UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1set-12K09F5.50chrX 7,734,685set-12 encodes a putative histone H3 lysine-9 methyltransferase with no non-nematode orthologs; neither set-12(n4442) nor set-12(RNAi) have any obvious phenotypes.
2F13H6.4F13H6.4n/achrV 6,367,454contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
3Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4M03B6.4M03B6.4n/achrX 13,859,911contains similarity to Halobacterium sp Vng0659h.; TR:Q9HRK3
5Y54G11B.1Y54G11B.1n/achrII 14,460,174contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
6R10D12.15R10D12.15n/achrV 13,968,837contains similarity to Pfam domain PF00182 Chitinase class I contains similarity to Interpro domain IPR000726 (Glycoside hydrolase, family 19, catalytic)
7C03A3.3C03A3.3n/achrX 11,268,134contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
8K04C1.3K04C1.3n/achrX 14,242,549contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR001766 (Fork head transcription factor)
9T16D1.1T16D1.1n/achrII 5,241,424
10Y57A10C.8Y57A10C.8n/achrII 12,428,881contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002355 (Multicopper oxidase, copper-binding site)
11ZK896.9ZK896.9n/achrIV 12,857,434ZK896.9 encodes a putative transporter of UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) and UDP-N-acetylgalactosamine (UDP-GalNAc), orthologous to human SLC35A3 (OMIM:605632) and paralogous to C03H5.2 and SRF-3; ZK896.9 has no obvious function in RNAi assays, but this could reflect genetic redundancy with its paralogs.
12R57.2R57.2n/achrX 298,212contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
13his-45B0035.10n/achrIV 11,326,794his-45 encodes an H3 histone.
14srh-69T21B4.7n/achrII 12,514,088C. elegans SRH-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15srsx-12C13D9.5n/achrV 4,980,446C. elegans SRSX-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16srh-23C02E7.5n/achrV 4,921,905C. elegans SRH-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17C08H9.6C08H9.6n/achrII 9,873,847contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
18hlh-25C17C3.7n/achrII 5,535,400C. elegans HLH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
19K02E10.6K02E10.6n/achrX 2,481,834contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
20T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
21fbxb-9C08F8.5n/achrIV 11,161,021This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
22nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23K02E7.11K02E7.11n/achrII 1,075,134
24F34D10.3F34D10.3n/achrIII 3,734,527contains similarity to Interpro domain IPR004061 (Sphingosine 1-phosphate receptor)
25srh-219C06B8.6n/achrV 15,496,906C. elegans SRH-219 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27F27E11.1F27E11.1n/achrV 3,464,980contains similarity to Pfam domains PF01773 (Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus) , PF07670 (Nucleoside recognition) , PF07662 (Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR008276 (Concentrative nucleoside transporter), IPR002668 (Na+ dependent nucleoside transporter), IPR011657 (Na+ dependent nucleoside transporter, C-terminal), IPR011642 (Nucleoside recognition)
28T15B7.12T15B7.12n/achrV 6,818,884contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29nhr-162C33G8.10n/achrV 6,991,040C. elegans NHR-162 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30srbc-81Y45G12C.8n/achrV 2,523,361C. elegans SRBC-81 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
31R07C3.6R07C3.6n/achrII 924,524
32Y116A8C.15Y116A8C.15n/achrIV 16,996,337contains similarity to Homo sapiens similar to KIAA1357 protein; ENSEMBL:ENSP00000258005
33tsg-101C09G12.9n/achrIV 3,512,510C09G12.9 encodes the C. elegans ortholog of S. cerevisiae vacuolar protein sorting protein Vps23p and human TUMOR SUSCEPTIBILITY GENE 101 (TSG101; OMIM:601387), mutations in which are associated with several types of cancer and with varying responses to HIV infection; the product of C09G12.9 is predicted to be a component of C. elegans ESCRT-1 (Endosomal Sorting Complex Required for Transport), and RNAi experiments indicate that its activity is essential for embryonic and larval development.
34K01A11.1K01A11.1n/achrIII 3,429,872contains similarity to Dictyostelium discoideum PAXILLIN-like protein.; TR:Q8MML5
35C14A6.8C14A6.8n/achrV 18,170,317contains similarity to Gallus gallus Cellular tumor antigen p53 (Tumor suppressor p53).; SW:P53_CHICK
36D1086.1D1086.1n/achrV 14,099,606contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
37fbxb-44K05F6.5n/achrII 1,539,392K05F6.5 encodes an unusual paraoxonase-like protein with an N-terminal F-box domain; it is homologous to the human PARAOXONASE 1 gene (PON1, OMIM:168820), which in some allelic forms is associated with susceptibility to coronary artery disease.
38cut-5R07E3.3n/achrX 10,336,033C. elegans CUT-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
39cyp-34A4T09H2.1n/achrV 3,950,999C. elegans CYP-34A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
40Y39A1A.7Y39A1A.7n/achrIII 10,619,501contains similarity to Sus scrofa Lymphocyte antigen 64-like protein.; TR:Q7YRL4
41srsx-1F40D4.5n/achrV 17,177,360C. elegans SRSX-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
42C06E4.1C06E4.1n/achrIV 7,283,548
43fpn-1.3R08F11.6n/achrV 3,796,213C. elegans FPN-1.3 protein; contains similarity to Pfam domain PF06963 Ferroportin1 (FPN1) contains similarity to Interpro domains IPR009716 (Ferroportin1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44F19F10.5F19F10.5n/achrV 7,558,466contains similarity to Pfam domain PF00178 Ets-domain contains similarity to Interpro domains IPR000418 (Ets), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding)
45nhr-213T06C12.13n/achrV 15,895,604C. elegans NHR-213 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
46abf-3F54B8.5n/achrV 15,817,602abf-3 encodes a homolog of the antibacterial factor ASABF from Ascaris suum; ABF-3 may play a role in innate immunity, though at present the only evidence for its having an antimicrobial humoral function is its sequence similarity.
47ZC373.5ZC373.5n/achrX 10,073,415contains similarity to Pfam domain PF00596 Class II Aldolase and Adducin N-terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR001303 (Class II aldolase/adducin, N-terminal)
48C37E2.3C37E2.3n/achrX 14,180,268contains similarity to Pfam domain PF04750 FAR-17a/AIG1-like protein contains similarity to Interpro domains IPR006838 (FAR-17a/AIG1-like protein), IPR002208 (SecY protein)
49F47B7.6F47B7.6n/achrX 3,770,172
50Y76A2B.2Y76A2B.2n/achrIII 13,533,575contains similarity to Homo sapiens Reticulon-4 receptor precursor; ENSEMBL:ENSP00000043402