharomyces cerevisiae UBC8 and human UBC1/HIP2 (Huntingtin interacting protein 2, OMIM:602846) which are involved in regulating fructose-1,6-bisphosphatase and huntingtin catabolism, respectively; by homology, UBC-22 is likely required for covalent attachment of ubiquitin to select target proteins to facilitate their degradation; however, as loss of UBC-22 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of UBC-22 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
47sol-1C15A11.3n/achrI 7,392,485C. elegans SOL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
48T26G10.5T26G10.5n/achrIII 9,426,015contains similarity to Streptococcus pyogenes Hypothetical protein SPy0952.; TR:Q9A032
49Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
50F14D7.8F14D7.8n/achrV 14,312,353contains similarity to Staphylococcus epidermidis Conserved hypothetical protein.; TR:Q8CSE5