UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1cyp-14A1K09A11.20chrX 13,266,131C. elegans CYP-14A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
2T23F6.1T23F6.1n/achrIV 12,720,397contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
3C08F11.7C08F11.7n/achrIV 13,637,874contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domains IPR006570 (SPK), IPR002398 (Peptidase C14, caspase precursor p45)
4H06O01.2H06O01.2n/achrI 7,012,174H06O01.2 encodes a large (1,461-aa) putative chromodomain helicase DNA-binding protein that inhibits DHC-1 in vivo; H06O01.2 is orthologous to budding yeast CHD1, human CHD1 (OMIM:602118), and human CHD2 (OMIM:602119); H06O01.2(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that H06O01.2 negatively regulates dynein; H06O01.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
5K09F6.7K09F6.7n/achrII 2,291,523contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
6T20G5.10T20G5.10n/achrIII 10,211,438contains similarity to Pfam domain PF06320 GCN5-like protein 1 (GCN5L1) contains similarity to Interpro domain IPR009395 (GCN5-like 1)
7Y38H6A.1Y38H6A.1n/achrV 20,322,280contains similarity to Trypanosoma brucei brucei Histone H1.; TR:Q9N6S6
8srh-25C54D10.6n/achrV 12,433,068C. elegans SRH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9F16H6.4F16H6.4n/achrV 18,199,789contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
10srj-39F38H12.1n/achrV 4,105,406C. elegans SRJ-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11C18B10.6C18B10.6n/achrV 7,480,150contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
12T05E11.6T05E11.6n/achrIV 11,109,297contains similarity to Pfam domain PF01650 Peptidase C13 family contains similarity to Interpro domain IPR001096 (Peptidase C13, legumain)
13C42C1.6C42C1.6n/achrIV 12,294,581contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG16970-PA; FLYBASE:CG16970-PA
14F32H2.8F32H2.8n/achrI 8,992,131contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domains IPR004988 (Protein of unknown function DUF273), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
15T07G12.2T07G12.2n/achrIV 10,531,796contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
16C02F12.8C02F12.8n/achrX 3,691,690contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
17F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
18M01G12.14M01G12.14n/achrI 12,107,675contains similarity to Rhizobium meliloti Putative transposase of insertion sequence ISRM19 protein (Putativestransposase for insertion sequence ISRM19).; TR:Q925Y0
19C34F6.6C34F6.6n/achrX 11,207,733contains similarity to Pisum sativum 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase (EC 2.5.1.55) (Phospho-2-sdehydro-3-deoxyoctonate aldolase) (3-deoxy-D-manno-octulosonic acid 8-sphosphate synthetase) (KDO-8-phosphate synthetase) (KDO 8-P synthase)s(KDOPS).; SW:KDSA_PEA
20Y62H9A.1Y62H9A.1n/achrX 11,876,371contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21R12E2.6R12E2.6n/achrI 4,151,478contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
22F36H12.16F36H12.16n/achrIV 5,270,623
23K02F6.7K02F6.7n/achrII 2,527,240
24C17B7.5C17B7.5n/achrV 3,336,321contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
25nhr-164C41G6.5n/achrV 15,234,803C. elegans NHR-164 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26str-60T06C12.1n/achrV 15,898,679C. elegans STR-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27cyp-35D1F14H3.101e-48chrV 16,070,230C. elegans CYP-35D1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR005837 (Flagellar transport protein FliP)
28str-90F58G4.2n/achrV 8,105,065C. elegans STR-90 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29K06H6.2K06H6.2n/achrV 586,550contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
30M01G12.2M01G12.2n/achrI 12,133,121contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
31sri-27ZK697.4n/achrV 1,726,643C. elegans SRI-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32mab-21F35G12.6n/achrIII 4,601,861mab-21 encodes a novel protein that is a member of a highly conserved family of proteins with Drosophila and vertebrate orthologs; MAB-21 is cell-autonomously required for specifying the identity of sensory ray 6 in the male tail, and also for backward locomotion, normal body morphology, fecundity, and embryonic morphogenesis; MAB-21 expression begins in embryonic hypodermal cells and continues in larval and adult animals in hypodermis, anterior and ventral cord neurons, some body wall muscles, and ray cells.
33F58F6.6F58F6.6n/achrIV 1,342,037contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domain IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
34C26G2.2C26G2.2n/achrX 14,668,263contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG31439-PA;; FLYBASE:CG31439
35srv-29T13A10.6n/achrIV 6,265,730C. elegans SRV-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36C15H9.3C15H9.3n/achrX 6,116,887contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37gpa-15M04C7.1n/achrI 8,533,150gpa-15 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADL, ASH, ASK, PHA, PHB, the distal tip cell, the anchor cell, and many male-specific neurons.
38srh-186F36G9.2n/achrV 15,956,387C. elegans SRH-186 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39C18H9.1C18H9.1n/achrII 6,699,771
40C02D5.1C02D5.1n/achrIII 8,561,987contains similarity to Pfam domains PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
41F49H6.12F49H6.12n/achrV 17,021,153contains similarity to Phasianus colchicus Gag polyprotein (Fragment).; TR:Q9I9T0
42srh-213T22F3.5n/achrV 3,593,857C. elegans SRH-213 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43marc-6F55A3.1n/achrI 10,803,251C. elegans MARC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
44bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
45T21C9.9T21C9.9n/achrV 10,591,537contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
46T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
47F59E11.6F59E11.6n/achrV 8,992,414contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
48C50H11.8C50H11.8n/achrV 3,055,230
49C40H5.3C40H5.3n/achrX 11,760,088contains similarity to Solanum aggregatum NADH dehydrogenase subunit (Fragment).; TR:Q8HSG2
50srz-42H12I19.1n/achrIV 14,130,194C. elegans SRZ-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)