UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K08F9.3K08F9.32e-135chrV 15,143,291contains similarity to Pfam domains PF00168 (C2 domain) (3), PF08165 (FerA (NUC095) domain) , PF08150 (FerB (NUC096) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012561 (FerB), IPR006614 (Dysferlin, C-terminal), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR012560 (FerA), IPR006613 (Dysferlin, N-terminal), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
2C54G6.2C54G6.2n/achrI 1,007,329The C54G6.2 gene encodes a homolog of human RP2, which when mutated leads to X-linked retinitis pigmentosa 2 (OMIM:312600).
3bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
4cav-2C56A3.7n/achrV 13,558,462cav-2 encodes one of two C. elegans proteins related to caveolins, integral transmembrane proteins that are believed to function in regulation of signal transduction and that are the major component of caveolae, specialized lipid rafts found in the plasma membrane of most cell types; as loss of cav-2 function via large-scale RNA-mediated interference (RNAi) screens does not result in any obvious abnormalities, the role of cav-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; cav-2 mRNA is expressed in eggs and mixed stage populations.
5sre-45F54F11.3n/achrII 13,520,326C. elegans SRE-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
6Y69H2.2Y69H2.2n/achrV 18,632,391contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (5), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) , PF07974 (EGF-like domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
7sru-24F31F4.13n/achrV 669,671C. elegans SRU-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
8srz-15C32H11.2n/achrIV 12,916,637C. elegans SRZ-15 protein ;
9M60.6M60.6n/achrX 8,250,273
10M163.5M163.5n/achrX 14,475,017contains similarity to Interpro domain IPR008995 ()
11F14F8.8F14F8.8n/achrV 16,671,873contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, degrades cell wall from the daughter side causing daughter to separate from mother; expression is repressed by cAMP; SGD:YHR143W
12dod-22F55G11.5n/achrIV 12,966,321C. elegans DOD-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
13K02E10.5K02E10.5n/achrX 2,477,930
14C39F7.1C39F7.1n/achrV 1,261,350
15T05B4.4T05B4.4n/achrV 4,128,560
16clec-177E03H12.2n/achrIV 4,987,125C. elegans CLEC-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
17W09H1.3W09H1.3n/achrII 13,184,626contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ31139 fis, clone IMR322001185; ENSEMBL:ENSP00000380962
18glb-2C06E4.7n/achrIV 7,262,720glb-2 encodes a globin; glb-2 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-2 has no obvious function in mass RNAi assays.
19ZK1067.4ZK1067.4n/achrII 9,211,645ZK1067.4 is orthologous to the human gene PROTEOLIPID PROTEIN 1 (PLP1; OMIM:300401), encoding the primary constituent of myelin, which when mutated leads to Pelizaeus-Merzbacher disease (OMIM:312080).
20D2023.3D2023.3n/achrV 11,804,015contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
21F16H11.2F16H11.2n/achrX 4,662,854contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q23LR2
22C28F5.4C28F5.4n/achrII 7,521,547contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
23glb-4C09H10.8n/achrII 11,110,315glb-4 encodes a globin; glb-4 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-4 is required for embryonic viability, fertility, vulval development, and normal distal tip cell migration in mass RNAi assays.
24K08B5.2K08B5.2n/achrX 16,552,470
25C01A2.4C01A2.4n/achrI 13,393,035contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
26C27F2.1C27F2.1n/achrIII 4,989,295contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
27str-68Y73C8C.6n/achrV 3,106,888C. elegans STR-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28F39F10.2F39F10.2n/achrX 16,895,317contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
29F07E5.9F07E5.9n/achrII 2,077,849contains similarity to Interpro domain IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
30C38D9.5C38D9.5n/achrV 17,589,380contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
31C53A5.11C53A5.11n/achrV 14,563,580contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF07646 (Kelch motif) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
32str-144C09H5.5n/achrV 8,071,381C. elegans STR-144 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33K04H4.5K04H4.5n/achrIII 9,360,700contains similarity to Yaba monkey tumor virus Yb-L1L protein.; TR:Q9QBC3
34Y39A3A.3Y39A3A.3n/achrIII 2,067,514contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
35srbc-19C45H4.16n/achrV 2,165,802C. elegans SRBC-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002208 (SecY protein)
36T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
37gst-18F37B1.7n/achrII 13,630,251C. elegans GST-18 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
38gpa-6F48C11.1n/achrX 13,192,522gpa-6 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases that affects response to water-soluble odorants; it is expressed in AWA amphid neurons, the PHB sensory cell, and (at low levels) in ASI amphid neurons.
39coq-1C24A11.9n/achrI 5,414,239coq-1 encodes a putative hexaprenyl pyrophosphate synthetase, orthologous to S. cerevisiae COQ1; COQ-1 is required for ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis and for normally short lifespan; coq-1 mutants have slowed pharyngeal pumping, and eventually arrest as paralysed larvae before dying; coq-1(RNAi) animals have reduced levels of coenzyme Q9 and superoxide, and have abnormally long lifespans; coq-1 mutants are not rescued by dietary coenzyme Q.
40nhr-227T27B7.5n/achrV 2,286,399C. elegans NHR-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
41C46A5.1C46A5.1n/achrIV 7,765,495contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
42F49E12.8F49E12.8n/achrII 8,393,450contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0335; TR:O15044
43F56D2.5F56D2.5n/achrIII 5,579,782contains similarity to Pfam domains PF05773 (RWD domain) , PF01485 (IBR domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
44ikb-1C04F12.3n/achrI 9,687,053ikb-1 encodes an ortholog of human BCL3 (OMIM:109560) that physically interacts with the checkpoint protein MRT-2; ikb-1(nr2019) and ikb-1(nr2027) mutants display no obvious phenotype other than shortened lifespan; mutation of BCL3 is frequently associated with recurring translocations found in the neoplastic cells of patients with chronic lymphocytic leukemia, and has been implicated in cell cycle control (perhaps via apoptosis).
45C15C8.1C15C8.1n/achrV 12,735,091contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003073 (Orphan nuclear receptor, NURR type)
46T03F7.6T03F7.6n/achrV 11,295,604contains similarity to Interpro domain IPR001036 (Acriflavin resistance protein)
47ugt-20K08B4.4n/achrIV 6,082,263C. elegans UGT-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
48H14E04.3H14E04.3n/achrIII 2,385,751
49glb-9C28F5.2n/achrII 7,510,599glb-9 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
50srsx-35F53F8.2n/achrV 20,677,605C. elegans SRSX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)