UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K10G9.2K10G9.21.0000000000000001e-106chrIII 10,287,161contains similarity to Homo sapiens Similar to Suppressor protein SRP40; VG:OTTHUMP00000170311
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3srx-74F41F3.6n/achrV 4,660,713C. elegans SRX-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
4srw-140C03A7.3n/achrV 5,166,467C. elegans SRW-140 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
5egl-10F28C1.2n/achrV 12,459,067egl-10 encodes an RGS protein, expressed in neurons, that affects egg laying and negatively regulates GOA-1 (Galpha[o]) signalling; it requires the Gbeta(5) ortholog GPB-2 for this activity, and genetically interacts with the egl-30 and goa-1 signaling pathways.
6C32H11.4C32H11.4n/achrIV 12,922,267contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
7F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
8sra-30Y40H7A.6n/achrIV 15,197,622C. elegans SRA-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
9lgc-55Y113G7A.5n/achrV 20,025,213C. elegans LGC-55 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
10F55B12.2F55B12.2n/achrV 13,816,154contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
11T28F12.1T28F12.1n/achrV 4,514,448
12nhr-149C03G6.12n/achrV 7,349,121C. elegans NHR-149 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13acr-7T09A5.3n/achrII 7,847,659acr-7 encodes an alpha-7-like homomer-forming subunit of the nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) superfamily which encode ligand-gated ion channels that regulate fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; ACR-7 is expressed pharyngeal muscle and in tail neurons distal to the anus, and is a member of the ACR-16-like group of nAChR subunits.
14str-4C50B6.10n/achrV 13,338,836C. elegans STR-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15srd-15C04E6.10n/achrV 5,905,617C. elegans SRD-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16nep-2T05A8.4n/achrII 2,721,578T05A8.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while T05A8.4 is an ortholog of mammalian neutral endopeptidase (NEP), expressed on the brush-border membranes of kidney; more generally, T05A8.4 falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
17sre-14C42C1.1n/achrIV 12,260,640C. elegans SRE-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
18ttr-13Y44A6B.4n/achrV 20,631,647C. elegans TTR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
19W03C9.1W03C9.1n/achrII 11,961,452contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
20F07G6.2F07G6.2n/achrX 1,728,163
21F47G3.1F47G3.1n/achrX 2,389,225
22C06C6.1C06C6.1n/achrV 16,011,384contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR010916 (TonB box, conserved site)
23srd-30F07C4.5n/achrV 7,630,532C. elegans SRD-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24ZK384.3ZK384.3n/achrV 18,730,891contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR001461 (Peptidase A1)
25str-140C09H5.3n/achrV 8,066,820C. elegans STR-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26gcy-37C54E4.3n/achrIV 2,154,905gcy-37 encodes a predicted soluble guanylyl cyclase that is expressed in four candidate sensory neurons connected to the pseudocoelom, URXL, URXR, AQR, and PQR; as loss of gcy-37 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-37 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; GCY-37 expression in neurons connected to the pseudocoelom suggests, however, that GCY-37 may play a role in fluid homeostasis.
27F38E11.4F38E11.4n/achrIV 9,455,287contains similarity to Pfam domains PF00100 (Zona pellucida-like domain) , PF00024 (PAN domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
28F28H6.2F28H6.2n/achrX 14,142,630contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
29C14A6.5C14A6.5n/achrV 18,164,125contains similarity to Arabidopsis thaliana Calreticulin 2 precursor.; SW:CRT2_ARATH
30ZK1240.8ZK1240.8n/achrII 2,328,024contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
31BE10.4BE10.4n/achrIII 12,815,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
32Y37H9A.3Y37H9A.3n/achrI 13,785,519contains similarity to Interpro domains IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR006608 (Protein of unknown function DM14), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
33Y7A5A.2Y7A5A.2n/achrX 15,772,148contains similarity to Aquifex aeolicus Hypothetical protein AQ_372.; SW:Y372_AQUAE
34bbs-9C48B6.8n/achrI 6,920,270C. elegans BBS-9 protein ; contains similarity to Homo sapiens 95 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000346214
35lgc-38F11H8.2n/achrIII 7,014,295F11H8.2 encodes an UNC-49-like GABA receptor subunit.
36glr-3K10D3.1n/achrI 7,119,675glr-3 encodes a protein that contains a ligand-gated ion channel domain and a receptor family ligand binding domain with similarity to kainate-selective ionotropic glutamate receptor 2 (human GRIK2); expressed in the RIA neuron.
37C25B8.5C25B8.5n/achrX 6,633,438contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38srb-2C27D6.9n/achrII 5,168,699C. elegans SRB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
39T16G12.4T16G12.4n/achrIII 10,058,154contains similarity to Treponema denticola FlhB.; TR:Q9APY7
40F41E7.6F41E7.6n/achrX 10,308,733contains similarity to Pfam domain PF00755 Choline/Carnitine o-acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR000542 (Acyltransferase ChoActase/COT/CPT)
41C32H11.1C32H11.1n/achrIV 12,913,842contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
42C06B3.7C06B3.7n/achrV 13,910,615contains similarity to Streptococcus agalactiae Tn5252, relaxase.; TR:Q8DZ67
43nhr-167C49F5.4n/achrX 11,981,020C. elegans NHR-167 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44Y81G3A.4Y81G3A.4n/achrII 13,092,774contains similarity to Guillardia theta 60S acidic ribosomal protein P0.; TR:Q98S65
45fbxa-71T20H9.3n/achrIII 2,256,678C. elegans FBXA-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
46gcy-23T26C12.4n/achrIV 3,286,107gcy-23 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-18, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-23 functions redundantly with gcy-8 and gcy-18, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, loss of gcy-23 activity via RNAi results in lifespan extension; GCY-23 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
47F43G6.7F43G6.7n/achrII 11,811,141contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003980 (Histamine H3 receptor)
48glb-11C36E8.2n/achrIII 3,990,752glb-11 encodes a globin; glb-11 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-11 has no obvious function in mass RNAi assays; glb-11 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background.
49C50B8.5C50B8.5n/achrV 13,582,800contains similarity to Candida albicans Hypothetical membrane protein.; TR:O94057
50F16G10.13F16G10.13n/achrII 2,395,441contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)