UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K10G4.5K10G4.50chrV 17,299,907contains similarity to Pfam domains PF00621 (RhoGEF domain) , PF00169 (PH domain) contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR015721 (Rho GTP exchange factor)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3D2024.2D2024.2n/achrIV 7,244,813contains similarity to Mus musculus Probable arylformamidase (EC 3.5.1.9) (Kynurenine formamidase) (KF).; SW:Q8K4H1
4sri-62F34D6.5n/achrII 2,697,708C. elegans SRI-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000484 (Photosynthetic reaction centre, L and M subunits)
5F19G12.4F19G12.4n/achrX 1,417,386
6Y39F10A.1Y39F10A.1n/achrII 776,047
7Y45F10D.4Y45F10D.4n/achrIV 13,784,287Y45F10D.4 encodes a putative iron-sulfur cluster assembly enzyme that is required for embryonic and larval viability, and that is orthologous to human NIFUN and budding yeast ISU1 and ISU2; Y45F10D.4 expression levels are unusually stable, with relatively little variation between adults, dauers, and L3 larvae, or between wild-type and daf-2(e1370ts) or daf-16(m26) mutant adults; by orthology with yeast ISU1, Y45F10D.4 is predicted to bind FRH-1.
8T16G1.5T16G1.5n/achrV 12,938,559contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
9str-185R08C7.7n/achrIV 4,428,740C. elegans STR-185 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10F02H6.7F02H6.7n/achrIV 14,227,256contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
11clec-44R07C3.12n/achrII 921,144C. elegans CLEC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
13K09H9.1K09H9.1n/achrI 3,154,202contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
14srw-31K03D7.2n/achrV 17,507,514C. elegans SRW-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15M02F4.2M02F4.2n/achrX 3,033,806
16tag-151F10G7.1n/achrII 4,711,891C. elegans TAG-151 protein; contains similarity to Pfam domains PF08142 (AARP2CN (NUC121) domain) , PF04950 (Protein of unknown function (DUF663)) contains similarity to Interpro domains IPR012948 (AARP2CN), IPR007034 (Protein of unknown function DUF663)
17twk-34K06B4.12n/achrV 15,707,216C. elegans TWK-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
18ptr-8F44F4.4n/achrII 10,891,194ptr-8 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-8 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; PTR-8 is also required for normal growth to full size and locomotion; PTR-8 is expressed in hypodermis.
19F56H6.2F56H6.2n/achrI 12,288,243contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
20F59B2.13F59B2.13n/achrIII 9,025,413contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
22str-119C13B7.5n/achrV 2,427,301C. elegans STR-119 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23F17C11.6F17C11.6n/achrV 10,955,512contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9ZT77
24K08B4.5K08B4.5n/achrIV 6,087,860contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001019 (Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit)
25fip-4F41E6.10n/achrV 8,611,069C. elegans FIP-4 protein
26scl-27ZK6.3n/achrV 400,930C. elegans SCL-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
27K02E10.5K02E10.5n/achrX 2,477,930
28dgk-5K06A1.6n/achrII 6,462,041dgk-5 encodes a putative diacylglycerol kinase, orthologous to Drosophila RDGA, and to human DGKI (OMIM:604072) and DGKZ (OMIM:601441); DGK-5 has no obvious function in mass RNAi assays.
29egl-36R07A4.1n/achrX 10,739,267egl-36 encodes a Shaw-type voltage-gated potassium channel that regulates egg laying and defecation; expression of egl-36::gfp reporters is observed in several different cell types including muscle cells such as the uterine and vulval egg-laying muscles, sensory, motor and interneurons, and the distal tip cells of the gonad; when expressed in a heterologous system, EGL-36 exhibits channel activity.
30AH9.4AH9.4n/achrX 2,272,675contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
31nas-33K04E7.3n/achrX 6,453,429C. elegans NAS-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
32K08B5.2K08B5.2n/achrX 16,552,470
33C27D6.1C27D6.1n/achrII 5,174,657contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
34srj-33T07C12.1n/achrV 9,936,513C. elegans SRJ-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35clec-140T05A7.2n/achrII 4,675,089C. elegans CLEC-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36glc-2F25F8.2n/achrI 4,886,565glc-2 encodes the beta subunit of a glutamate-gated chloride channel; in vivo, GLC-2 is capable of forming homomeric glutamate-activated channels, as well as heteromeric channels with GLC-1 that can be activated by glutamate and avermectins, antihelmintics that inhibit pharyngeal pumping; as loss of glc-2 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of GLC-2 in development and/or behavior is not yet known; however, GLC-2 expression is generally restricted to the pm4 pharyngeal muscles of larvae and adults, suggesting a role for GLC-2 in regulation of glutamatergic inhibition of pharyngeal pumping.
37T04F3.4T04F3.4n/achrV 11,762,441contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
38C39E6.2C39E6.2n/achrX 4,754,889
39R05D7.1R05D7.1n/achrI 12,162,955contains similarity to Kluyveromyces lodderae Truncated cytochrome oxidase subunit 2 (Fragment).; TR:Q7YG01
40C26E6.1C26E6.1n/achrIII 4,957,176contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
41K09F6.6K09F6.6n/achrII 2,277,012
42F44A2.3F44A2.3n/achrV 9,308,144contains similarity to Pfam domain PF02886 LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
43T23D8.3T23D8.3n/achrI 9,974,837T23D8.3 encodes an ortholog of yeast and human LTV1 that inhibits DHC-1 in vivo; in mass RNAi assays, T23D8.3 is required for embryonic and larval development, normally large brood sizes, and normally fast growth.
44C05C12.6C05C12.6n/achrIV 11,232,367contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
45F32D8.10F32D8.10n/achrV 10,907,944contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46B0457.2B0457.2n/achrII 8,925,501contains similarity to Homo sapiens Isoform 8 of Elastin precursor; ENSEMBL:ENSP00000369958
47F23D12.1F23D12.1n/achrX 14,425,936contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE1252.; TR:Q8XKZ0
48C56A3.4C56A3.4n/achrV 13,551,128contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
49C34B2.9C34B2.9n/achrI 10,701,670contains similarity to Interpro domain IPR001904 (Paxillin)
50srx-131F09F3.2n/achrV 13,846,060C. elegans SRX-131 protein ;