UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ani-2K10B2.50chrII 6,363,196ani-2 encodes one of three C. elegans anillins; ANI-2 activity is required in the syncytial gonad for proper gonad structure and oocyte formation; specifically, ANI-2 appears to be required for maintaining the structure of the rachis, the syncytial compartment of germline cytoplasm that connects developing ooctyes; in the adult gonad, ANI-2 localizes to the surface of the rachis.
2F49C5.5F49C5.5n/achrII 12,546,186
3C17H12.2C17H12.2n/achrIV 6,788,223contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG7289-PA;; FLYBASE:CG7289
4ZC168.3ZC168.3n/achrIV 10,733,704contains similarity to Homo sapiens Origin recognition complex subunit 5; ENSEMBL:ENSP00000297431
5D1044.6D1044.6n/achrIII 5,539,373contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
6cdk-5T27E9.3n/achrIII 13,465,418cdk-5 encodes a putative homolog of cyclin dependent kinase 5 that affects pronuclear migration and rotation in one-cell embryos and may affect neuronal development; expressed in neurons.
7ZC404.11ZC404.11n/achrV 6,803,107contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8F01G10.4F01G10.4n/achrIV 10,231,754contains similarity to Interpro domain IPR008376 (Synembryn)
9F37C12.2F37C12.2n/achrIII 7,182,949contains similarity to Pfam domain PF07264 Etoposide-induced protein 2.4 (EI24) contains similarity to Interpro domain IPR009890 (Etoposide-induced 2.4)
10F10E7.11F10E7.11n/achrII 7,121,124contains similarity to Pfam domain PF01448 ELM2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR000949 (ELM2)
11kbp-3F26H11.1n/achrII 14,389,558C. elegans KBP-3 protein ; contains similarity to Homo sapiens similar to Kinesin heavy chain isoform 5C; ENSEMBL:ENSP00000334176
12F25H9.6F25H9.6n/achrV 13,467,638contains similarity to Pfam domain PF02441 Flavoprotein contains similarity to Interpro domain IPR003382 (Flavoprotein)
13K02E7.3K02E7.3n/achrII 1,077,813contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
14gei-6C05C8.4n/achrV 7,228,595C. elegans GEI-6 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
15C41D11.1C41D11.1n/achrI 4,458,028
16F43D2.1F43D2.1n/achrV 14,613,051contains similarity to Pfam domain PF00134 Cyclin, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal), IPR015429 (Transcription regulator cyclin)
17T08D2.7T08D2.7n/achrX 186,625contains similarity to Pfam domains PF00069 (Protein kinase domain) , PF00498 (FHA domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000253 (Forkhead-associated)
18nex-3C28A5.3n/achrIII 4,443,071nex-3 encodes an annexin, a member of a family of calcium-dependent phospholipid binding proteins; by homology, NEX-3 could function in a number of processes, such as membrane fusion, cytoskeletal interactions, and intracellular signaling; however, as loss of nex-3 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of NEX-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
19mxl-2F40G9.11n/achrIII 187,571C. elegans MXL-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
20flp-22F39H2.1n/achrI 8,659,426C. elegans FLP-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family contains similarity to Interpro domain IPR001651 (Gastrin/cholecystokinin peptide hormone)
21his-74W05B10.1n/achrV 12,659,997C. elegans HIS-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF00125 Core histone H2A/H2B/H3/H4 contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core)
22T09A5.8T09A5.8n/achrII 7,856,638contains similarity to Pfam domain PF00385 'chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain contains similarity to Interpro domains IPR000953 (Chromo domain), IPR016197 (Chromo domain-like), IPR001525 (C-5 cytosine-specific DNA methylase)
23F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
24VF39H2L.1VF39H2L.1n/achrI 8,645,323contains similarity to Pfam domain PF05739 SNARE domain contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
25bath-27F14D2.1n/achrII 3,360,782C. elegans BATH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
26xbx-5T24A11.2n/achrIII 3,803,450C. elegans XBX-5 protein ;
27pqn-45F56F3.1n/achrIII 4,473,243The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
28W02D7.5W02D7.5n/achrV 8,298,506contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
29cpsf-2F09G2.4n/achrV 7,181,006C. elegans CPSF-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00753 (Metallo-beta-lactamase superfamily) , PF07521 (RNA-metabolising metallo-beta-lactamase) contains similarity to Interpro domains IPR011108 (RNA-metabolising metallo-beta-lactamase), IPR001279 (Beta-lactamase-like)
30gad-1T05H4.14n/achrV 6,432,396The gad-1 gene encodes a WD repeat-containing protein that is required maternally for gastrulation initiation during early embryogenesis by regulating the division timing, spindle orientation, and subsequent inward migration of the two gut precusor (E) cells at the 26-cell stage.
31M151.3M151.3n/achrII 3,629,023contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Girdin; ENSEMBL:ENSP00000263630
32daf-18T07A9.6n/achrIV 422,580daf-18 encodes a lipid phosphatase homologous to the human PTEN tumor suppresor (OMIM:601728, mutated in Cowden disease and several cancers); DAF-18 negatively regulates insulin-like signaling mediated by DAF-2/IR and AGE-1/PI3K and thus plays a role in metabolism, development, and longevity; based on sequence and genetic analysis, DAF-18 is predicted to dephosphorylate AGE-1-generated PIP3 in order to limit activation of the downstream AKT-1 and AKT-2 kinases that negatively regulate DAF-16.
33sra-14F35C5.2n/achrII 12,886,826C. elegans SRA-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
34R09E12.6R09E12.6n/achrV 767,566contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
35tag-348T04H1.1n/achrV 12,237,724C. elegans TAG-348 protein; contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
36F14H3.4F14H3.4n/achrV 16,054,667contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
37srh-244C03G6.9n/achrV 7,344,629C. elegans SRH-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38xpa-1K07G5.2n/achrI 7,160,236xpa-1 encodes an ortholog of human XPA, the xeroderma pigmentosum complementation group A protein (OMIM:278700, mutations are associated with sensitivity to ultraviolet light and carcinomata at an early age); by homology, XPA-1 is predicted to function as a DNA-binding protein that is required for nucleotide excision repair of damaged DNA; in C. elegans, loss of xpa-1 activity via mutation or RNA-mediated interference (RNAi) results in increased sensitivity to UV irradiation at all stages of development; xpa-1 mRNA is detected in eggs and mixed stage populations.
39M151.2M151.2n/achrII 3,632,782contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
40C02F4.5C02F4.5n/achrIV 10,523,762contains similarity to Rattus norvegicus Collagen type XXVII proalpha 1 chain.; TR:Q80ZF0
41ZC477.4ZC477.4n/achrIV 7,098,647
42coq-4T03F1.2n/achrI 3,869,644coq-4 encodes an ortholog of S. cerevisiae COQ4; while COQ-4 is conserved between eukaryotes and bacteria, its biochemical function is unknown; by orthology, COQ-4 is predicted to peripherally associate with the matrix face of the mitochondrial inner membrane, in a complex with COQ-3 (and perhaps COQ-6), and to be required to maintain a steady-state level of CLK-1/COQ-7 protein; COQ-4 is required for ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis and for normally short lifespan; coq-4(RNAi) animals have reduced levels of coenzyme Q9 and superoxide, and have abnormally long lifespans.
43clec-255F11D11.1n/achrV 18,770,210C. elegans CLEC-255 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013278 (Apoptosis regulator, Bcl-2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
44ZK858.1ZK858.1n/achrI 9,119,671contains similarity to Pfam domains PF03828 (Poly(A) polymerase) , PF01909 (Nucleotidyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002934 (Nucleotidyltransferase), IPR002058 (PAP/25A-associated)
45djr-1.1B0432.2n/achrII 291,212djr-1.1 encodes an ortholog of DJ-1 (OMIM:602533, mutated in early-onset Parkinson disease); DJR-1.1 is required for resistance to rotenone, a mitochondrial complex I inhibitors that mimics Parkinson disease (PD); djr-1.1(RNAi) animals are partly rescued from PD-like sensitivity by D-beta-hydroxybutyrate or tauroursodeoxycholic acid, and fully rescued by both; by orthology with DJ-1, DJR-1.1 may promote stability of the transcription factors SKN-1 or SKNR-1 (homologs of mammalian NFE2L2).
46hcp-3F58A4.3n/achrIII 9,615,787The hcp-3 gene encodes a centromere protein (CENP)-A homolog required for kinetochore function; inactivation of hcp-3 in one-cell embryos by RNAi causes a complete loss of kinetochores, with total failure of chromosomes to segregate properly during mitosis, to recruit components to the kinetochore other than HCP-3, or to assemble a stable mitotic spindle; in addition, HCP-4 fails to localize properly to the kinetochore in hcp-3(RNAi) embryos.
47M03F4.4M03F4.4n/achrX 4,957,667
48his-44F08G2.1n/achrII 13,826,823his-44 encodes an H2B histone.
49F22D3.5F22D3.5n/achrII 6,938,664
50osm-11F11C7.5n/achrX 17,420,817C. elegans OSM-11 protein ;